Optimized the bonded thread force reduction
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drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 1878 CMakeLists.txt
-rw-r--r-- 136711 bonded.cpp
-rw-r--r-- 7216 bonded.h
-rw-r--r-- 23106 listed-forces.cpp
-rw-r--r-- 5889 listed-forces.h
-rw-r--r-- 2157 listed-internal.cpp
-rw-r--r-- 4758 listed-internal.h
-rw-r--r-- 17819 manage-threading.cpp
-rw-r--r-- 2931 manage-threading.h
-rw-r--r-- 20442 pairs.cpp
-rw-r--r-- 2749 pairs.h
-rw-r--r-- 15024 position-restraints.cpp
-rw-r--r-- 3723 position-restraints.h
-rw-r--r-- 18610 restcbt.cpp
-rw-r--r-- 11561 restcbt.h