Corrected value of electric conversion factor f in the manual
[gromacs/AngularHB.git] / src / config.h.cmakein
blob59993ea72a1a97a9515c8108d06474831b3adc69
1 /*
2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3  *
4  * Copyright (c) 2009,2010,2011,2012,2013,2014,2015, by the GROMACS development team, led by
5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
8  *
9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
12  * of the License, or (at your option) any later version.
13  *
14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
17  * Lesser General Public License for more details.
18  *
19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
20  * License along with GROMACS; if not, see
21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
23  *
24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
25  * consider that scientific software is very special. Version
26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
30  * official version at http://www.gromacs.org.
31  *
32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
34  */
35 /*! \libinternal \file
36  * \brief
37  * Include file for configuration macros from the build system.
38  *
39  * This header is not installed, so headers must not reference macros defined
40  * here.
41  *
42  * \inlibraryapi
43  */
44 #ifndef GMX_CONFIG_H
45 #define GMX_CONFIG_H
47 /* TODO: For now, disable Doxygen warnings from here */
48 /*! \cond */
50 /* IEEE754 floating-point format. Memory layout is defined by macros
51  * GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_BYTE_ORDER and GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_WORD_ORDER. 
52  */
53 #cmakedefine GMX_FLOAT_FORMAT_IEEE754
55 /* Work around broken calloc() */
56 #cmakedefine GMX_BROKEN_CALLOC
58 /* Do not optimize FFTW setups (not needed with SSE FFT kernels) */
59 #cmakedefine GMX_DISABLE_FFTW_MEASURE
61 /* Use Built-in FFTPACK FFT library */
62 #cmakedefine GMX_FFT_FFTPACK
64 /* Use FFTW3 FFT library */
65 #cmakedefine GMX_FFT_FFTW3
67 /* Use Intel MKL FFT library */
68 #cmakedefine GMX_FFT_MKL
70 /* Target platform is x86 or x86_64 */
71 #cmakedefine GMX_TARGET_X86
73 /* Target platform is BlueGene/Q */
74 #cmakedefine GMX_TARGET_BGQ
76 /** Define if we are building natively on Windows */
77 #cmakedefine GMX_NATIVE_WINDOWS
79 /** Define if we are building for Cygwin */
80 #cmakedefine GMX_CYGWIN
82 /** Define if we have sufficient C++11 support */
83 #cmakedefine GMX_CXX11
85 /* GCC bug in AVX maskload/maskstore arguments - worked around internally */
86 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_AVX_GCC_MASKLOAD_BUG
88 /* SSE2 was selected for SIMD instruction set level */
89 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_SSE2
91 /* SSE4.1 was selected as SIMD instructions */
92 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_SSE4_1
94 /* AVX 128-bit FMA was selected as SIMD instructions */
95 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_AVX_128_FMA
97 /* AVX 256-bit was selected as SIMD instructions */
98 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_AVX_256
100 /* AVX2 256-bit SIMD instruction set level was selected */
101 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_AVX2_256
103 /* MIC (Xeon Phi) SIMD instruction set level was selected */
104 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_MIC
106 /* AVX-512F foundation level instruction SIMD */
107 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_AVX_512F
109 /* AVX-512ER foundation level instruction SIMD */
110 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_AVX_512ER
112 /* 32-bit ARM NEON SIMD instruction set level was selected */
113 #cmakedefine GMX_SIMD_ARM_NEON
115 /* ARM (AArch64) NEON Advanced SIMD instruction set level was selected */
116 #cmakedefine GMX_SIMD_ARM_NEON_ASIMD
118 /* IBM QPX was selected as SIMD instructions (e.g. BlueGene/Q) */
119 #cmakedefine GMX_SIMD_IBM_QPX
121 /* IBM VMX was selected as SIMD instructions (Power 6 and later) */
122 #cmakedefine GMX_SIMD_IBM_VMX
124 /* IBM VSX was selected as SIMD instructions (Power 7 and later) */
125 #cmakedefine GMX_SIMD_IBM_VSX
127 /* Fujitsu Sparc64 HPC-ACE SIMD acceleration */
128 #cmakedefine GMX_SIMD_SPARC64_HPC_ACE
130 /* Reference SIMD implementation for testing */
131 #cmakedefine GMX_SIMD_REFERENCE
133 /* String for SIMD instruction choice (for writing to log files and stdout) */
134 #define GMX_SIMD_STRING "@GMX_SIMD@"
136 /* Calling convention string (if any) for routines with SIMD variable args */
137 #define gmx_simdcall @GMX_SIMD_CALLING_CONVENTION@
139 /* Target mantissa accuracy for SIMD single precision math */
140 #define GMX_SIMD_ACCURACY_BITS_SINGLE @GMX_SIMD_ACCURACY_BITS_SINGLE@
142 /* Target mantissa accuracy for SIMD double precision math */
143 #define GMX_SIMD_ACCURACY_BITS_DOUBLE @GMX_SIMD_ACCURACY_BITS_DOUBLE@
145 /* Integer byte order is big endian. */
146 #cmakedefine GMX_INTEGER_BIG_ENDIAN
148 /* Use our own instead of system XDR libraries */
149 #cmakedefine GMX_INTERNAL_XDR
151 /* Compile to use TNG library */
152 #cmakedefine GMX_USE_TNG
154 /* Add support for tracing using Extrae */
155 #cmakedefine HAVE_EXTRAE
157 /* Use MPI (with mpicc) for parallelization */
158 #cmakedefine GMX_LIB_MPI
160 /* Use threads_mpi for parallelization */
161 #cmakedefine GMX_THREAD_MPI
163 #if defined GMX_LIB_MPI || defined GMX_THREAD_MPI
164 /* Make a parallel version of GROMACS using message passing
165    (MPI or thread_mpi) */
166 #define GMX_MPI
167 #endif
169 /* MPI_IN_PLACE exists for collective operations */
170 #cmakedefine MPI_IN_PLACE_EXISTS
172 /* Use OpenMP multithreading */
173 #cmakedefine GMX_OPENMP
175 /* Can and should use nice(3) to set priority */
176 #cmakedefine GMX_USE_NICE
178 /* Maximum number of OpenMP threads supported */
179 #define GMX_OPENMP_MAX_THREADS @GMX_OPENMP_MAX_THREADS@
181 /* Use if can't rename checkpoints */
182 #cmakedefine GMX_NO_RENAME
184 /* Use (modified) Gamess-UK for QM-MM calculations */
185 #cmakedefine GMX_QMMM_GAMESS
187 /* Use (modified) Gaussian0x for QM-MM calculations */
188 #cmakedefine GMX_QMMM_GAUSSIAN
190 /* Use (modified) Mopac 7 for QM-MM calculations */
191 #cmakedefine GMX_QMMM_MOPAC
193 /* Use ORCA for QM-MM calculations */
194 #cmakedefine GMX_QMMM_ORCA
196 /* Use the GROMACS software 1/sqrt(x) */
197 #cmakedefine GMX_SOFTWARE_INVSQRT
199 /* Use sub-counters */
200 #cmakedefine GMX_CYCLE_SUBCOUNTERS
202 /* Compile with plugin support */
203 #cmakedefine GMX_USE_PLUGINS
205 /* Fallback path for VMD plug-ins */
206 #define GMX_VMD_PLUGIN_PATH "@GMX_VMD_PLUGIN_PATH@"
208 /* Define when pthreads are used */
209 #cmakedefine THREAD_PTHREADS
211 /* Define when Windows threads are used */
212 #cmakedefine THREAD_WINDOWS
214 /* Define native atomic operations are found */
215 #cmakedefine TMPI_ATOMICS
217 /* Define for busy wait option  */
218 /* See gmxpre-config.h.cmakein for explanation for the #ifdef */
219 #ifndef TMPI_WAIT_FOR_NO_ONE
220 #cmakedefine TMPI_WAIT_FOR_NO_ONE
221 #endif
223 /* Define for copy buffer option */
224 #cmakedefine TMPI_COPY_BUFFER
226 /* Define for tmpi warnings option */
227 #cmakedefine TMPI_WARNINGS
229 /* Define for profiling option */
230 #cmakedefine TMPI_PROFILE
232 /* Define for Linux pthread_setaffinity_np */
233 #cmakedefine HAVE_PTHREAD_SETAFFINITY
235 /* Define for X-Windows */
236 #cmakedefine GMX_X11
238 /* Enable x86 gcc inline assembly */
239 #cmakedefine GMX_X86_GCC_INLINE_ASM
241 /* Use GPU native acceleration */
242 #cmakedefine GMX_GPU
244 /* CUDA runtime API version (identical to CUDART_VERSION from cuda_runtime_api.h) */
245 #cmakedefine GMX_CUDA_VERSION @GMX_CUDA_VERSION@
247 /* Defined if texture objects are supported by CUDA */
248 #cmakedefine HAVE_CUDA_TEXOBJ_SUPPORT
250 /* Use NVML */
251 #cmakedefine HAVE_NVML
253 /* Use OpenCL acceleators */
254 #cmakedefine GMX_USE_OPENCL
256 /* Define relative path to OpenCL kernels */
257 #define OCL_INSTALL_DIR "@OCL_INSTALL_DIR@"
259 /* Define to 1 if fseeko (and presumably ftello) exists and is declared. */
260 #cmakedefine HAVE_FSEEKO
262 /* Define to 1 if _fseeki64 (and presumably _fseeki64) exists and is declared. */
263 #cmakedefine HAVE__FSEEKI64
265 /* Have io.h (windows)*/
266 #cmakedefine HAVE_IO_H
268 /* Define to 1 if you have the posix_memalign() function. */
269 #cmakedefine HAVE_POSIX_MEMALIGN
271 /* Define to 1 if you have the memalign() function. */
272 #cmakedefine HAVE_MEMALIGN
274 /* Define to 1 if you have the MSVC _aligned_malloc() function. */
275 #cmakedefine HAVE__ALIGNED_MALLOC
277 /* Define to 1 if you have the clock_gettime() function. */
278 #cmakedefine HAVE_CLOCK_GETTIME
280 /* Define to 1 if you have the gettimeofday() function. */
281 #cmakedefine HAVE_GETTIMEOFDAY
283 /* Define to 1 if you have the rdtscp instruction. */
284 #cmakedefine HAVE_RDTSCP
286 /* Define to 1 if you have the isfinite() function. */
287 #cmakedefine HAVE_ISFINITE
289 /* Define to 1 if you have the _isfinite() function. */
290 #cmakedefine HAVE__ISFINITE
292 /* Define to 1 if you have the _finite() function. */
293 #cmakedefine HAVE__FINITE
295 /* Define to 1 if you have the fsync() function. */
296 #cmakedefine HAVE_FSYNC
298 /* Define to 1 if you have the Windows _commit() function. */
299 #cmakedefine HAVE__COMMIT
301 /* Define to 1 if you have the fileno() function. */
302 #cmakedefine HAVE_FILENO
304 /* Define to 1 if you have the _fileno() function. */
305 #cmakedefine HAVE__FILENO
307 /* Define to 1 if you have the sigaction() function. */
308 #cmakedefine HAVE_SIGACTION
310 /* Define to 1 if you have the rsqrt() function. */
311 #cmakedefine HAVE_RSQRT
313 /* Define to 1 if you have the rsqrtf() function. */
314 #cmakedefine HAVE_RSQRTF
316 /* Define to 1 if you have the sqrtf() function. */
317 #cmakedefine HAVE_SQRTF
319 /* Define to 1 if yo have the <unistd.h> header file. */
320 #cmakedefine HAVE_UNISTD_H
322 /* Define to 1 if yo have the <pwd.h> header file. */
323 #cmakedefine HAVE_PWD_H
325 /* Define to 1 if yo have the <dirent.h> header file. */
326 #cmakedefine HAVE_DIRENT_H
328 /* Define to 1 if you have the <sys/time.h> header file. */
329 #cmakedefine HAVE_SYS_TIME_H
331 /* Define to 1 if you have the <x86intrin.h> header file */
332 #cmakedefine HAVE_X86INTRIN_H
334 /* Define to 1 if you have the <intrin.h> header file */
335 #cmakedefine HAVE_INTRIN_H
337 /* Define to 1 if you have the <sched.h> header */
338 #cmakedefine HAVE_SCHED_H
340 /* Define to 1 if you have the POSIX <regex.h> header file. */
341 #cmakedefine HAVE_POSIX_REGEX
343 /* Define to 1 if you have the C++11 <regex> header file. */
344 #cmakedefine HAVE_CXX11_REGEX
346 /* Define to 1 if you have the sysconf() function */
347 #cmakedefine HAVE_SYSCONF
349 /* Define to 1 if you have the all the affinity functions in sched.h */
350 #cmakedefine HAVE_SCHED_AFFINITY
352 /* Bytes in IEEE fp word are in big-endian order if set, little-endian if not.
353    Only relevant when FLOAT_FORMAT_IEEE754 is defined. */
354 #cmakedefine GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_BYTE_ORDER
356 /* The two words in a double precision variable are in b ig-endian order if
357    set, little-endian if not. Do NOT assume this is the same as the byte
358    order! Only relevant when FLOAT_FORMAT_IEEE754 is defined. */
359 #cmakedefine GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_WORD_ORDER
361 /* Define if SIGUSR1 is present */
362 #cmakedefine HAVE_SIGUSR1
364 /* Enable gromacs quotes */
365 #cmakedefine GMX_COOL_QUOTES
367 /* default name mangling maybe wrong on exotic plattforms */
368 #define F77_FUNC(name,NAME) name ## _
370 /* Define if we have pipes */
371 #cmakedefine HAVE_PIPES
373 /* Define if we have feenableexcept */
374 #cmakedefine HAVE_FEENABLEEXCEPT
376 /* Define if we have zlib */
377 #cmakedefine HAVE_ZLIB
379 /*! \endcond */
381 #endif