Merge branch 'master' of git://git.gromacs.org/gromacs
[gromacs/adressmacs.git] / share / top / charmm27.ff / aminoacids.hdb
blob84e085994a6f11699982c1513eaa7d0d847351dd
1 ACE     1       
2 3       4       HH3     CH3     C       O
3 AIB     3       
4 1       1       HN      N       -C      CA
5 3       4       HB1     CB1     CA      N
6 3       4       HB2     CB2     CA      N
7 ALA     3       
8 1       1       HN      N       -C      CA
9 1       5       HA      CA      N       C       CB
10 3       4       HB      CB      CA      N
11 ARG     8       
12 1       1       HN      N       -C      CA
13 1       5       HA      CA      N       C       CB
14 2       6       HB      CB      CG      CA
15 2       6       HG      CG      CD      CB
16 2       6       HD      CD      NE      CG
17 1       1       HE      NE      CD      CZ
18 2       3       HH1     NH1     CZ      NE
19 2       3       HH2     NH2     CZ      NE
20 ARGN    8       
21 1       1       HN      N       -C      CA
22 1       5       HA      CA      N       C       CB
23 2       6       HB      CB      CG      CA
24 2       6       HG      CG      CD      CB
25 2       6       HD      CD      NE      CG
26 1       1       HE      NE      CD      CZ
27 1       2       HH1     NH1     CZ      NE
28 2       3       HH2     NH2     CZ      NE
29 ASN     4       
30 1       1       HN      N       -C      CA
31 1       5       HA      CA      N       C       CB
32 2       6       HB      CB      CG      CA
33 2       3       HD2     ND2     CG      CB
34 ASP     3       
35 1       1       HN      N       -C      CA
36 1       5       HA      CA      N       C       CB
37 2       6       HB      CB      CG      CA
38 ASPP    4       
39 1       1       HN      N       -C      CA
40 1       5       HA      CA      N       C       CB
41 2       6       HB      CB      CG      CA
42 1       2       HD2     OD2     CG      CB
43 CYS2    3       
44 1       1       HN      N       -C      CA
45 1       5       HA      CA      N       C       CB
46 2       6       HB      CB      SG      CA
47 CYS     4       
48 1       1       HN      N       -C      CA
49 1       5       HA      CA      N       C       CB
50 2       6       HB      CB      SG      CA
51 1       2       HG1     SG      CB      CA
52 GLN     5       
53 1       1       HN      N       -C      CA
54 1       5       HA      CA      N       C       CB
55 2       6       HB      CB      CG      CA
56 2       6       HG      CG      CD      CB
57 2       3       HE2     NE2     CD      CG
58 GLU     4       
59 1       1       HN      N       -C      CA
60 1       5       HA      CA      N       C       CB
61 2       6       HB      CB      CG      CA
62 2       6       HG      CG      CD      CB
63 GLUP    5       
64 1       1       HN      N       -C      CA
65 1       5       HA      CA      N       C       CB
66 2       6       HB      CB      CG      CA
67 2       6       HG      CG      CD      CB
68 1       2       HE2     OE2     CD      CG
69 GLY     2       
70 1       1       HN      N       -C      CA
71 2       6       HA      CA      C       N
72 HIS1    6       
73 1       1       HN      N       -C      CA
74 1       5       HA      CA      N       C       CB
75 2       6       HB      CB      CG      CA
76 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
77 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
78 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
79 HSD     6       
80 1       1       HN      N       -C      CA
81 1       5       HA      CA      N       C       CB
82 2       6       HB      CB      CG      CA
83 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
84 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
85 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
86 HSE     6       
87 1       1       HN      N       -C      CA
88 2       6       HB      CB      CG      CA
89 1       5       HA      CA      N       C       CB
90 1       1       HE2     NE2     CE1     CD2
91 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
92 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
93 HSP     7       
94 1       1       HN      N       -C      CA
95 1       5       HA      CA      N       C       CB
96 2       6       HB      CB      CG      CA
97 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
98 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
99 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
100 1       1       HE2     NE2     CE1     CD2
101 HO4     1       
102 3       10      HW      OW
103 HO5     1       
104 4       11      HW      OW
105 HOH     1       
106 2       7       HW      OW
107 ILE     6       
108 1       1       HN      N       -C      CA
109 1       5       HA      CA      N       C       CB
110 1       5       HB      CB      CA      CG1     CG2
111 2       6       HG1     CG1     CD      CB
112 3       4       HG2     CG2     CB      CA
113 3       4       HD      CD      CG1     CB
114 LEU     6       
115 1       1       HN      N       -C      CA
116 1       5       HA      CA      N       C       CB
117 2       6       HB      CB      CG      CA
118 1       5       HG      CG      CB      CD1     CD2
119 3       4       HD1     CD1     CG      CB
120 3       4       HD2     CD2     CG      CB
121 LSN     7
122 1       1       HN      N       -C      CA
123 1       5       HA      CA      N       C       CB
124 2       6       HB      CB      CG      CA
125 2       6       HG      CG      CD      CB
126 2       6       HD      CD      CE      CG
127 2       6       HE      CE      NZ      CD
128 2       4       HZ      NZ      CE      CD
129 LYS     7       
130 1       1       HN      N       -C      CA
131 1       5       HA      CA      N       C       CB
132 2       6       HB      CB      CG      CA
133 2       6       HG      CG      CD      CB
134 2       6       HD      CD      CE      CG
135 2       6       HE      CE      NZ      CD
136 3       4       HZ      NZ      CE      CD
137 MET     5       
138 1       1       HN      N       -C      CA
139 1       5       HA      CA      N       C       CB
140 2       6       HB      CB      CG      CA
141 2       6       HG      CG      SD      CB
142 3       4       HE      CE      SD      CG
143 PHE     8       
144 1       1       HN      N       -C      CA
145 1       5       HA      CA      N       C       CB
146 2       6       HB      CB      CG      CA
147 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
148 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
149 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
150 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
151 1       1       HZ      CZ      CE1     CE2
152 PRO     4       
153 1       5       HA      CA      N       C       CB
154 2       6       HB      CB      CG      CA
155 2       6       HG      CG      CD      CB
156 2       6       HD      CD      N       CG
157 SER     4       
158 1       1       HN      N       -C      CA
159 1       5       HA      CA      N       C       CB
160 2       6       HB      CB      OG      CA
161 1       2       HG1     OG      CB      CA
162 THR     5       
163 1       1       HN      N       -C      CA
164 1       5       HA      CA      N       C       CB
165 1       5       HB      CB      CA      OG1     CG2
166 1       2       HG1     OG1     CB      CA
167 3       4       HG2     CG2     CB      CA
168 TRP     9       
169 1       1       HN      N       -C      CA
170 1       5       HA      CA      N       C       CB
171 2       6       HB      CB      CG      CA
172 1       1       HD1     CD1     NE1     CG
173 1       1       HE1     NE1     CD1     CE2
174 1       1       HE3     CE3     CD2     CZ3
175 1       1       HZ3     CZ3     CE3     CH2
176 1       1       HH2     CH2     CZ3     CZ2
177 1       1       HZ2     CZ2     CE2     CH2
178 TYR     8       
179 1       1       HN      N       -C      CA
180 1       5       HA      CA      N       C       CB
181 2       6       HB      CB      CG      CA
182 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
183 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
184 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
185 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
186 1       2       HH      OH      CZ      CE1
187 VAL     5       
188 1       1       HN      N       -C      CA
189 1       5       HA      CA      N       C       CB
190 1       5       HB      CB      CA      CG1     CG2
191 3       4       HG1     CG1     CB      CA
192 3       4       HG2     CG2     CB      CA