share/top/oplsaa.ff/gbsa.itp

   1 [ implicit_genborn_params ]
   2
   3 ; atype    sar    st    pi       gbr      hct
   4 opls_102   0.16   1     1.215    0.1625   0.79 ; N (RNH3+)
   5 opls_135   0.2    1     0.880    0.190    0.72 ; CB
   6 opls_136   0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CB
   7 opls_137   0.18   1     1.276    0.190    0.72 ; CB
   8 opls_140   0.1    1     1        0.125    0.85 ; HA
   9 opls_145   0.18   1     1.073    0.1875   0.72 ; CG
  10 opls_146   0.1    1     1        0.115    0.85 ; HD2
  11 opls_149   0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CB
  12 opls_154   0.152  1     1.080    0.1535   0.85 ; OG
  13 opls_155   0.1    1     1        0.105    0.85 ; HG
  14 opls_157   0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CB
  15 opls_158   0.18   1     1.276    0.190    0.72 ; CB
  16 opls_166   0.18   1     1.073    0.1875   0.72 ; CZ
  17 opls_167   0.15   1     1.080    0.1535   0.85 ; OH
  18 opls_168   0.1    1     1        0.105    0.85 ; HH
  19 opls_200   0.18   1     1.121    0.1775   0.96 ; SG
  20 opls_202   0.18   1     1.121    0.1775   0.96 ; SD
  21 opls_203   0.18   1     1.121    0.1775   0.96 ; S
  22 opls_204   0.1    1     1        0.125    0.85 ; HG
  23 opls_206   0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CB
  24 opls_209   0.2    1     0.880    0.190    0.72 ; CE
  25 opls_210   0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CG
  26 opls_214   0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CB
  27 opls_223B  0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CA
  28 opls_224B  0.18   1     1.276    0.190    0.72 ; CA
  29 opls_235   0.172  1     1.554    0.1875   0.72 ; C
  30 opls_236   0.15   1     0.926    0.148    0.85 ; O
  31 opls_237   0.16   1     1.215    0.17063  0.79 ; ND2
  32 opls_238   0.155  1     1.028    0.17063  0.79 ; N
  33 opls_239   0.155  1     1.028    0.17063  0.79 ; N
  34 opls_240   0.1    1     1        0.115    0.85 ; HD21
  35 opls_241   0.1    1     1        0.115    0.85 ; H
  36 opls_245   0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CD
  37 opls_246   0.18   1     1.276    0.190    0.72 ; CA
  38 opls_271   0.172  1     1.554    0.1875   0.72 ; CG
  39 opls_272   0.17   1     0.922    0.148    0.85 ; OD1
  40 opls_274   0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CB
  41 opls_283   0.18   1     1.276    0.190    0.72 ; CA on C-terminal ALA,CYS,SER,THR,HIS,ASP,ASN
  42 opls_284   0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CA on C-terminal GLY
  43 opls_285   0.18   1     1.276    0.190    0.72 ; CA on C-terminal PRO
  44 opls_287   0.16   1     1.215    0.1625   0.79 ; NZ
  45 opls_290   0.1    1     1        0.115    0.85 ; HZ1
  46 opls_292   0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CE
  47 opls_292B  0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CA in GLY-NH3+ N-term.
  48 opls_293B  0.18   1     1.276    0.190    0.72 ; CA in NH3+ N-term, All AA except GLY & PRO
  49 opls_295   0.18   1     1.276    0.190    0.72 ; AA C-alpha on N-term PRO
  50 opls_296   0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; AA:C-delta in N-term PRO NH2+
  51 opls_300   0.16   1     1.215    0.17063  0.79 ; NH1
  52 opls_301   0.1    1     1        0.115    0.85 ; HH11
  53 opls_302   0.172  0.012 1.554    0.1875   0.72 ; CZ (why 0.012 in Charmm?)
  54 opls_303   0.155  1     1.028    0.17063  0.79 ; NE
  55 opls_304   0.1    1     1        0.115    0.85 ; HE
  56 opls_307   0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CD
  57 opls_308   0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CG
  58 opls_309   0.16   1     1.215    0.1625   0.79 ; N (R2NH2+), N-terminal PRO NH2+
  59 opls_310   0.1    1     1        0.115    0.85 ; H (R2NH2+)
  60 opls_500   0.172  0.012 1.554    0.1875   0.72 ; CG
  61 opls_501   0.172  0.012 1.554    0.1875   0.72 ; CD2
  62 opls_502   0.172  0.012 1.554    0.1875   0.72 ; CE2
  63 opls_503   0.155  1     1.028    0.17063  0.79 ; NE2
  64 opls_504   0.1    1     1        0.125    0.85 ; HE2
  65 opls_505   0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CB
  66 opls_506   0.18   1     1.073    0.1875   0.72 ; CE1
  67 opls_507   0.172  0.012 1.554    0.1875   0.72 ; CG
  68 opls_508   0.18   1     1.073    0.1875   0.72 ; CD2
  69 opls_509   0.18   1     1.073    0.1875   0.72 ; CE1
  70 opls_510   0.172  1     1.554    0.1875   0.72 ; CG
  71 opls_511   0.155  1     1.028    0.17063  0.79 ; ND1
  72 opls_512   0.155  1     1.028    0.17063  0.79 ; ND1
  73 opls_513   0.1    1     1        0.115    0.85 ; HD1
  74 opls_514   0.18   1     1.073    0.1875   0.72 ; CD1
  75 opls_900   0.16   1     1.215    0.1625   0.79 ; NZ
  76 opls_906   0.19   1     1.045    0.190    0.72 ; CE
  77 opls_909   0.1    1     1        0.115    0.85 ; HZ1
  78 opls_911   0.1    1     1        0.125    0.85 ; HE1
  79
  80 ; masscenters for vsites do not have gbsa parameters
  81
  82 MNH2      0       0     0        0        0
  83 MNH3      0       0     0        0        0
  84 MCH3A     0       0     0        0        0
  85 MCH3B     0       0     0        0        0