src/config.h.cmakein

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2009,2010,2011,2012,2013, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \libinternal \file
  36  * \brief
  37  * Include file for configuration macros from the build system.
  38  *
  39  * This header is not installed, so headers must not reference macros defined
  40  * here.
  41  *
  42  * \inlibraryapi
  43  */
  44 #include "gromacs/utility/gmx_header_config.h"
  45
  46 /* TODO: For now, disable Doxygen warnings from here */
  47 /*! \cond */
  48
  49 /* Disable warnings about double-to-float conversion accuracy loss on MSVC */
  50 #ifdef _MSC_VER
  51 #pragma warning (disable : 4305)
  52 #pragma warning (disable : 4244)
  53 #pragma warning (disable : 4101)
  54 #pragma warning (disable : 4996)
  55 #pragma warning (disable : 4267)
  56 #pragma warning (disable : 4090)
  57 #endif
  58
  59 /* Version number of package (translate from cmake to autoconf macro name) */
  60 #define VERSION  "@PROJECT_VERSION@"
  61
  62 /* Use extra version information generated with git */
  63 #cmakedefine GMX_GIT_VERSION_INFO
  64
  65 /* Default location of data files */
  66 #define GMXLIB_SEARCH_DIR "@GMXLIB_SEARCH_DIR@"
  67
  68 /* Default location of data files */
  69 #define GMXLIB_FALLBACK "@GMXLIB_FALLBACK@"
  70
  71 /* Binary suffix for the created binaries */
  72 #define GMX_BINARY_SUFFIX "@GMX_BINARY_SUFFIX@"
  73
  74 /* Source directory for the build */
  75 #cmakedefine CMAKE_SOURCE_DIR "@CMAKE_SOURCE_DIR@"
  76
  77 /* Binary directory for the build */
  78 #cmakedefine CMAKE_BINARY_DIR "@CMAKE_BINARY_DIR@"
  79
  80 /* Turn off water-water neighborlist optimization only - not used right now */
  81 #cmakedefine DISABLE_WATERWATER_NLIST
  82
  83 /* Turn off all water neighborlist optimization - not used right now */
  84 #cmakedefine DISABLE_WATER_NLIST
  85
  86 /* IEEE754 floating-point format. Memory layout is defined by macros
  87  * GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_BYTE_ORDER and GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_WORD_ORDER.
  88  */
  89 #cmakedefine GMX_FLOAT_FORMAT_IEEE754
  90
  91 /* Work around broken calloc() */
  92 #cmakedefine GMX_BROKEN_CALLOC
  93
  94 /* Do not optimize FFTW setups (not needed with SSE FFT kernels) */
  95 #cmakedefine GMX_DISABLE_FFTW_MEASURE
  96
  97 /* Use Built-in FFTPACK FFT library */
  98 #cmakedefine GMX_FFT_FFTPACK
  99
 100 /* Use FFTW3 FFT library */
 101 #cmakedefine GMX_FFT_FFTW3
 102
 103 /* Use Intel MKL FFT library */
 104 #cmakedefine GMX_FFT_MKL
 105
 106 /* Target platform is x86 or x86_64 */
 107 #cmakedefine GMX_TARGET_X86
 108
 109 /* Target platform is BlueGene/Q */
 110 #cmakedefine GMX_TARGET_BGQ
 111
 112 /* SSE2 instructions available */
 113 #cmakedefine GMX_X86_SSE2
 114
 115 /* SSE4.1 instructions available */
 116 #cmakedefine GMX_X86_SSE4_1
 117
 118 /* AVX 128-bit FMA instructions available */
 119 #cmakedefine GMX_X86_AVX_128_FMA
 120
 121 /* AVX 256-bit instructions available */
 122 #cmakedefine GMX_X86_AVX_256
 123
 124 /* GCC bug in AVX maskload/maskstore arguments - worked around internally */
 125 #cmakedefine GMX_X86_AVX_GCC_MASKLOAD_BUG
 126
 127 /* SSE2 was selected as CPU acceleration level */
 128 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_SSE2
 129
 130 /* SSE4.1 was selected as CPU acceleration level */
 131 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_SSE4_1
 132
 133 /* AVX 128-bit FMA was selected as CPU acceleration level */
 134 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_AVX_128_FMA
 135
 136 /* AVX 256-bit was selected as CPU acceleration level */
 137 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_X86_AVX_256
 138
 139 /* IBM QPX was selected as CPU acceleration type (e.g. BlueGene/Q) */
 140 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_IBM_QPX
 141
 142 /* Fujitsu Sparc64 HPC-ACE SIMD acceleration */
 143 #cmakedefine GMX_CPU_ACCELERATION_SPARC64_HPC_ACE
 144
 145 /* String for CPU acceleration choice (for writing to log files and stdout) */
 146 #define GMX_CPU_ACCELERATION_STRING "@GMX_CPU_ACCELERATION@"
 147
 148 /* Integer byte order is big endian. */
 149 #cmakedefine GMX_INTEGER_BIG_ENDIAN
 150
 151 /* Use our own instead of system XDR libraries */
 152 #cmakedefine GMX_INTERNAL_XDR
 153
 154 /* Use MPI (with mpicc) for parallelization */
 155 #cmakedefine GMX_LIB_MPI
 156
 157 /* MPI_IN_PLACE exists for collective operations */
 158 #cmakedefine MPI_IN_PLACE_EXISTS
 159
 160 /* Make a parallel version of GROMACS using message passing
 161    (MPI or thread_mpi) */
 162 #cmakedefine GMX_MPI
 163
 164 /* Use threads_mpi for parallelization */
 165 #cmakedefine GMX_THREAD_MPI
 166
 167 /* Use OpenMP multithreading */
 168 #cmakedefine GMX_OPENMP
 169
 170 /* Ignore calls to nice(3) */
 171 #cmakedefine GMX_NO_NICE
 172
 173 /* Use if can't rename checkpoints */
 174 #cmakedefine GMX_NO_RENAME
 175
 176 /* Ignore calls to system(3) */
 177 #cmakedefine GMX_NO_SYSTEM
 178
 179 /* Use (modified) Gamess-UK for QM-MM calculations */
 180 #cmakedefine GMX_QMMM_GAMESS
 181
 182 /* Use (modified) Gaussian0x for QM-MM calculations */
 183 #cmakedefine GMX_QMMM_GAUSSIAN
 184
 185 /* Use (modified) Mopac 7 for QM-MM calculations */
 186 #cmakedefine GMX_QMMM_MOPAC
 187
 188 /* Use ORCA for QM-MM calculations */
 189 #cmakedefine GMX_QMMM_ORCA
 190
 191 /* Use the GROMACS software 1/sqrt(x) */
 192 #cmakedefine GMX_SOFTWARE_INVSQRT
 193
 194 /* Use sub-counters */
 195 #cmakedefine GMX_CYCLE_SUBCOUNTERS
 196
 197 /* Compile with plugin support */
 198 #cmakedefine GMX_USE_PLUGINS
 199
 200 /* Fallback path for VMD plug-ins */
 201 #define GMX_VMD_PLUGIN_PATH "@GMX_VMD_PLUGIN_PATH@"
 202
 203 /* Define when pthreads are used */
 204 #cmakedefine THREAD_PTHREADS
 205
 206 /* Define when Windows threads are used */
 207 #cmakedefine THREAD_WINDOWS
 208
 209 /* Define native atomic operations are found */
 210 #cmakedefine TMPI_ATOMICS
 211
 212 /* Define for busy wait option  */
 213 #cmakedefine TMPI_WAIT_FOR_NO_ONE
 214
 215 /* Define for copy buffer option */
 216 #cmakedefine TMPI_COPY_BUFFER
 217
 218 /* Define for tmpi warnings option */
 219 #cmakedefine TMPI_WARNINGS
 220
 221 /* Define for profiling option */
 222 #cmakedefine TMPI_PROFILE
 223
 224 /* Define for Linux pthread_setaffinity_np */
 225 #cmakedefine HAVE_PTHREAD_SETAFFINITY
 226
 227 /* Define for X-Windows */
 228 #cmakedefine GMX_X11
 229
 230 /* Enable x86 gcc inline assembly */
 231 #cmakedefine GMX_X86_GCC_INLINE_ASM
 232
 233 /* Use GPU native acceleration */
 234 #cmakedefine GMX_GPU
 235
 236 /* Define to 1 if fseeko (and presumably ftello) exists and is declared. */
 237 #cmakedefine HAVE_FSEEKO
 238
 239 /* Define to 1 if _fseeki64 (and presumably _fseeki64) exists and is declared. */
 240 #cmakedefine HAVE__FSEEKI64
 241
 242 /* Define to 1 if you have the gsl library (-lgsl). */
 243 #cmakedefine HAVE_LIBGSL
 244
 245 /* Have io.h (windows)*/
 246 #cmakedefine HAVE_IO_H
 247
 248 /* Define to 1 if you have the posix_memalign() function. */
 249 #cmakedefine HAVE_POSIX_MEMALIGN
 250
 251 /* Define to 1 if you have the memalign() function. */
 252 #cmakedefine HAVE_MEMALIGN
 253
 254 /* Define to 1 if you have the MSVC _aligned_malloc() function. */
 255 #cmakedefine HAVE__ALIGNED_MALLOC
 256
 257 /* Define to 1 if you have the clock_gettime() function. */
 258 #cmakedefine HAVE_CLOCK_GETTIME
 259
 260 /* Define to 1 if you have the gettimeofday() function. */
 261 #cmakedefine HAVE_GETTIMEOFDAY
 262
 263 /* Define to 1 if you have the rdtscp instruction. */
 264 #cmakedefine HAVE_RDTSCP
 265
 266 /* Define to 1 if you have the isfinite() function. */
 267 #cmakedefine HAVE_ISFINITE
 268
 269 /* Define to 1 if you have the _isfinite() function. */
 270 #cmakedefine HAVE__ISFINITE
 271
 272 /* Define to 1 if you have the _finite() function. */
 273 #cmakedefine HAVE__FINITE
 274
 275 /* Define to 1 if you have the fsync() function. */
 276 #cmakedefine HAVE_FSYNC
 277
 278 /* Define to 1 if you have the Windows _commit() function. */
 279 #cmakedefine HAVE__COMMIT
 280
 281 /* Define to 1 if you have the fileno() function. */
 282 #cmakedefine HAVE_FILENO
 283
 284 /* Define to 1 if you have the _fileno() function. */
 285 #cmakedefine HAVE__FILENO
 286
 287 /* Define to 1 if you have the sigaction() function. */
 288 #cmakedefine HAVE_SIGACTION
 289
 290 /* Define to 1 if you have the rsqrt() function. */
 291 #cmakedefine HAVE_RSQRT
 292
 293 /* Define to 1 if you have the rsqrtf() function. */
 294 #cmakedefine HAVE_RSQRTF
 295
 296 /* Define to 1 if you have the sqrtf() function. */
 297 #cmakedefine HAVE_SQRTF
 298
 299 /* Define to 1 if yo have the <unistd.h> header file. */
 300 #cmakedefine HAVE_UNISTD_H
 301
 302 /* Define to 1 if yo have the <pwd.h> header file. */
 303 #cmakedefine HAVE_PWD_H
 304
 305 /* Define to 1 if yo have the <dirent.h> header file. */
 306 #cmakedefine HAVE_DIRENT_H
 307
 308 /* Define to 1 if you have the <sys/time.h> header file. */
 309 #cmakedefine HAVE_SYS_TIME_H
 310
 311 /* Define to 1 if you have the <x86intrin.h> header file */
 312 #cmakedefine HAVE_X86INTRIN_H
 313
 314 /* Define to 1 if you have the <intrin.h> header file */
 315 #cmakedefine HAVE_INTRIN_H
 316
 317 /* Define to 1 if you have the <sched.h> header */
 318 #cmakedefine HAVE_SCHED_H
 319
 320 /* Define to 1 if you have the POSIX <regex.h> header file. */
 321 #cmakedefine HAVE_POSIX_REGEX
 322
 323 /* Define to 1 if you have the C++11 <regex> header file. */
 324 #cmakedefine HAVE_CXX11_REGEX
 325
 326 /* Define to 1 if you have the sysconf() function */
 327 #cmakedefine HAVE_SYSCONF
 328
 329 /* Define to 1 if you have the sched_getaffinity() function */
 330 #cmakedefine HAVE_SCHED_GETAFFINITY
 331
 332 /* Define to 1 if you have the sched_setaffinity() function */
 333 #cmakedefine HAVE_SCHED_SETAFFINITY
 334
 335 /* Bytes in IEEE fp word are in big-endian order if set, little-endian if not.
 336    Only relevant when FLOAT_FORMAT_IEEE754 is defined. */
 337 #cmakedefine GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_BYTE_ORDER
 338
 339 /* The two words in a double precision variable are in b ig-endian order if
 340    set, little-endian if not. Do NOT assume this is the same as the byte
 341    order! Only relevant when FLOAT_FORMAT_IEEE754 is defined. */
 342 #cmakedefine GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_WORD_ORDER
 343
 344 /* Define if SIGUSR1 is present */
 345 #cmakedefine HAVE_SIGUSR1
 346
 347 /* Define to 1 to make fseeko visible on some hosts (e.g. glibc 2.2). */
 348 #cmakedefine _LARGEFILE_SOURCE
 349
 350 /* Define for large files, on AIX-style hosts. */
 351 #cmakedefine _LARGE_FILES
 352
 353 /* Some systems requires this to be set to 64 for large file support */
 354 #cmakedefine _FILE_OFFSET_BITS @_FILE_OFFSET_BITS@
 355
 356 /* Define to __inline__ or __inline if that is what the C compiler
 357    calls it, or to nothing if inline is not supported under any name.
 358    Please do NOT remove the gmx_inline keyword from here. The classical
 359    C++ inline keyword is merely a recommendation to the compiler, and
 360    many compilers support stronger alternatives (e.g. __forceinline)
 361    that we might want to use. */
 362 #define gmx_inline ${INLINE_KEYWORD}
 363 #ifndef __cplusplus
 364 #define inline ${INLINE_KEYWORD}
 365 #endif
 366
 367 /* Define to __restrict__ or __restrict if that is what the C compiler
 368    calls it, unless we are on C99 when it is simply called restrict.
 369    Since restrict is a reserved key word in C99 we are not allowed to
 370    redefine the word itself, so call this gmx_restrict to avoid having
 371    to identify the language standard level. If it is not supported, it
 372    is still defined to an empty string here. */
 373 #define gmx_restrict ${RESTRICT_KEYWORD}
 374 /* Build special-purpose mdrun library */
 375 #cmakedefine GMX_FAHCORE
 376
 377 /* Enable gromacs quotes */
 378 #cmakedefine GMX_COOL_QUOTES
 379
 380 #ifdef GMX_FAHCORE
 381 #define FULLINDIRECT 1
 382 #define USE_FAH_XDR  1
 383 #include "swindirect.h"
 384 #endif
 385
 386 /* default name mangling maybe wrong on exotic plattforms */
 387 #define F77_FUNC(name,NAME) name ## _
 388
 389 /* Define if we have pipes */
 390 #cmakedefine HAVE_PIPES
 391
 392 /*! \endcond */