improved option compatibility checking with OpenMM
[gromacs/AngularHB.git] / src / kernel / 
tree6bf12b7e0fe4184d41e2ed9d8b5fcaf2c1dfab9f
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 85 .gitignore
-rw-r--r-- 5179 CMakeLists.txt
-rw-r--r-- 2577 Makefile.am
-rw-r--r-- 6923 add_par.c
-rw-r--r-- 2443 add_par.h
-rw-r--r-- 3763 compute_io.c
-rw-r--r-- 1688 compute_io.h
-rw-r--r-- 14883 convparm.c
-rw-r--r-- 1658 convparm.h
-rw-r--r-- 20862 do_gct.c
-rw-r--r-- 9625 fflibutil.c
-rw-r--r-- 3101 fflibutil.h
-rw-r--r-- 5864 ffscan.c
-rw-r--r-- 2030 g_luck.c
-rw-r--r-- 5728 g_protonate.c
-rw-r--r-- 17017 g_x2top.c
-rw-r--r-- 2119 g_x2top.h
-rw-r--r-- 14182 gctio.c
-rw-r--r-- 21044 gen_ad.c
-rw-r--r-- 64569 gen_vsite.c
-rw-r--r-- 1984 gen_vsite.h
-rw-r--r-- 18198 genalg.c
-rw-r--r-- 2606 genalg.h
-rw-r--r-- 20945 genhydro.c
-rw-r--r-- 2778 genhydro.h
drwxr-xr-x - gmx_gpu_utils
-rw-r--r-- 2905 gmx_xml.c
-rw-r--r-- 539 gmx_xml.h
-rw-r--r-- 21153 gmxcheck.c
-rw-r--r-- 15690 gmxdump.c
-rw-r--r-- 13650 gpp_atomtype.c
-rw-r--r-- 2734 gpp_bond_atomtype.c
-rw-r--r-- 2305 gpp_bond_atomtype.h
-rw-r--r-- 1683 gpp_tomorse.h
-rw-r--r-- 47021 grompp.c
-rw-r--r-- 6163 h_db.c
-rw-r--r-- 2197 h_db.h
-rw-r--r-- 7318 hackblock.c
-rw-r--r-- 7456 hizzie.c
-rw-r--r-- 1607 hizzie.h
-rw-r--r-- 27124 ionize.c
-rw-r--r-- 1979 ionize.h
-rw-r--r-- 342 libgmxpreprocess.pc.cmakein
-rw-r--r-- 371 libgmxpreprocess.pc.in
-rw-r--r-- 102172 md.c
-rw-r--r-- 20672 md_openmm.c
-rw-r--r-- 2309 md_openmm.h
-rw-r--r-- 31578 mdrun.c
-rw-r--r-- 30945 membed.c
-rw-r--r-- 18011 mk_ghat.c
-rw-r--r-- 8162 nm2type.c
-rw-r--r-- 56974 openmm_wrapper.cpp
-rw-r--r-- 3110 openmm_wrapper.h
-rw-r--r-- 61814 pdb2gmx.c
-rw-r--r-- 47377 pdb2top.c
-rw-r--r-- 3433 pgutil.c
-rw-r--r-- 2067 pgutil.h
-rw-r--r-- 86810 readir.c
-rw-r--r-- 4388 readir.h
-rw-r--r-- 10035 readpull.c
-rw-r--r-- 19425 repl_ex.c
-rw-r--r-- 2733 repl_ex.h
-rw-r--r-- 16793 resall.c
-rw-r--r-- 8030 rtp2xml.c
-rw-r--r-- 28249 runner.c
-rw-r--r-- 421978 slater_S_integrals.c
-rw-r--r-- 517 slater_S_integrals.h
-rw-r--r-- 3945 sorting.c
-rw-r--r-- 2917 sorting.h
-rw-r--r-- 8877 specbond.c
-rw-r--r-- 1645 specbond.h
-rw-r--r-- 14094 ter_db.c
-rw-r--r-- 2144 ter_db.h
-rw-r--r-- 7296 tomorse.c
-rw-r--r-- 1643 topdef.h
-rw-r--r-- 9565 topdirs.c
-rw-r--r-- 1965 topdirs.h
-rw-r--r-- 9278 topexcl.c
-rw-r--r-- 2778 topexcl.h
-rw-r--r-- 38833 topio.c
-rw-r--r-- 2364 topio.h
-rw-r--r-- 62660 toppush.c
-rw-r--r-- 4710 toppush.h
-rw-r--r-- 6343 topshake.c
-rw-r--r-- 1597 topshake.h
-rw-r--r-- 11343 toputil.c
-rw-r--r-- 41569 tpbcmp.c
-rw-r--r-- 1908 tpbcmp.h
-rw-r--r-- 17628 tpbconv.c
-rw-r--r-- 38630 vsite_parm.c
-rw-r--r-- 2075 vsite_parm.h
-rw-r--r-- 7481 xlate.c
-rw-r--r-- 1821 xlate.h
-rw-r--r-- 6020 xmdrun.h
-rw-r--r-- 11995 xutils.c