Correct nrdf for 1D/2D systems
[gromacs/AngularHB.git] / src / contrib / scripts / ffamber.hdb
blob0aaf4cc39f1c020485076cfa32b818bdf8feb8b0
1 ALA     3
2         1       1       N       -C      CA
3         1       5       CA      N       C       CB
4         3       4       CB      CA      N
5 GLY     2
6         1       1       N       -C      CA
7         2       6       CA      C       N
8 SER     4
9         1       1       N       -C      CA
10         1       5       CA      N       C       CB
11         2       6       CB      OG      CA
12         1       2       OG      CB      CA
13 THR     5
14         1       1       N       -C      CA
15         1       5       CA      N       C       CB
16         1       5       CB      CA      OG1     CG2
17         3       4       CG2     CB      CA
18         1       2       OG1     CB      CA
19 LEU     6
20         1       1       N       -C      CA
21         1       5       CA      N       C       CB
22         2       6       CB      CG      CA
23         1       5       CG      CB      CD2     CD1
24         3       4       CD1     CG      CB
25         3       4       CD2     CG      CB
26 ILE     6
27         1       1       N       -C      CA
28         1       5       CA      N       C       CB
29         1       5       CB      CA      CG1     CG2
30         3       4       CG2     CB      CA
31         2       6       CG1     CD1     CB
32         3       4       CD1     CG1     CB
33 VAL     5
34         1       1       N       -C      CA
35         1       5       CA      N       C       CB
36         1       5       CB      CA      CG2     CG1
37         3       4       CG1     CB      CA
38         3       4       CG2     CB      CA
39 ASN     4
40         1       1       N       -C      CA
41         1       5       CA      N       C       CB
42         2       6       CB      CG      CA
43         2       3       ND2     CG      CB
44 GLN     5
45         1       1       N       -C      CA
46         1       5       CA      N       C       CB
47         2       6       CB      CG      CA
48         2       6       CG      CD      CB
49         2       3       NE2     CD      CG
50 ARG     8
51         1       1       N       -C      CA
52         1       5       CA      N       C       CB
53         2       6       CB      CG      CA
54         2       6       CG      CD      CB
55         2       6       CD      NE      CG
56         1       1       NE      CD      CZ
57         2       3       NH1     CZ      NE
58         2       3       NH2     CZ      NE
59 HID     6
60         1       1       N       -C      CA
61         1       5       CA      N       C       CB
62         2       6       CB      CG      CA
63         1       1       ND1     CG      CE1
64         1       1       CE1     ND1     NE2
65         1       1       CD2     NE2     CG
66 HIE     6
67         1       1       N       -C      CA
68         1       5       CA      N       C       CB
69         2       6       CB      CG      CA
70         1       1       CE1     ND1     NE2
71         1       1       NE2     CE1     CD2
72         1       1       CD2     NE2     CG
73 HIP     7
74         1       1       N       -C      CA
75         1       5       CA      N       C       CB
76         2       6       CB      CG      CA
77         1       1       ND1     CG      CE1
78         1       1       CE1     ND1     NE2
79         1       1       NE2     CE1     CD2
80         1       1       CD2     NE2     CG
81 TRP     9
82         1       1       N       -C      CA
83         1       5       CA      N       C       CB
84         2       6       CB      CG      CA
85         1       1       CD1     CG      NE1
86         1       1       NE1     CD1     CE2
87         1       1       CZ2     CE2     CH2
88         1       1       CH2     CZ2     CZ3
89         1       1       CZ3     CH2     CE3
90         1       1       CE3     CZ3     CD2
91 PHE     8
92         1       1       N       -C      CA
93         1       5       CA      N       C       CB
94         2       6       CB      CG      CA
95         1       1       CD1     CG      CE1
96         1       1       CE1     CD1     CZ
97         1       1       CZ      CE1     CE2
98         1       1       CE2     CZ      CD2
99         1       1       CD2     CE2     CG
100 TYR     8
101         1       1       N       -C      CA
102         1       5       CA      N       C       CB
103         2       6       CB      CG      CA
104         1       1       CD1     CG      CE1
105         1       1       CE1     CD1     CZ
106         1       2       OH      CZ      CE1
107         1       1       CE2     CZ      CD2
108         1       1       CD2     CE2     CG
109 GLU     4
110         1       1       N       -C      CA
111         1       5       CA      N       C       CB
112         2       6       CB      CG      CA
113         2       6       CG      CD      CB
114 ASP     3
115         1       1       N       -C      CA
116         1       5       CA      N       C       CB
117         2       6       CB      CG      CA
118 LYS     7
119         1       1       N       -C      CA
120         1       5       CA      N       C       CB
121         2       6       CB      CG      CA
122         2       6       CG      CD      CB
123         2       6       CD      CE      CG
124         2       6       CE      NZ      CD
125         3       4       NZ      CE      CD
126 LYN     7
127         1       1       N       -C      CA
128         1       5       CA      N       C       CB
129         2       6       CB      CG      CA
130         2       6       CG      CD      CB
131         2       6       CD      CE      CG
132         2       6       CE      NZ      CD
133         2       4       NZ      CE      CD
134 PRO     4
135         2       6       CD      CG      N
136         2       6       CG      CB      CD
137         2       6       CB      CA      CG
138         1       5       CA      N       O       C
139 CYS     4
140         1       1       N       -C      CA
141         1       5       CA      N       C       CB
142         2       6       CB      SG      CA
143         1       2       SG      CB      CA
144 CYM     3
145         1       1       N       -C      CA
146         1       5       CA      N       C       CB
147         2       6       CB      SG      CA
148 CYX     3
149         1       1       N       -C      CA
150         1       5       CA      N       C       CB
151         2       6       CB      SG      CA
152 MET     5
153         1       1       N       -C      CA
154         1       5       CA      N       C       CB
155         2       6       CB      CG      CA
156         2       6       CG      SD      CB
157         3       4       CE      SD      CG
158 ACE     1
159         3       4       CH3     C       O
160 NME     2
161         1       1       N       -C      CH3
162         3       4       CH3     N       -C
163 NHE     1
164         2       3       N       -C      -N
165 HOH     1
166         2       7       O
167 ASH     4
168         1       1       N       -C      CA
169         1       5       CA      N       C       CB
170         2       6       CB      CG      CA
171         1       2       OD2     CG      CB
172 GLH     5
173         1       1       N       -C      CA
174         1       5       CA      N       C       CB
175         2       6       CB      CG      CA
176         2       6       CG      CD      CB
177         1       2       OE2     CD      CG
178 CIP     0
179 CIM     0
180 ALA-C   3
181         1       1       N       -C      CA
182         1       5       CA      N       C       CB
183         3       4       CB      CA      N
184 GLY-C   2
185         1       1       N       -C      CA
186         2       6       CA      C       N
187 SER-C   4
188         1       1       N       -C      CA
189         1       5       CA      N       C       CB
190         2       6       CB      OG      CA
191         1       2       OG      CB      CA
192 THR-C   5
193         1       1       N       -C      CA
194         1       5       CA      N       C       CB
195         1       5       CB      CA      OG1     CG2
196         3       4       CG2     CB      CA
197         1       2       OG1     CB      CA
198 LEU-C   6
199         1       1       N       -C      CA
200         1       5       CA      N       C       CB
201         2       6       CB      CG      CA
202         1       5       CG      CB      CD2     CD1
203         3       4       CD1     CG      CB
204         3       4       CD2     CG      CB
205 ILE-C   6
206         1       1       N       -C      CA
207         1       5       CA      N       C       CB
208         1       5       CB      CA      CG1     CG2
209         3       4       CG2     CB      CA
210         2       6       CG1     CD1     CB
211         3       4       CD1     CG1     CB
212 VAL-C   5
213         1       1       N       -C      CA
214         1       5       CA      N       C       CB
215         1       5       CB      CA      CG2     CG1
216         3       4       CG1     CB      CA
217         3       4       CG2     CB      CA
218 ASN-C   4
219         1       1       N       -C      CA
220         1       5       CA      N       C       CB
221         2       6       CB      CG      CA
222         2       3       ND2     CG      CB
223 GLN-C   5
224         1       1       N       -C      CA
225         1       5       CA      N       C       CB
226         2       6       CB      CG      CA
227         2       6       CG      CD      CB
228         2       3       NE2     CD      CG
229 ARG-C   8
230         1       1       N       -C      CA
231         1       5       CA      N       C       CB
232         2       6       CB      CG      CA
233         2       6       CG      CD      CB
234         2       6       CD      NE      CG
235         1       1       NE      CD      CZ
236         2       3       NH1     CZ      NE
237         2       3       NH2     CZ      NE
238 HID-C   6
239         1       1       N       -C      CA
240         1       5       CA      N       C       CB
241         2       6       CB      CG      CA
242         1       1       ND1     CG      CE1
243         1       1       CE1     ND1     NE2
244         1       1       CD2     NE2     CG
245 HIE-C   6
246         1       1       N       -C      CA
247         1       5       CA      N       C       CB
248         2       6       CB      CG      CA
249         1       1       CE1     ND1     NE2
250         1       1       NE2     CE1     CD2
251         1       1       CD2     NE2     CG
252 HIP-C   7
253         1       1       N       -C      CA
254         1       5       CA      N       C       CB
255         2       6       CB      CG      CA
256         1       1       ND1     CG      CE1
257         1       1       CE1     ND1     NE2
258         1       1       NE2     CE1     CD2
259         1       1       CD2     NE2     CG
260 TRP-C   9
261         1       1       N       -C      CA
262         1       5       CA      N       C       CB
263         2       6       CB      CG      CA
264         1       1       CD1     CG      NE1
265         1       1       NE1     CD1     CE2
266         1       1       CZ2     CE2     CH2
267         1       1       CH2     CZ2     CZ3
268         1       1       CZ3     CH2     CE3
269         1       1       CE3     CZ3     CD2
270 PHE-C   8
271         1       1       N       -C      CA
272         1       5       CA      N       C       CB
273         2       6       CB      CG      CA
274         1       1       CD1     CG      CE1
275         1       1       CE1     CD1     CZ
276         1       1       CZ      CE1     CE2
277         1       1       CE2     CZ      CD2
278         1       1       CD2     CE2     CG
279 TYR-C   8
280         1       1       N       -C      CA
281         1       5       CA      N       C       CB
282         2       6       CB      CG      CA
283         1       1       CD1     CG      CE1
284         1       1       CE1     CD1     CZ
285         1       2       OH      CZ      CE1
286         1       1       CE2     CZ      CD2
287         1       1       CD2     CE2     CG
288 GLU-C   4
289         1       1       N       -C      CA
290         1       5       CA      N       C       CB
291         2       6       CB      CG      CA
292         2       6       CG      CD      CB
293 ASP-C   3
294         1       1       N       -C      CA
295         1       5       CA      N       C       CB
296         2       6       CB      CG      CA
297 LYS-C   7
298         1       1       N       -C      CA
299         1       5       CA      N       C       CB
300         2       6       CB      CG      CA
301         2       6       CG      CD      CB
302         2       6       CD      CE      CG
303         2       6       CE      NZ      CD
304         3       4       NZ      CE      CD
305 PRO-C   4
306         2       6       CD      CG      N
307         2       6       CG      CB      CD
308         2       6       CB      CA      CG
309         1       5       CA      N       O       C
310 CYS-C   4
311         1       1       N       -C      CA
312         1       5       CA      N       C       CB
313         2       6       CB      SG      CA
314         1       2       SG      CB      CA
315 CYX-C   3
316         1       1       N       -C      CA
317         1       5       CA      N       C       CB
318         2       6       CB      SG      CA
319 MET-C   5
320         1       1       N       -C      CA
321         1       5       CA      N       C       CB
322         2       6       CB      CG      CA
323         2       6       CG      SD      CB
324         3       4       CE      SD      CG
325 ALA-N   3
326         3       4       N       -       -
327         1       5       CA      N       C       CB
328         3       4       CB      CA      N
329 GLY-N   2
330         3       4       N       -       -
331         2       6       CA      C       N
332 SER-N   4
333         3       4       N       -       -
334         1       5       CA      N       C       CB
335         2       6       CB      OG      CA
336         1       2       OG      CB      CA
337 THR-N   5
338         3       4       N       -       -
339         1       5       CA      N       C       CB
340         1       5       CB      CA      OG1     CG2
341         3       4       CG2     CB      CA
342         1       2       OG1     CB      CA
343 LEU-N   6
344         3       4       N       -       -
345         1       5       CA      N       C       CB
346         2       6       CB      CG      CA
347         1       5       CG      CB      CD2     CD1
348         3       4       CD1     CG      CB
349         3       4       CD2     CG      CB
350 ILE-N   6
351         3       4       N       -       -
352         1       5       CA      N       C       CB
353         1       5       CB      CA      CG1     CG2
354         3       4       CG2     CB      CA
355         2       6       CG1     CD1     CB
356         3       4       CD1     CG1     CB
357 VAL-N   5
358         3       4       N       -       -
359         1       5       CA      N       C       CB
360         1       5       CB      CA      CG2     CG1
361         3       4       CG1     CB      CA
362         3       4       CG2     CB      CA
363 ASN-N   4
364         3       4       N       -       -
365         1       5       CA      N       C       CB
366         2       6       CB      CG      CA
367         2       3       ND2     CG      CB
368 GLN-N   5
369         3       4       N       -       -
370         1       5       CA      N       C       CB
371         2       6       CB      CG      CA
372         2       6       CG      CD      CB
373         2       3       NE2     CD      CG
374 ARG-N   8
375         3       4       N       -       -
376         1       5       CA      N       C       CB
377         2       6       CB      CG      CA
378         2       6       CG      CD      CB
379         2       6       CD      NE      CG
380         1       1       NE      CD      CZ
381         2       3       NH1     CZ      NE
382         2       3       NH2     CZ      NE
383 HID-N   6
384         3       4       N       -       -
385         1       5       CA      N       C       CB
386         2       6       CB      CG      CA
387         1       1       ND1     CG      CE1
388         1       1       CE1     ND1     NE2
389         1       1       CD2     NE2     CG
390 HIE-N   6
391         3       4       N       -       -
392         1       5       CA      N       C       CB
393         2       6       CB      CG      CA
394         1       1       CE1     ND1     NE2
395         1       1       NE2     CE1     CD2
396         1       1       CD2     NE2     CG
397 HIP-N   7
398         3       4       N       -       -
399         1       5       CA      N       C       CB
400         2       6       CB      CG      CA
401         1       1       ND1     CG      CE1
402         1       1       CE1     ND1     NE2
403         1       1       NE2     CE1     CD2
404         1       1       CD2     NE2     CG
405 TRP-N   9
406         3       4       N       -       -
407         1       5       CA      N       C       CB
408         2       6       CB      CG      CA
409         1       1       CD1     CG      NE1
410         1       1       NE1     CD1     CE2
411         1       1       CZ2     CE2     CH2
412         1       1       CH2     CZ2     CZ3
413         1       1       CZ3     CH2     CE3
414         1       1       CE3     CZ3     CD2
415 PHE-N   8
416         3       4       N       -       -
417         1       5       CA      N       C       CB
418         2       6       CB      CG      CA
419         1       1       CD1     CG      CE1
420         1       1       CE1     CD1     CZ
421         1       1       CZ      CE1     CE2
422         1       1       CE2     CZ      CD2
423         1       1       CD2     CE2     CG
424 TYR-N   8
425         3       4       N       -       -
426         1       5       CA      N       C       CB
427         2       6       CB      CG      CA
428         1       1       CD1     CG      CE1
429         1       1       CE1     CD1     CZ
430         1       2       OH      CZ      CE1
431         1       1       CE2     CZ      CD2
432         1       1       CD2     CE2     CG
433 GLU-N   4
434         3       4       N       -       -
435         1       5       CA      N       C       CB
436         2       6       CB      CG      CA
437         2       6       CG      CD      CB
438 ASP-N   3
439         3       4       N       -       -
440         1       5       CA      N       C       CB
441         2       6       CB      CG      CA
442 LYS-N   7
443         3       4       N       -       -
444         1       5       CA      N       C       CB
445         2       6       CB      CG      CA
446         2       6       CG      CD      CB
447         2       6       CD      CE      CG
448         2       6       CE      NZ      CD
449         3       4       NZ      CE      CD
450 PRO-N   5
451         2       6       N       CD      -
452         2       6       CD      CG      N
453         2       6       CG      CB      CD
454         2       6       CB      CA      CG
455         1       5       CA      N       O       C
456 CYS-N   4
457         3       4       N       -       -
458         1       5       CA      N       C       CB
459         2       6       CB      SG      CA
460         1       2       SG      CB      CA
461 CYX-N   3
462         3       4       N       -       -
463         1       5       CA      N       C       CB
464         2       6       CB      SG      CA
465 MET-N   5
466         3       4       N       -       -
467         1       5       CA      N       C       CB
468         2       6       CB      CG      CA
469         2       6       CG      SD      CB
470         3       4       CE      SD      CG