Fix logic of TRR reading
[gromacs/AngularHB.git] / scripts / GMXRC.csh.cmakein
blob16a85df5c36adc2263985934f88d57e305ac8bfb
1 # csh/tcsh configuration file for Gromacs.
2 # First we remove previous Gromacs stuff from paths 
3 # by selecting everything else. 
4 # Removal is not 100% necessary, but very useful when we
5 # repeatedly switch between gmx versions in a shell.
7 # zero possibly unset vars to avoid warnings
8 if (! $?LD_LIBRARY_PATH) setenv LD_LIBRARY_PATH ""
9 if (! $?PKG_CONFIG_PATH) setenv PKG_CONFIG_PATH ""
10 if (! $?PATH) setenv PATH ""
11 if (! $?MANPATH) setenv MANPATH ""
12 if (! $?GMXLDLIB) setenv GMXLDLIB ""
13 if (! $?GMXBIN) setenv GMXBIN ""
14 if (! $?GMXMAN) setenv GMXMAN ""
16 # remove previous gromacs part from ld_library_path
17 set tmppath = ""
18 foreach i ( `echo $LD_LIBRARY_PATH | sed "s/:/ /g"` )
19   if ( "$i" != "$GMXLDLIB" ) then
20     if ("${tmppath}" == "") then
21       set tmppath = "$i"
22     else
23       set tmppath = "${tmppath}:$i"
24     endif
25   endif
26 end
27 setenv LD_LIBRARY_PATH $tmppath
29 # remove previous gromacs part from PKG_CONFIG_PATH
30 set tmppath = ""
31 foreach i ( `echo $PKG_CONFIG_PATH | sed "s/:/ /g"` )
32   if ( "$i" != "$GMXLDLIB/pkgconfig" ) then
33     if ("${tmppath}" == "") then
34       set tmppath = "$i"
35     else
36       set tmppath = "${tmppath}:$i"
37     endif
38   endif
39 end
40 setenv PKG_CONFIG_PATH $tmppath
42 # remove gromacs stuff from binary path
43 set tmppath = ""
44 foreach i ( `echo $PATH | sed "s/:/ /g"` )
45   if ( "$i" != "$GMXBIN" ) then
46     if ("${tmppath}" == "") then
47       set tmppath = "$i"
48     else
49       set tmppath = "${tmppath}:$i"
50     endif
51   endif
52 end
53 setenv PATH $tmppath
55 # and remove stuff from manual path
56 set tmppath = ""
57 foreach i ( `echo $MANPATH | sed "s/:/ /g"` )
58   if ( "$i" != "$GMXMAN" ) then 
59     if ("${tmppath}" == "") then
60       set tmppath = "$i"
61     else
62       set tmppath = "${tmppath}:$i"
63     endif
64   endif
65 end
66 setenv MANPATH $tmppath
68 ##########################################################
69 # This is the real configuration part. We save the Gromacs
70 # things in separate vars, so we can remove them later.
71 # If you move gromacs, change the first line.
72 ##########################################################
73 setenv GMXPREFIX @CMAKE_INSTALL_PREFIX@
74 setenv GMXBIN ${GMXPREFIX}/@BIN_INSTALL_DIR@
75 setenv GMXLDLIB ${GMXPREFIX}/@LIB_INSTALL_DIR@
76 setenv GMXMAN ${GMXPREFIX}/@MAN_INSTALL_DIR@
77 setenv GMXDATA ${GMXPREFIX}/@DATA_INSTALL_DIR@
78 setenv GROMACS_DIR ${GMXPREFIX}
80 #make them begin with :
81 if ($?LD_LIBRARY_PATH) setenv LD_LIBRARY_PATH ":${LD_LIBRARY_PATH}"
82 if ($?PKG_CONFIG_PATH) setenv PKG_CONFIG_PATH ":${PKG_CONFIG_PATH}"
84 #path is never empty
85 setenv PATH ${GMXBIN}:${PATH}
86 setenv LD_LIBRARY_PATH ${GMXLDLIB}${LD_LIBRARY_PATH}
87 setenv PKG_CONFIG_PATH ${GMXLDLIB}/pkgconfig${PKG_CONFIG_PATH}
88 #debian/ubuntu needs a : at the end
89 setenv MANPATH ${GMXMAN}:${MANPATH}
91 setenv GMX_FONT 10x20
93 # Read completions if we understand it (i.e. have tcsh)
94 # Currently disabled, since the completions don't work with the new
95 # gmx binary with subcommands.
96 # Contributions to get the functionality back are welcome.
97 #if { complete >& /dev/null } then
98 #  if ( -f $GMXBIN/completion.csh ) source $GMXBIN/completion.csh
99 #endif