Merge branch 'master' of git://git.gromacs.org/gromacs
[gromacs/adressmacs.git] / share / top / charmm27.ff / ffbonded.itp
blob4ea3d158dbe8e565c91b8645cd1fd5a3afaba33b
1 [ bondtypes ]
2 ; i     j       func    b0      kb
3 CST     OST     1       0.116   784884.928
4 SS      FE      1       0.232   209200.0
5 C       C       1       0.1335  502080.0
6 CA      CA      1       0.1375  255224.0
7 CE1     CE1     1       0.134   368192.0
8 CE1     CE2     1       0.1342  418400.0
9 CE1     CT2     1       0.1502  305432.0
10 CE1     CT3     1       0.1504  320494.4
11 CE2     CE2     1       0.133   426768.0
12 CP1     C       1       0.149   209200.0
13 CP1     CC      1       0.149   209200.0
14 CP1     CD      1       0.149   167360.0
15 CP2     CP1     1       0.1527  186188.0
16 CP2     CP2     1       0.1537  186188.0
17 CP3     CP2     1       0.1537  186188.0
18 CPB     CE1     1       0.138   376560.0
19 CPB     CPA     1       0.14432 250872.64
20 CPB     CPB     1       0.13464 285097.76
21 CPH1    CPH1    1       0.136   343088.0
22 CPM     CPA     1       0.13716 301248.0
23 CPT     CA      1       0.1368  255224.0
24 CPT     CPT     1       0.14    301248.0
25 CT1     C       1       0.149   209200.0
26 CT1     CC      1       0.1522  167360.0
27 CT1     CD      1       0.1522  167360.0
28 CT1     CT1     1       0.15    186188.0
29 CT2     C       1       0.149   209200.0
30 CT2     CA      1       0.149   192464.0
31 CT2     CC      1       0.1522  167360.0
32 CT2     CD      1       0.1522  167360.0
33 CT2     CPB     1       0.149   192464.0
34 CT2     CPH1    1       0.15    192154.384
35 CT2     CT1     1       0.1538  186188.0
36 CT2     CT2     1       0.153   186188.0
37 CT3     C       1       0.149   209200.0
38 CT3     CA      1       0.149   192464.0
39 CT3     CC      1       0.1522  167360.0
40 CT3     CD      1       0.1522  167360.0
41 CT3     CPB     1       0.149   192464.0
42 CT3     CPH1    1       0.15    192154.384
43 CT3     CS      1       0.1531  158992.0
44 CT3     CT1     1       0.1538  186188.0
45 CT3     CT2     1       0.1528  186188.0
46 CT3     CT3     1       0.153   186188.0
47 CY      CA      1       0.1365  292880.0
48 CY      CPT     1       0.144   292880.0
49 CY      CT2     1       0.151   192464.0
50 FE      CM      1       0.19    215894.4
51 FE      CPM     1       0.33814 0.0
52 H       CD      1       0.111   276144.0
53 HA      CA      1       0.1083  284512.0
54 HA      CC      1       0.11    265374.384
55 HA      CP2     1       0.1111  258571.2
56 HA      CP3     1       0.1111  258571.2
57 HA      CPM     1       0.109   307607.68
58 HA      CS      1       0.1111  251040.0
59 HA      CT1     1       0.1111  258571.2
60 HA      CT2     1       0.1111  258571.2
61 HA      CT3     1       0.1111  269449.6
62 HA      CY      1       0.108   276144.0
63 HE1     CE1     1       0.11    301666.4
64 HE2     CE2     1       0.11    305432.0
65 HB      CP1     1       0.108   276144.0
66 HB      CT1     1       0.108   276144.0
67 HB      CT2     1       0.108   276144.0
68 HB      CT3     1       0.108   276144.0
69 HP      CA      1       0.108   284512.0
70 HP      CY      1       0.108   292880.0
71 HR1     CPH1    1       0.1083  313800.0
72 HR1     CPH2    1       0.109   284512.0
73 HR2     CPH2    1       0.107   278654.4
74 HR3     CPH1    1       0.1083  305432.0
75 HT      HT      1       0.15139 0.0
76 N       C       1       0.13    217568.0
77 N       CP1     1       0.1434  267776.0
78 N       CP3     1       0.1455  267776.0
79 NC2     C       1       0.1365  387438.4
80 NC2     CT2     1       0.149   218404.8
81 NC2     CT3     1       0.149   218404.8
82 NC2     HC      1       0.1     380744.0
83 NH1     C       1       0.1345  309616.0
84 NH1     CT1     1       0.143   267776.0
85 NH1     CT2     1       0.143   267776.0
86 NH1     CT3     1       0.143   267776.0
87 NH1     H       1       0.0997  368192.0
88 NH1     HC      1       0.098   338904.0
89 NH2     CC      1       0.136   359824.0
90 NH2     CT2     1       0.1455  200832.0
91 NH2     CT3     1       0.1455  200832.0
92 NH2     H       1       0.1     401664.0
93 NH2     HC      1       0.1     384928.0
94 NH3     CT1     1       0.148   167360.0
95 NH3     CT2     1       0.148   167360.0
96 NH3     CT3     1       0.148   167360.0
97 NH3     HC      1       0.104   337230.4
98 NP      CP1     1       0.1485  267776.0
99 NP      CP3     1       0.1502  267776.0
100 NP      HC      1       0.1006  384928.0
101 NPH     CPA     1       0.13757 315640.96
102 NPH     FE      1       0.1958  226103.36
103 NR1     CPH1    1       0.138   334720.0
104 NR1     CPH2    1       0.136   334720.0
105 NR1     H       1       0.1     389948.8
106 NR2     CPH1    1       0.138   334720.0
107 NR2     CPH2    1       0.132   334720.0
108 NR2     FE      1       0.22    54392.0
109 NR3     CPH1    1       0.137   317984.0
110 NR3     CPH2    1       0.132   317984.0
111 NR3     H       1       0.1     379070.4
112 NY      CA      1       0.137   225936.0
113 NY      CPT     1       0.1375  225936.0
114 NY      H       1       0.0976  389112.0
115 O       C       1       0.123   518816.0
116 O       CC      1       0.123   543920.0
117 OB      CC      1       0.122   627600.0
118 OB      CD      1       0.122   627600.0
119 OC      CA      1       0.126   439320.0
120 OC      CC      1       0.126   439320.0
121 OC      CT2     1       0.133   376560.0
122 OC      CT3     1       0.133   376560.0
123 OH1     CA      1       0.1411  279742.24
124 OH1     CD      1       0.14    192464.0
125 OH1     CT1     1       0.142   358150.4
126 OH1     CT2     1       0.142   358150.4
127 OH1     CT3     1       0.142   358150.4
128 OH1     H       1       0.096   456056.0
129 OM      CM      1       0.1128  933032.0
130 OM      FE      1       0.18    209200.0
131 OM      OM      1       0.123   502080.0
132 OS      CD      1       0.1334  125520.0
133 OS      CT3     1       0.143   284512.0
134 OT      HT      1       0.09572 376560.0
135 S       CT2     1       0.1818  165686.4
136 S       CT3     1       0.1816  200832.0
137 S       HS      1       0.1325  230120.0
138 SM      CT2     1       0.1816  179075.2
139 SM      CT3     1       0.1816  179075.2
140 SM      SM      1       0.2029  144766.4
141 SS      CS      1       0.1836  171544.0
142 CTL3    CL      1       0.1522  167360.0
143 CTL2    CL      1       0.1522  167360.0
144 CTL1    CL      1       0.1522  167360.0
145 OBL     CL      1       0.122   627600.0
146 OCL     CL      1       0.126   439320.0
147 OSL     CL      1       0.1334  125520.0
148 OHL     CL      1       0.14    192464.0
149 HOL     OHL     1       0.096   456056.0
150 CTL1    HAL1    1       0.1111  258571.2
151 CTL2    HAL2    1       0.1111  258571.2
152 CTL3    HAL3    1       0.1111  269449.6
153 CTL3    OSL     1       0.143   284512.0
154 CTL2    OSL     1       0.143   284512.0
155 CTL1    OSL     1       0.143   284512.0
156 OSL     PL      1       0.16    225936.0
157 O2L     PL      1       0.148   485344.0
158 OHL     PL      1       0.159   198321.6
159 NH3L    HCL     1       0.104   343088.0
160 NH3L    CTL2    1       0.151   218404.8
161 NTL     CTL2    1       0.151   179912.0
162 NTL     CTL5    1       0.151   179912.0
163 CTL5    HL      1       0.108   251040.0
164 CTL2    HL      1       0.108   251040.0
165 CTL1    CTL1    1       0.15    186188.0
166 CTL1    CTL2    1       0.1538  186188.0
167 CTL1    CTL3    1       0.1538  186188.0
168 CTL2    CTL2    1       0.153   186188.0
169 CTL2    CTL3    1       0.1528  186188.0
170 CTL3    CTL3    1       0.153   186188.0
171 OHL     CTL1    1       0.142   358150.4
172 OHL     CTL2    1       0.142   358150.4
173 OHL     CTL3    1       0.142   358150.4
174 SL      O2L     1       0.1448  451872.0
175 SL      OSL     1       0.1575  209200.0
176 CEL2    CEL2    1       0.133   426768.0
177 HEL2    CEL2    1       0.11    305432.0
178 CEL1    CTL3    1       0.1504  320494.4
179 CEL1    CEL2    1       0.1342  418400.0
180 HEL1    CEL1    1       0.11    301666.4
181 CEL1    CTL2    1       0.1502  305432.0
182 CEL1    CEL1    1       0.134   368192.0
183 ; ### for NH2 terminal
184 NH2     CT1     1       0.1455  200832.0
187 [ constrainttypes ]
188 ; this section is copied from OPLS. In theory we could recalculate
189 ; optimal geometries from charmm values, but since pratical equilibrium
190 ; geometries do not correspond exactly to these values anyway it is not
191 ; worth the effort...
192 #ifdef HEAVY_H
193 ; account for larger inertia with heavy hydrogens
194 ; constraints for the rigid NH3 groups
195 MNH3     CT1   2    0.191406
196 MNH3     CT2   2    0.191406
197 MNH3     CT3   2    0.191406
198 MNH3    MNH3   2    0.165238
199 ; constraints for rigid ch3
200 MCH3     CT1   2    0.206892
201 MCH3     CT2   2    0.206000
202 MCH3     CT3   2    0.206179
203 MCH3    MCH3   2    0.187164
204 MCH3S      S   2    0.233335
205 MCH3S  MCH3S   2    0.185689
206 #else
207 ; no heavy hydrogens.
208 ; constraints for the rigid NH3 groups
209 MNH3     CT1   2    0.159603
210 MNH3     CT2   2    0.159603
211 MNH3     CT3   2    0.159603
212 MNH3    MNH3   2    0.082619
213 ; constraints for rigid ch3
214 MCH3     CT1   2    0.168122
215 MCH3     CT2   2    0.167162
216 MCH3     CT3   2    0.167354
217 MCH3    MCH3   2    0.093582
218 MCH3S      S   2    0.195314
219 MCH3S  MCH3S   2    0.092844
220 #endif
221 ; angle-derived constraints for OH and SH groups in proteins
222 ; The constraint A-C is calculated from the angle A-B-C and bonds A-B, B-C.
223 CA        H   2     0.193641
224 CD        H   2     0.200439
225 CT1       H   2     0.192081
226 CT2       H   2     0.192081
227 CT3       H   2     0.192081
228 CT2      HS   2     0.234108
229 CT3      HS   2     0.233942
231 [ angletypes ]
232 ; i     j       k       func    th0     cth     ub0     cub
233 OST     CST     OST     5       180.0000        25104.0 0.0     0.0
234 CS      SS      FE      5       100.6   418.4   0.0     0.0
235 SS      FE      NPH     5       90.0    836.8   0.0     0.0
236 CA      CA      CA      5       120.00  334.72  0.24162 29288.0
237 CE1     CE1     CT2     5       123.50  401.664 0.0     0.0
238 CE1     CE1     CT3     5       123.50  401.664 0.0     0.0
239 CE1     CT2     CT3     5       112.20  267.776 0.0     0.0
240 CE2     CE1     CT2     5       126.00  401.664 0.0     0.0
241 CE2     CE1     CT3     5       125.20  393.296 0.0     0.0
242 CP1     N       C       5       117.0000        502.08  0.0     0.0
243 CP2     CP1     C       5       112.3000        435.136 0.0     0.0
244 CP2     CP1     CC      5       112.3000        435.136 0.0     0.0
245 CP2     CP1     CD      5       112.3000        418.4   0.0     0.0
246 CP2     CP2     CP1     5       108.5000        585.76  0.0     0.0
247 CP3     CP2     CP2     5       108.5000        585.76  0.0     0.0
248 CP3     N       C       5       117.0000        502.08  0.0     0.0
249 CP3     N       CP1     5       114.2000        836.8   0.0     0.0
250 CP3     NP      CP1     5       111.0000        836.8   0.0     0.0
251 CPA     CPB     CE1     5       126.7400        585.76  0.0     0.0
252 CPA     CPM     CPA     5       125.1200        788.2656        0.0     0.0
253 CPA     NPH     CPA     5       103.9000        1165.6624       0.0     0.0
254 CPB     CE1     CE2     5       121.5000        585.76  0.0     0.0
255 CPB     CPB     CE1     5       126.7500        585.76  0.0     0.0
256 CPB     CPB     CPA     5       106.5100        257.7344        0.0     0.0
257 CPH2    NR1     CPH1    5       107.5000        1087.84 0.0     0.0
258 CPH2    NR2     CPH1    5       104.0000        1087.84 0.0     0.0
259 CPH2    NR3     CPH1    5       108.0000        1213.36 0.0     0.0
260 CPM     CPA     CPB     5       124.0700        515.4688        0.0     0.0
261 CPT     CA      CA      5       118.0000        502.08  0.0     0.0
262 CPT     CPT     CA      5       122.0000        502.08  0.0     0.0
263 CPT     CY      CA      5       107.40  1004.16 0.2261  20920.0
264 CPT     NY      CA      5       108.0000        920.48  0.0     0.0
265 CT1     CT1     C       5       108.0000        435.136 0.0     0.0
266 CT1     CT1     CC      5       108.0000        435.136 0.0     0.0
267 CT1     CT1     CT1     5       111.00  446.4328        0.2561  6694.4
268 CT1     CT2     CA      5       107.5000        433.4624        0.0     0.0
269 CT1     CT2     CC      5       108.0000        435.136 0.0     0.0
270 CT1     CT2     CD      5       108.0000        435.136 0.0     0.0
271 CT1     CT2     CPH1    5       113.0000        488.2728        0.0     0.0
272 CT1     CT2     CT1     5       113.50  488.2728        0.2561  9338.688
273 CT1     NH1     C       5       120.0000        418.4   0.0     0.0
274 CT2     CA      CA      5       122.3000        383.2544        0.0     0.0
275 CT2     CPB     CPA     5       126.7400        543.92  0.0     0.0
276 CT2     CPB     CPB     5       126.7500        543.92  0.0     0.0
277 CT2     CPH1    CPH1    5       130.0000        383.2544        0.0     0.0
278 CT2     CT1     C       5       108.0000        435.136 0.0     0.0
279 CT2     CT1     CC      5       108.0000        435.136 0.0     0.0
280 CT2     CT1     CD      5       108.0000        435.136 0.0     0.0
281 CT2     CT1     CT1     5       111.00  446.4328        0.2561  6694.4
282 CT2     CT2     C       5       108.0000        435.136 0.0     0.0
283 CT2     CT2     CC      5       108.0000        435.136 0.0     0.0
284 CT2     CT2     CD      5       108.0000        435.136 0.0     0.0
285 CT2     CT2     CPB     5       113.0000        585.76  0.0     0.0
286 CT2     CT2     CT1     5       113.50  488.2728        0.2561  9338.688
287 CT2     CT2     CT2     5       113.60  488.2728        0.2561  9338.688
288 CT2     CT3     CT1     5       113.50  488.2728        0.2561  9338.688
289 CT2     CY      CA      5       129.4000        383.2544        0.0     0.0
290 CT2     CY      CPT     5       124.0000        383.2544        0.0     0.0
291 CT2     NC2     C       5       120.0000        521.3264        0.0     0.0
292 CT2     NH1     C       5       120.0000        418.4   0.0     0.0
293 CT2     OS      CD      5       109.60  334.72  0.22651 25104.0
294 CT3     CA      CA      5       122.3000        383.2544        0.0     0.0
295 CT3     CPB     CPA     5       126.7400        543.92  0.0     0.0
296 CT3     CPB     CPB     5       126.7500        543.92  0.0     0.0
297 CT3     CPH1    CPH1    5       130.0000        383.2544        0.0     0.0
298 CT3     CT1     C       5       108.0000        435.136 0.0     0.0
299 CT3     CT1     CC      5       108.0000        435.136 0.0     0.0
300 CT3     CT1     CT1     5       108.50  446.4328        0.2561  6694.4
301 CT3     CT1     CT2     5       114.00  446.4328        0.2561  6694.4
302 CT3     CT1     CT3     5       114.00  446.4328        0.2561  6694.4
303 CT3     CT2     CA      5       107.5000        433.4624        0.0     0.0
304 CT3     CT2     CPH1    5       113.0000        488.2728        0.0     0.0
305 CT3     CT2     CT1     5       113.50  488.2728        0.2561  9338.688
306 CT3     CT2     CT2     5       115.00  485.344 0.2561  6694.4
307 CT3     CT2     CT3     5       114.00  446.4328        0.2561  6694.4
308 CT3     NC2     C       5       120.0000        521.3264        0.0     0.0
309 CT3     NH1     C       5       120.0000        418.4   0.0     0.0
310 CT3     OS      CD      5       109.60  334.72  0.22651 25104.0
311 CT3     S       CT2     5       95.0000 284.512 0.0     0.0
312 CY      CPT     CA      5       130.6000        1338.88 0.0     0.0
313 CY      CPT     CPT     5       107.4000        920.48  0.0     0.0
314 CY      CT2     CT1     5       114.0000        488.2728        0.0     0.0
315 CY      CT2     CT3     5       114.0000        488.2728        0.0     0.0
316 FE      NPH     CPA     5       128.0500        804.5832        0.0     0.0
317 FE      NR2     CPH1    5       133.0000        251.04  0.0     0.0
318 FE      NR2     CPH2    5       123.0000        251.04  0.0     0.0
319 H       NH1     C       5       123.0000        284.512 0.0     0.0
320 H       NH1     CT1     5       117.0000        292.88  0.0     0.0
321 H       NH1     CT2     5       117.0000        292.88  0.0     0.0
322 H       NH1     CT3     5       117.0000        292.88  0.0     0.0
323 H       NH2     CC      5       120.0000        418.4   0.0     0.0
324 H       NH2     H       5       120.0000        192.464 0.0     0.0
325 H       NR1     CPH1    5       125.50  251.04  0.215   16736.0
326 H       NR1     CPH2    5       127.00  251.04  0.214   16736.0
327 H       NR3     CPH1    5       126.00  209.2   0.213   12552.0
328 H       NR3     CPH2    5       126.00  209.2   0.209   12552.0
329 H       NY      CA      5       126.0000        234.304 0.0     0.0
330 H       NY      CPT     5       126.0000        234.304 0.0     0.0
331 H       OH1     CA      5       108.0000        543.92  0.0     0.0
332 H       OH1     CD      5       115.0000        460.24  0.0     0.0
333 H       OH1     CT1     5       106.0000        481.16  0.0     0.0
334 H       OH1     CT2     5       106.0000        481.16  0.0     0.0
335 H       OH1     CT3     5       106.0000        481.16  0.0     0.0
336 HA      CA      CA      5       120.00  242.672 0.21525 20920.0
337 HA      CA      CPT     5       122.0000        343.088 0.0     0.0
338 HA      CA      CY      5       125.00  267.776 0.2173  20920.0
339 HA      CP2     CP1     5       110.10  279.74224       0.2179  18853.104
340 HA      CP2     CP2     5       110.10  221.752 0.2179  18853.104
341 HA      CP2     CP3     5       110.10  221.752 0.2179  18853.104
342 HA      CP2     HA      5       109.00  297.064 0.1802  4518.72
343 HA      CP3     CP2     5       110.10  221.752 0.2179  18853.104
344 HA      CP3     HA      5       109.00  297.064 0.1802  4518.72
345 HA      CPM     CPA     5       117.4400        106.2736        0.0     0.0
346 HA      CPM     FE      5       180.0000        0.0     0.0     0.0
347 HA      CS      CT3     5       110.10  289.5328        0.2179  18853.104
348 HA      CS      HA      5       108.40  297.064 0.1775  11715.2
349 HA      CT1     C       5       109.50  276.144 0.2163  25104.0
350 HA      CT1     CD      5       109.50  276.144 0.2163  25104.0
351 HA      CT1     CT1     5       110.10  288.696 0.2179  18853.104
352 HA      CT1     CT2     5       110.10  288.696 0.2179  18853.104
353 HA      CT1     CT3     5       110.10  288.696 0.2179  18853.104
354 HA      CT1     HA      5       109.00  297.064 0.1802  4518.72
355 HA      CT2     C       5       109.50  276.144 0.2163  25104.0
356 HA      CT2     CA      5       107.5000        412.5424        0.0     0.0
357 HA      CT2     CC      5       109.50  276.144 0.2163  25104.0
358 HA      CT2     CD      5       109.50  276.144 0.2163  25104.0
359 HA      CT2     CE1     5       111.50  376.56  0.0     0.0
360 HA      CT2     CPB     5       109.5000        418.4   0.0     0.0
361 HA      CT2     CPH1    5       109.5000        279.74224       0.0     0.0
362 HA      CT2     CT1     5       110.10  279.74224       0.2179  18853.104
363 HA      CT2     CT2     5       110.10  221.752 0.2179  18853.104
364 HA      CT2     CT3     5       110.10  289.5328        0.2179  18853.104
365 HA      CT2     CY      5       109.5000        279.74224       0.0     0.0
366 HA      CT2     HA      5       109.00  297.064 0.1802  4518.72
367 HA      CT3     C       5       109.50  276.144 0.2163  25104.0
368 HA      CT3     CA      5       107.5000        412.5424        0.0     0.0
369 HA      CT3     CC      5       109.50  276.144 0.2163  25104.0
370 HA      CT3     CD      5       109.50  276.144 0.2163  25104.0
371 HA      CT3     CE1     5       111.50  351.456 0.0     0.0
372 HA      CT3     CPB     5       109.5000        418.4   0.0     0.0
373 HA      CT3     CPH1    5       109.5000        279.74224       0.0     0.0
374 HA      CT3     CS      5       110.10  289.5328        0.2179  18853.104
375 HA      CT3     CT1     5       110.10  279.74224       0.2179  18853.104
376 HA      CT3     CT2     5       110.10  289.5328        0.2179  18853.104
377 HA      CT3     CT3     5       110.10  313.8   0.2179  18853.104
378 HA      CT3     HA      5       108.40  297.064 0.1802  4518.72
379 HA      CY      CA      5       126.40  167.36  0.2186  20920.0
380 HA      CY      CPT     5       126.40  267.776 0.2255  20920.0
381 HE1     CE1     CE1     5       119.50  435.136 0.0     0.0
382 HE1     CE1     CE2     5       118.00  351.456 0.0     0.0
383 HE1     CE1     CT2     5       116.00  334.72  0.0     0.0
384 HE1     CE1     CT3     5       117.00  184.096 0.0     0.0
385 HE1     CE1     CPB     5       120.0000        418.4   0.0     0.0
386 HE2     CE2     CE1     5       120.50  376.56  0.0     0.0
387 HE2     CE2     CE2     5       120.50  464.424 0.0     0.0
388 HE2     CE2     HE2     5       119.00  158.992 0.0     0.0
389 HB      CP1     C       5       112.0000        418.4   0.0     0.0
390 HB      CP1     CC      5       112.0000        418.4   0.0     0.0
391 HB      CP1     CD      5       112.0000        418.4   0.0     0.0
392 HB      CP1     CP2     5       118.0000        292.88  0.0     0.0
393 HB      CT1     C       5       109.5000        418.4   0.0     0.0
394 HB      CT1     CC      5       109.5000        418.4   0.0     0.0
395 HB      CT1     CD      5       109.5000        418.4   0.0     0.0
396 HB      CT1     CT1     5       111.0000        292.88  0.0     0.0
397 HB      CT1     CT2     5       111.0000        292.88  0.0     0.0
398 HB      CT1     CT3     5       111.0000        292.88  0.0     0.0
399 HB      CT2     C       5       109.5000        418.4   0.0     0.0
400 HB      CT2     CC      5       109.5000        418.4   0.0     0.0
401 HB      CT2     CD      5       109.5000        418.4   0.0     0.0
402 HB      CT2     HB      5       115.0000        301.248 0.0     0.0
403 HB      CT3     C       5       109.5000        418.4   0.0     0.0
404 HC      NC2     C       5       120.0000        410.032 0.0     0.0
405 HC      NC2     CT2     5       120.0000        338.0672        0.0     0.0
406 HC      NC2     CT3     5       120.0000        338.0672        0.0     0.0
407 HC      NC2     HC      5       120.0000        209.2   0.0     0.0
408 HC      NH2     CT2     5       111.0000        418.4   0.0     0.0
409 HC      NH2     CT3     5       111.0000        418.4   0.0     0.0
410 HC      NH2     HC      5       106.5000        326.352 0.0     0.0
411 HC      NH3     CT1     5       109.50  251.04  0.2074  16736.0
412 HC      NH3     CT2     5       109.50  251.04  0.2074  16736.0
413 HC      NH3     CT3     5       109.50  251.04  0.2074  16736.0
414 HC      NH3     HC      5       109.5000        368.192 0.0     0.0
415 HC      NP      CP1     5       109.50  276.144 0.2056  3347.2
416 HC      NP      CP3     5       109.50  276.144 0.2056  3347.2
417 HC      NP      HC      5       107.5000        426.768 0.0     0.0
418 HP      CA      CA      5       120.00  251.04  0.21525 18409.6
419 HP      CA      CPT     5       122.00  251.04  0.2146  18409.6
420 HP      CA      CY      5       125.00  267.776 0.2173  20920.0
421 HP      CY      CA      5       126.40  267.776 0.2186  20920.0
422 HP      CY      CPT     5       126.40  267.776 0.2255  20920.0
423 HR1     CPH1    CPH1    5       130.00  184.096 0.2215  12552.0
424 HR3     CPH1    CPH1    5       130.00  209.2   0.22    16736.0
425 HS      S       CT2     5       95.0000 324.6784        0.0     0.0
426 HS      S       CT3     5       95.0000 359.824 0.0     0.0
427 HT      OT      HT      5       104.5200        460.24  0.0     0.0
428 N       C       CP1     5       112.5000        167.36  0.0     0.0
429 N       C       CT1     5       112.5000        167.36  0.0     0.0
430 N       C       CT2     5       112.5000        167.36  0.0     0.0
431 N       C       CT3     5       112.5000        167.36  0.0     0.0
432 N       CP1     C       5       108.2000        418.4   0.0     0.0
433 N       CP1     CC      5       108.2000        418.4   0.0     0.0
434 N       CP1     CD      5       108.2000        418.4   0.0     0.0
435 N       CP1     CP2     5       110.8000        585.76  0.0     0.0
436 N       CP1     HB      5       112.0000        401.664 0.0     0.0
437 N       CP3     CP2     5       110.5000        585.76  0.0     0.0
438 N       CP3     HA      5       108.0000        401.664 0.0     0.0
439 NC2     C       NC2     5       120.00  435.136 0.23642 75312.0
440 NC2     CT2     CT2     5       107.5000        566.5136        0.0     0.0
441 NC2     CT2     HA      5       107.5000        430.952 0.0     0.0
442 NC2     CT3     HA      5       107.5000        430.952 0.0     0.0
443 NH1     C       CP1     5       116.5000        669.44  0.0     0.0
444 NH1     C       CT1     5       116.5000        669.44  0.0     0.0
445 NH1     C       CT2     5       116.5000        669.44  0.0     0.0
446 NH1     C       CT3     5       116.5000        669.44  0.0     0.0
447 NH1     CT1     C       5       107.0000        418.4   0.0     0.0
448 NH1     CT1     CC      5       107.0000        418.4   0.0     0.0
449 NH1     CT1     CD      5       107.0000        418.4   0.0     0.0
450 NH1     CT1     CT1     5       113.5000        585.76  0.0     0.0
451 NH1     CT1     CT2     5       113.5000        585.76  0.0     0.0
452 NH1     CT1     CT3     5       113.5000        585.76  0.0     0.0
453 NH1     CT1     HB      5       108.0000        401.664 0.0     0.0
454 NH1     CT2     C       5       107.0000        418.4   0.0     0.0
455 NH1     CT2     CC      5       107.0000        418.4   0.0     0.0
456 NH1     CT2     CD      5       107.0000        418.4   0.0     0.0
457 NH1     CT2     CT2     5       113.5000        585.76  0.0     0.0
458 NH1     CT2     HA      5       109.5000        430.952 0.0     0.0
459 NH1     CT2     HB      5       108.0000        401.664 0.0     0.0
460 NH1     CT3     HA      5       109.5000        430.952 0.0     0.0
461 NH2     CC      CP1     5       112.5000        669.44  0.0     0.0
462 NH2     CC      CT1     5       116.50  418.4   0.245   41840.0
463 NH2     CC      CT2     5       116.50  418.4   0.245   41840.0
464 NH2     CC      CT3     5       116.50  418.4   0.245   41840.0
465 NH2     CC      HA      5       111.00  368.192 0.198   41840.0
466 NH2     CT2     HA      5       109.50  317.984 0.214   41840.0
467 NH2     CT2     HB      5       109.50  317.984 0.214   41840.0
468 NH2     CT2     CD      5       108.0000        435.136 0.0     0.0
469 NH2     CT2     CT2     5       110.0000        566.5136        0.0     0.0
470 NH2     CT3     HA      5       109.50  317.984 0.214   41840.0
471 NH3     CT1     C       5       110.0000        365.6816        0.0     0.0
472 NH3     CT1     CC      5       110.0000        365.6816        0.0     0.0
473 NH3     CT1     CT1     5       110.0000        566.5136        0.0     0.0
474 NH3     CT1     CT2     5       110.0000        566.5136        0.0     0.0
475 NH3     CT1     CT3     5       110.0000        566.5136        0.0     0.0
476 NH3     CT1     HB      5       107.5000        430.952 0.0     0.0
477 NH3     CT2     C       5       110.0000        365.6816        0.0     0.0
478 NH3     CT2     CC      5       110.0000        365.6816        0.0     0.0
479 NH3     CT2     CD      5       110.0000        365.6816        0.0     0.0
480 NH3     CT2     CT2     5       110.0000        566.5136        0.0     0.0
481 NH3     CT2     HA      5       107.50  376.56  0.2101  29288.0
482 NH3     CT2     HB      5       107.5000        430.952 0.0     0.0
483 NH3     CT3     HA      5       107.50  376.56  0.2101  29288.0
484 NP      CP1     C       5       106.0000        418.4   0.0     0.0
485 NP      CP1     CC      5       106.0000        418.4   0.0     0.0
486 NP      CP1     CD      5       106.0000        418.4   0.0     0.0
487 NP      CP1     CP2     5       108.5000        585.76  0.0     0.0
488 NP      CP1     HB      5       107.5000        430.952 0.0     0.0
489 NP      CP3     CP2     5       108.5000        585.76  0.0     0.0
490 NP      CP3     HA      5       109.1500        430.952 0.0     0.0
491 NPH     CPA     CPB     5       111.5400        1020.896        0.0     0.0
492 NPH     CPA     CPM     5       124.3900        736.384 0.0     0.0
493 NPH     FE      CM      5       90.0000 418.4   0.0     0.0
494 NPH     FE      CPM     5       45.0000 0.0     0.0     0.0
495 NPH     FE      NPH     5       90.0000 120.41552       0.0     0.0
496 NR1     CPH1    CPH1    5       106.0000        1087.84 0.0     0.0
497 NR1     CPH1    CT2     5       124.0000        383.2544        0.0     0.0
498 NR1     CPH1    CT3     5       124.0000        383.2544        0.0     0.0
499 NR1     CPH1    HR3     5       124.00  209.2   0.214   16736.0
500 NR1     CPH2    HR1     5       122.50  209.2   0.214   16736.0
501 NR2     CPH1    CPH1    5       110.0000        1087.84 0.0     0.0
502 NR2     CPH1    CT2     5       120.0000        383.2544        0.0     0.0
503 NR2     CPH1    HR3     5       120.00  209.2   0.214   16736.0
504 NR2     CPH2    HR1     5       125.00  209.2   0.212   16736.0
505 NR2     CPH2    NR1     5       112.5000        1087.84 0.0     0.0
506 NR2     FE      CM      5       180.0000        418.4   0.0     0.0
507 NR2     FE      NPH     5       90.0000 418.4   0.0     0.0
508 NR3     CPH1    CPH1    5       108.0000        1213.36 0.0     0.0
509 NR3     CPH1    CT2     5       122.0000        383.2544        0.0     0.0
510 NR3     CPH1    HR1     5       122.00  184.096 0.218   12552.0
511 NR3     CPH2    HR2     5       126.00  267.776 0.214   20920.0
512 NR3     CPH2    NR3     5       108.0000        1213.36 0.0     0.0
513 NY      CA      CY      5       110.00  1004.16 0.224   20920.0
514 NY      CA      HA      5       125.00  267.776 0.2177  20920.0
515 NY      CA      HP      5       125.00  267.776 0.2177  20920.0
516 NY      CPT     CA      5       130.6000        1338.88 0.0     0.0
517 NY      CPT     CPT     5       107.4000        920.48  0.0     0.0
518 O       C       CP1     5       118.0000        669.44  0.0     0.0
519 O       C       CT1     5       121.0000        669.44  0.0     0.0
520 O       C       CT2     5       121.0000        669.44  0.0     0.0
521 O       C       CT3     5       121.0000        669.44  0.0     0.0
522 O       C       H       5       121.7000        418.4   0.0     0.0
523 O       C       N       5       122.5000        669.44  0.0     0.0
524 O       C       NH1     5       122.5000        669.44  0.0     0.0
525 O       CC      CP1     5       118.0000        669.44  0.0     0.0
526 O       CC      CT1     5       121.00  125.52  0.244   41840.0
527 O       CC      CT2     5       121.00  125.52  0.244   41840.0
528 O       CC      CT3     5       121.00  125.52  0.244   41840.0
529 O       CC      HA      5       122.0000        368.192 0.0     0.0
530 O       CC      NH2     5       122.50  627.6   0.237   41840.0
531 OB      CD      CP1     5       125.00  585.76  0.2442  16736.0
532 OB      CD      CT1     5       125.00  585.76  0.2442  16736.0
533 OB      CD      CT2     5       125.00  585.76  0.2442  16736.0
534 OB      CD      CT3     5       125.00  585.76  0.2442  16736.0
535 OC      CA      CA      5       120.0000        334.72  0.0     0.0
536 OC      CC      CP1     5       118.00  334.72  0.2388  41840.0
537 OC      CC      CT1     5       118.00  334.72  0.2388  41840.0
538 OC      CC      CT2     5       118.00  334.72  0.2388  41840.0
539 OC      CC      CT3     5       118.00  334.72  0.2388  41840.0
540 OC      CC      OC      5       124.00  836.8   0.2225  58576.0
541 OC      CT2     CT3     5       122.0000        543.92  0.0     0.0
542 OC      CT2     HA      5       118.3000        543.92  0.0     0.0
543 OC      CT3     HA      5       118.3000        543.92  0.0     0.0
544 OH1     CA      CA      5       120.0000        378.2336        0.0     0.0
545 OH1     CD      CT2     5       110.5000        460.24  0.0     0.0
546 OH1     CD      CT3     5       110.5000        460.24  0.0     0.0
547 OH1     CD      OB      5       123.00  418.4   0.2262  175728.0
548 OH1     CT1     CT1     5       110.1000        633.4576        0.0     0.0
549 OH1     CT1     CT3     5       110.1000        633.4576        0.0     0.0
550 OH1     CT1     HA      5       108.8900        384.0912        0.0     0.0
551 OH1     CT2     CT1     5       110.1000        633.4576        0.0     0.0
552 OH1     CT2     CT2     5       110.1000        633.4576        0.0     0.0
553 OH1     CT2     CT3     5       110.1000        633.4576        0.0     0.0
554 OH1     CT2     HA      5       108.8900        384.0912        0.0     0.0
555 OH1     CT3     HA      5       108.8900        384.0912        0.0     0.0
556 OM      CM      FE      5       180.0000        292.88  0.0     0.0
557 OM      FE      NPH     5       90.0000 41.84   0.0     0.0
558 ; ### For Heme : the O2 group is NOT at 180.00
559 ;OM     OM      FE      5       180.0000        0.0     0.0     0.0
560 ; The force constant is quite arbitrary. 
561 OM      OM      FE      5       122.0000        418.4   0.0     0.0
562 ; ###
563 OS      CD      CP1     5       109.00  460.24  0.2326  16736.0
564 OS      CD      CT1     5       109.00  460.24  0.2326  16736.0
565 OS      CD      CT2     5       109.00  460.24  0.2326  16736.0
566 OS      CD      CT3     5       109.00  460.24  0.2326  16736.0
567 OS      CD      OB      5       125.90  753.12  0.22576 133888.0
568 OS      CT2     HA      5       109.5000        502.08  0.0     0.0
569 OS      CT3     HA      5       109.5000        502.08  0.0     0.0
570 S       CT2     CT1     5       112.5000        485.344 0.0     0.0
571 S       CT2     CT2     5       114.5000        485.344 0.0     0.0
572 S       CT2     CT3     5       114.5000        485.344 0.0     0.0
573 S       CT2     HA      5       111.3000        385.7648        0.0     0.0
574 S       CT3     HA      5       111.3000        385.7648        0.0     0.0
575 SM      CT2     CT1     5       112.5000        485.344 0.0     0.0
576 SM      CT2     HA      5       111.0000        317.984 0.0     0.0
577 SM      CT3     HA      5       111.0000        317.984 0.0     0.0
578 SM      SM      CT2     5       103.3000        606.68  0.0     0.0
579 SM      SM      CT3     5       103.3000        606.68  0.0     0.0
580 SS      CS      CT3     5       118.0000        460.24  0.0     0.0
581 SS      CS      HA      5       112.3000        334.72  0.0     0.0
582 OBL     CL      CTL3    5       125.0   585.76  0.2442  16736.0
583 OBL     CL      CTL2    5       125.0   585.76  0.2442  16736.0
584 OBL     CL      CTL1    5       125.0   585.76  0.2442  16736.0
585 OSL     CL      OBL     5       125.9   753.12  0.22576 133888.0
586 CL      OSL     CTL1    5       109.6   334.72  0.22651 25104.0
587 CL      OSL     CTL2    5       109.6   334.72  0.22651 25104.0
588 CL      OSL     CTL3    5       109.6   334.72  0.22651 25104.0
589 HAL2    CTL2    CL      5       109.50  276.144 0.2163  25104.0
590 HAL3    CTL3    CL      5       109.50  276.144 0.2163  25104.0
591 CTL2    CTL2    CL      5       108.00  435.136 0.0     0.0
592 CTL3    CTL2    CL      5       108.00  435.136 0.0     0.0
593 OSL     CL      CTL3    5       109.0   460.24  0.2326  16736.0
594 OSL     CL      CTL2    5       109.0   460.24  0.2326  16736.0
595 OHL     CL      OBL     5       123.0   418.4   0.2262  175728.0
596 OCL     CL      CTL2    5       118.0   334.72  0.2388  41840.0
597 OCL     CL      CTL3    5       118.0   334.72  0.2388  41840.0
598 OCL     CL      OCL     5       124.0   836.8   0.2225  58576.0
599 OHL     CL      CTL3    5       110.50  460.24  0.0     0.0
600 OHL     CL      CTL2    5       110.50  460.24  0.0     0.0
601 HOL     OHL     CL      5       115.0   460.24  0.0     0.0
602 OSL     CTL1    CTL2    5       110.10  633.4576        0.0     0.0
603 OSL     CTL1    CTL3    5       110.10  633.4576        0.0     0.0
604 OSL     CTL2    CTL1    5       110.10  633.4576        0.0     0.0
605 OSL     CTL2    CTL2    5       110.10  633.4576        0.0     0.0
606 OSL     CTL2    CTL3    5       110.10  633.4576        0.0     0.0
607 HAL2    CTL2    HAL2    5       109.00  297.064 0.1802  4518.72
608 HAL3    CTL3    HAL3    5       108.40  297.064 0.1802  4518.72
609 HAL1    CTL1    OSL     5       109.5   502.08  0.0     0.0
610 HAL2    CTL2    OSL     5       109.5   502.08  0.0     0.0
611 HAL3    CTL3    OSL     5       109.5   502.08  0.0     0.0
612 CTL2    OSL     PL      5       120.0   167.36  0.233   29288.0
613 CTL3    OSL     PL      5       120.0   167.36  0.233   29288.0
614 HOL     OHL     PL      5       115.0   251.04  0.23    33472.0
615 OSL     PL      OSL     5       104.3   669.44  0.0     0.0
616 OSL     PL      O2L     5       111.6   827.5952        0.0     0.0
617 OSL     PL      OHL     5       108.0   402.5008        0.0     0.0
618 O2L     PL      O2L     5       120.0   1004.16 0.0     0.0
619 O2L     PL      OHL     5       108.23  827.5952        0.0     0.0
620 NTL     CTL2    HL      5       109.5   334.72  0.213   22593.6
621 NTL     CTL5    HL      5       109.5   334.72  0.213   22593.6
622 HL      CTL2    HL      5       109.50  200.832 0.1767  23430.4
623 HL      CTL5    HL      5       109.50  200.832 0.1767  23430.4
624 CTL2    NTL     CTL2    5       109.5   502.08  0.2466  21756.8
625 CTL5    NTL     CTL2    5       109.5   502.08  0.2466  21756.8
626 CTL5    NTL     CTL5    5       109.5   502.08  0.2466  21756.8
627 HL      CTL2    CTL2    5       110.10  279.74224       0.2179  18853.104
628 HL      CTL2    CTL3    5       110.10  279.74224       0.2179  18853.104
629 HAL1    CTL1    CTL1    5       110.10  288.696 0.2179  18853.104
630 HAL1    CTL1    CTL2    5       110.10  288.696 0.2179  18853.104
631 HAL1    CTL1    CTL3    5       110.10  288.696 0.2179  18853.104
632 HAL2    CTL2    CTL1    5       110.10  221.752 0.2179  18853.104
633 HAL2    CTL2    CTL2    5       110.10  221.752 0.2179  18853.104
634 HAL2    CTL2    CTL3    5       110.10  289.5328        0.2179  18853.104
635 HAL3    CTL3    CTL1    5       110.10  279.74224       0.2179  18853.104
636 HAL3    CTL3    CTL2    5       110.10  289.5328        0.2179  18853.104
637 HAL3    CTL3    CTL3    5       110.10  313.8   0.2179  18853.104
638 NTL     CTL2    CTL2    5       115.00  566.5136        0.0     0.0
639 NTL     CTL2    CTL3    5       115.00  566.5136        0.0     0.0
640 HCL     NH3L    CTL2    5       109.50  276.144 0.2056  3347.2
641 HCL     NH3L    HCL     5       109.50  343.088 0.0     0.0
642 NH3L    CTL2    CTL2    5       110.00  566.5136        0.0     0.0
643 NH3L    CTL2    HAL2    5       107.50  376.56  0.20836 29288.0
644 CTL1    CTL1    CTL1    5       111.00  446.4328        0.2561  6694.4
645 CTL1    CTL1    CTL2    5       113.50  488.2728        0.2561  9338.688
646 CTL1    CTL1    CTL3    5       108.50  446.4328        0.2561  6694.4
647 CTL1    CTL2    CTL1    5       113.50  488.2728        0.2561  9338.688
648 CTL1    CTL2    CTL2    5       113.50  488.2728        0.2561  9338.688
649 CTL1    CTL2    CTL3    5       113.50  488.2728        0.2561  9338.688
650 CTL2    CTL1    CTL2    5       113.50  488.2728        0.2561  9338.688
651 CTL2    CTL1    CTL3    5       113.50  488.2728        0.2561  9338.688
652 CTL2    CTL2    CTL2    5       113.60  488.2728        0.2561  9338.688
653 CTL2    CTL2    CTL3    5       115.00  485.344 0.2561  6694.4
654 HOL     OHL     CTL1    5       106.00  481.16  0.0     0.0
655 HOL     OHL     CTL2    5       106.00  481.16  0.0     0.0
656 HOL     OHL     CTL3    5       106.00  481.16  0.0     0.0
657 OHL     CTL1    CTL2    5       110.10  633.4576        0.0     0.0
658 OHL     CTL2    CTL1    5       110.10  633.4576        0.0     0.0
659 OHL     CTL2    CTL2    5       110.10  633.4576        0.0     0.0
660 OHL     CTL2    CTL3    5       110.10  633.4576        0.0     0.0
661 OHL     CTL1    HAL1    5       108.89  384.0912        0.0     0.0
662 OHL     CTL2    HAL2    5       108.89  384.0912        0.0     0.0
663 OHL     CTL3    HAL3    5       108.89  384.0912        0.0     0.0
664 O2L     SL      O2L     5       109.47  1087.84 0.245   29288.0
665 O2L     SL      OSL     5       98.0    711.28  0.0     0.0
666 CTL2    OSL     SL      5       109.0   125.52  0.19    22593.6
667 CTL3    OSL     SL      5       109.0   125.52  0.19    22593.6
668 CEL1    CEL1    CTL2    5       123.50  401.664 0.0     0.0
669 CEL1    CEL1    CTL3    5       123.50  401.664 0.0     0.0
670 CEL2    CEL1    CTL2    5       126.00  401.664 0.0     0.0
671 CEL2    CEL1    CTL3    5       125.20  393.296 0.0     0.0
672 HEL1    CEL1    CEL1    5       119.50  435.136 0.0     0.0
673 HEL1    CEL1    CEL2    5       118.00  351.456 0.0     0.0
674 HEL1    CEL1    CTL2    5       116.00  334.72  0.0     0.0
675 HEL1    CEL1    CTL3    5       117.00  184.096 0.0     0.0
676 HEL2    CEL2    CEL1    5       120.50  376.56  0.0     0.0
677 HEL2    CEL2    CEL2    5       120.50  464.424 0.0     0.0
678 HEL2    CEL2    HEL2    5       119.00  158.992 0.0     0.0
679 CEL1    CTL2    CTL2    5       112.20  267.776 0.0     0.0
680 CEL1    CTL2    CTL3    5       112.20  267.776 0.0     0.0
681 HAL2    CTL2    CEL1    5       111.50  376.56  0.0     0.0
682 HAL3    CTL3    CEL1    5       111.50  351.456 0.0     0.0
683 CEL1    CTL2    CEL1    5       114.0   251.04  0.0     0.0
684 ; ### for NH2 terminal
685 H       NH2     CT1     5       111.0000        418.4   0.0     0.0
686 NH2     CT1     C       5       107.0000        418.4   0.0     0.0
687 NH2     CT1     CT1     5       110.0000        566.5136        0.0     0.0
688 NH2     CT1     CT2     5       110.0000        566.5136        0.0     0.0
689 NH2     CT1     CT3     5       110.0000        566.5136        0.0     0.0
690 NH2     CT1     HB      5       109.50  317.984 0.214   41840.0
691 OH1     CD      CT1     5       110.5000        460.24  0.0     0.0
692 ; ### for GLY-NH2 terminal
693 H       NH2     CT2     5       111.0000        418.4   0.0     0.0     ; from HC-NH2-CT2
694 NH2     CT2     C       5       107.0000        418.4   0.0     0.0     ; from NH2-CT1-C
695 ; ###
696 ; ### for COOH terminal
697 OH1     CD      CP1     5       110.5000        460.24  0.0     0.0
698 CT3     CT1     CD      5       108.0000        435.136 0.0     0.0
699 CT1     CT1     CD      5       108.0000        435.136 0.0     0.0
700 ; ### For Heme with His and O2 ligands:
701 OM      FE      NR2     5       180.0000        0.0     0.0     0.0
702 ; ###
705 [ dihedraltypes ]
706 ; i     j       k       l       func    phi0    cp      mult
707 C       CT1     NH1     C       9       180.00  0.8368  1
708 C       CT2     NH1     C       9       180.00  0.8368  1
709 C       N       CP1     C       9       0.00    3.3472  3
710 CA      CA      CA      CA      9       180.00  12.9704 2
711 CA      CPT     CPT     CA      9       180.00  12.9704 2
712 CA      CT2     CT1     C       9       0.00    0.16736 3
713 CA      CY      CPT     CA      9       180.00  12.552  2
714 CA      NY      CPT     CA      9       180.00  12.552  2
715 CC      CP1     N       C       9       0.00    3.3472  3
716 CC      CT1     CT2     CA      9       0.00    0.16736 3
717 CC      CT1     NH1     C       9       180.00  0.8368  1
718 CC      CT2     NH1     C       9       180.00  0.8368  1
719 CD      CP1     N       C       9       180.00  0.0     1
720 CD      CT1     NH1     C       9       180.00  0.8368  1
721 CD      CT2     NH1     C       9       180.00  0.8368  1
722 CE1     CE1     CT3     HA      9       0.00    0.12552 3
723 CE2     CE1     CT2     CT3     9       180.00  2.092   1
724 CE2     CE1     CT2     CT3     9       180.00  5.4392  3
725 CE2     CE1     CT2     HA      9       0.00    0.50208 3
726 CE2     CE1     CT3     HA      9       180.00  0.2092  3
727 CP1     C       N       CP1     9       180.00  11.506  2
728 CP1     C       N       CP1     9       0.00    1.2552  4
729 CP2     CP1     N       C       9       0.00    3.3472  3
730 CP2     CP3     N       C       9       180.00  0.0     3
731 CP2     CP3     N       CP1     9       0.00    0.4184  3
732 CP2     CP3     NP      CP1     9       0.00    0.33472 3
733 CP3     N       C       CP1     9       180.00  11.506  2
734 CP3     N       C       CP1     9       0.00    1.2552  4
735 CP3     N       CP1     C       9       0.00    0.4184  3
736 CP3     N       CP1     CC      9       0.00    0.4184  3
737 CP3     N       CP1     CP2     9       0.00    0.4184  3
738 CP3     NP      CP1     C       9       0.00    0.33472 3
739 CP3     NP      CP1     CC      9       0.00    0.33472 3
740 CP3     NP      CP1     CD      9       0.00    0.33472 3
741 CP3     NP      CP1     CP2     9       0.00    0.33472 3
742 CPH2    NR1     CPH1    CPH1    9       180.00  58.576  2
743 CPH2    NR2     CPH1    CPH1    9       180.00  58.576  2
744 CPH2    NR3     CPH1    CPH1    9       180.00  50.208  2
745 CPT     CA      CA      CA      9       180.00  12.9704 2
746 CPT     CPT     CA      CA      9       180.00  12.9704 2
747 CPT     CPT     CY      CA      9       180.00  16.736  2
748 CPT     CPT     NY      CA      9       180.00  20.92   2
749 CT1     C       N       CP1     9       180.00  11.506  2
750 CT1     C       N       CP1     9       0.00    1.2552  4
751 CT1     C       N       CP3     9       180.00  11.506  2
752 CT1     C       N       CP3     9       0.00    1.2552  4
753 CT1     C       NH1     CT1     9       0.00    6.6944  1
754 CT1     C       NH1     CT1     9       180.00  10.46   2
755 CT1     CT1     NH1     C       9       0.00    7.5312  1
756 CT1     CT2     CA      CA      9       180.00  0.96232 2
757 CT1     CT2     CPH1    CPH1    9       0.00    0.8368  1
758 CT1     CT2     CPH1    CPH1    9       0.00    1.12968 2
759 CT1     CT2     CPH1    CPH1    9       0.00    0.0     3
760 CT1     CT2     CY      CA      9       180.00  0.96232 2
761 CT1     CT2     CY      CPT     9       180.00  0.96232 2
762 CT1     NH1     C       CP1     9       0.00    6.6944  1
763 CT1     NH1     C       CP1     9       180.00  10.46   2
764 CT2     C       N       CP1     9       180.00  11.506  2
765 CT2     C       N       CP1     9       0.00    1.2552  4
766 CT2     C       N       CP3     9       180.00  11.506  2
767 CT2     C       N       CP3     9       0.00    1.2552  4
768 CT2     C       NH1     CT1     9       0.00    6.6944  1
769 CT2     C       NH1     CT1     9       180.00  10.46   2
770 CT2     C       NH1     CT2     9       0.00    6.6944  1
771 CT2     C       NH1     CT2     9       180.00  10.46   2
772 CT2     C       NH1     CT3     9       0.00    6.6944  1
773 CT2     C       NH1     CT3     9       180.00  10.46   2
774 CT2     CA      CA      CA      9       180.00  12.9704 2
775 CT2     CPH1    NR1     CPH2    9       180.00  12.552  2
776 CT2     CPH1    NR2     CPH2    9       180.00  12.552  2
777 CT2     CPH1    NR3     CPH2    9       180.00  10.46   2
778 CT2     CT1     NH1     C       9       0.00    7.5312  1
779 CT2     CT2     CPH1    CPH1    9       0.00    1.6736  1
780 CT2     CT2     CT2     CT2     9       0.00    0.6276  1
781 CT2     CT2     NH1     C       9       0.00    7.5312  1
782 CT2     CY      CPT     CA      9       180.00  12.552  2
783 CT2     CY      CPT     CPT     9       180.00  12.552  2
784 CT2     NH1     C       CP1     9       0.00    6.6944  1
785 CT2     NH1     C       CP1     9       180.00  10.46   2
786 CT2     NH1     C       CT1     9       0.00    6.6944  1
787 CT2     NH1     C       CT1     9       180.00  10.46   2
788 CT2     SM      SM      CT2     9       0.00    4.184   1
789 CT2     SM      SM      CT2     9       0.00    17.1544 2
790 CT2     SM      SM      CT2     9       0.00    3.7656  3
791 CT3     C       N       CP1     9       180.00  11.506  2
792 CT3     C       N       CP1     9       0.00    1.2552  4
793 CT3     C       N       CP3     9       180.00  11.506  2
794 CT3     C       N       CP3     9       0.00    1.2552  4
795 CT3     C       NH1     CT1     9       0.00    6.6944  1
796 CT3     C       NH1     CT1     9       180.00  10.46   2
797 CT3     C       NH1     CT2     9       0.00    6.6944  1
798 CT3     C       NH1     CT2     9       180.00  10.46   2
799 CT3     C       NH1     CT3     9       0.00    6.6944  1
800 CT3     C       NH1     CT3     9       180.00  10.46   2
801 CT3     CA      CA      CA      9       180.00  12.9704 2
802 CT3     CE1     CE2     HE2     9       180.00  21.7568 2
803 CT3     CPH1    NR1     CPH2    9       180.00  12.552  2
804 CT3     CT1     NH1     C       9       0.00    7.5312  1
805 CT3     CT2     CA      CA      9       180.00  0.96232 2
806 CT3     CT2     CPH1    CPH1    9       0.00    0.8368  1
807 CT3     CT2     CPH1    CPH1    9       0.00    1.12968 2
808 CT3     CT2     CPH1    CPH1    9       0.00    0.0     3
809 CT3     CT2     CT2     CT2     9       0.00    0.6276  1
810 CT3     CT2     CT2     CT3     9       0.00    0.6276  1
811 CT3     CT2     CY      CA      9       180.00  0.96232 2
812 CT3     CT2     CY      CPT     9       180.00  0.96232 2
813 CT3     CT2     S       CT3     9       180.00  1.00416 1
814 CT3     CT2     S       CT3     9       0.00    1.54808 3
815 CT3     NH1     C       CP1     9       0.00    6.6944  1
816 CT3     NH1     C       CP1     9       180.00  10.46   2
817 CT3     NH1     C       CT1     9       0.00    6.6944  1
818 CT3     NH1     C       CT1     9       180.00  10.46   2
819 CT3     S       CT2     CT2     9       180.00  1.00416 1
820 CT3     S       CT2     CT2     9       0.00    1.54808 3
821 CT3     SM      SM      CT3     9       0.00    4.184   1
822 CT3     SM      SM      CT3     9       0.00    17.1544 2
823 CT3     SM      SM      CT3     9       0.00    3.7656  3
824 CY      CA      NY      CPT     9       180.00  20.92   2
825 CY      CPT     CA      CA      9       180.00  12.552  2
826 CY      CPT     CPT     CA      9       180.00  41.84   2
827 H       NH1     C       CP1     9       180.00  10.46   2
828 H       NH1     C       CT1     9       180.00  10.46   2
829 H       NH1     C       CT2     9       180.00  10.46   2
830 H       NH1     C       CT3     9       180.00  10.46   2
831 H       NH1     CT1     C       9       0.00    0.0     1
832 H       NH1     CT1     CC      9       0.00    0.0     1
833 H       NH1     CT1     CD      9       0.00    0.0     1
834 H       NH1     CT1     CT1     9       0.00    0.0     1
835 H       NH1     CT1     CT2     9       0.00    0.0     1
836 H       NH1     CT1     CT3     9       0.00    0.0     1
837 H       NH1     CT2     C       9       0.00    0.0     1
838 H       NH1     CT2     CC      9       0.00    0.0     1
839 H       NH1     CT2     CD      9       0.00    0.0     1
840 H       NH1     CT2     CT2     9       0.00    0.0     1
841 H       NH1     CT2     CT3     9       0.00    0.0     1
842 H       NH2     CC      CT1     9       180.00  5.8576  2
843 H       NH2     CC      CT2     9       180.00  5.8576  2
844 H       NH2     CC      CT3     9       180.00  5.8576  2
845 H       NH2     CC      CP1     9       180.00  10.46   2
846 H       NR1     CPH1    CPH1    9       180.00  4.184   2
847 H       NR1     CPH1    CT2     9       180.00  4.184   2
848 H       NR1     CPH1    CT3     9       180.00  4.184   2
849 H       NR3     CPH1    CPH1    9       180.00  5.8576  2
850 H       NR3     CPH1    CT2     9       180.00  12.552  2
851 H       NR3     CPH1    CT3     9       180.00  12.552  2
852 H       NY      CA      CY      9       180.00  3.3472  2
853 H       NY      CPT     CA      9       180.00  3.3472  2
854 H       NY      CPT     CPT     9       180.00  3.3472  2
855 H       OH1     CA      CA      9       180.00  4.14216 2
856 H       OH1     CT1     CT1     9       0.00    5.56472 1
857 H       OH1     CT1     CT1     9       0.00    0.75312 2
858 H       OH1     CT1     CT1     9       0.00    1.33888 3
859 H       OH1     CT1     CT3     9       0.00    5.56472 1
860 H       OH1     CT1     CT3     9       0.00    0.75312 2
861 H       OH1     CT1     CT3     9       0.00    1.33888 3
862 H       OH1     CT2     CT1     9       0.00    5.4392  1
863 H       OH1     CT2     CT1     9       0.00    1.2552  2
864 H       OH1     CT2     CT1     9       0.00    1.75728 3
865 H       OH1     CT2     CT2     9       0.00    5.4392  1
866 H       OH1     CT2     CT2     9       0.00    1.2552  2
867 H       OH1     CT2     CT2     9       0.00    1.75728 3
868 H       OH1     CT2     CT3     9       0.00    5.4392  1
869 H       OH1     CT2     CT3     9       0.00    1.2552  2
870 H       OH1     CT2     CT3     9       0.00    1.75728 3
871 HA      CA      CA      CA      9       180.00  14.644  2
872 HA      CA      CA      CPT     9       180.00  14.644  2
873 HA      CA      CA      HA      9       180.00  10.46   2
874 HA      CA      CPT     CPT     9       180.00  12.552  2
875 HA      CA      CPT     CY      9       180.00  16.736  2
876 HA      CA      CY      CPT     9       180.00  5.0208  2
877 HA      CA      CY      CT2     9       180.00  5.0208  2
878 HA      CA      NY      CPT     9       180.00  12.552  2
879 HA      CA      NY      H       9       180.00  4.184   2
880 HA      CC      NH2     H       9       180.00  5.8576  2
881 HA      CP3     N       C       9       180.00  0.0     3
882 HA      CP3     N       CP1     9       0.00    0.4184  3
883 HA      CP3     NP      CP1     9       0.00    0.33472 3
884 HA      CT1     CT2     CA      9       0.00    0.16736 3
885 HA      CT2     CPH1    CPH1    9       0.00    0.0     3
886 HA      CT2     CY      CA      9       180.00  1.046   2
887 HA      CT2     CY      CPT     9       180.00  1.046   2
888 HA      CT2     NH1     C       9       0.00    0.0     3
889 HA      CT2     NH1     H       9       0.00    0.0     3
890 HA      CT2     S       CT3     9       0.00    1.17152 3
891 HA      CT3     CPH1    CPH1    9       0.00    0.0     3
892 HA      CT3     CS      HA      9       0.00    0.66944 3
893 HA      CT3     CT2     CA      9       0.00    0.16736 3
894 HA      CT3     NH1     C       9       0.00    0.0     3
895 HA      CT3     NH1     H       9       0.00    0.0     3
896 HA      CT3     S       CT2     9       0.00    1.17152 3
897 HA      CY      CA      CPT     9       180.00  5.0208  2
898 HA      CY      CA      HA      9       180.00  5.0208  2
899 HA      CY      CPT     CA      9       180.00  12.552  2
900 HA      CY      CPT     CPT     9       180.00  12.552  2
901 HE1     CE1     CE1     HE1     9       180.00  4.184   2
902 CT3     CE1     CE1     HE1     9       180.00  4.184   2
903 HE1     CE1     CE2     HE2     9       180.00  21.7568 2
904 HE1     CE1     CT2     HA      9       0.00    0.0     3
905 HE1     CE1     CT2     CT3     9       0.00    0.50208 3
906 HE1     CE1     CT3     HA      9       0.00    0.0     3
907 HE2     CE2     CE1     CT2     9       180.00  21.7568 2
908 HE2     CE2     CE1     CPB     9       180.00  21.7568 2
909 HB      CP1     N       C       9       0.00    3.3472  3
910 HB      CP1     N       CP3     9       0.00    0.4184  3
911 HB      CP1     NP      CP3     9       0.00    0.33472 3
912 HB      CT1     NH1     C       9       0.00    0.0     1
913 HB      CT1     NH1     H       9       0.00    0.0     1
914 HB      CT2     NH1     C       9       0.00    0.0     1
915 HB      CT2     NH1     H       9       0.00    0.0     1
916 HB      CT3     NH1     C       9       0.00    0.0     1
917 HB      CT3     NH1     H       9       0.00    0.0     1
918 HC      NH2     CT2     CT2     9       0.00    0.46024 3
919 HC      NH2     CT2     HA      9       0.00    0.46024 3
920 HC      NH2     CT2     HB      9       0.00    0.46024 3
921 HC      NH2     CT2     CD      9       0.00    0.46024 3
922 HC      NP      CP1     C       9       0.00    0.33472 3
923 HC      NP      CP1     CC      9       0.00    0.33472 3
924 HC      NP      CP1     CD      9       0.00    0.33472 3
925 HC      NP      CP1     CP2     9       0.00    0.33472 3
926 HC      NP      CP1     HB      9       0.00    0.33472 3
927 HC      NP      CP3     CP2     9       0.00    0.33472 3
928 HC      NP      CP3     HA      9       0.00    0.33472 3
929 HP      CA      CA      CA      9       180.00  17.5728 2
930 HP      CA      CA      CPT     9       180.00  12.552  2
931 HP      CA      CA      CT2     9       180.00  17.5728 2
932 HP      CA      CA      CT3     9       180.00  17.5728 2
933 HP      CA      CA      HP      9       180.00  10.0416 2
934 HP      CA      CPT     CPT     9       180.00  12.552  2
935 HP      CA      CPT     CY      9       180.00  12.552  2
936 HP      CA      CY      CPT     9       180.00  8.368   2
937 HP      CA      CY      CT2     9       180.00  5.0208  2
938 HP      CA      NY      CPT     9       180.00  8.368   2
939 HP      CA      NY      H       9       180.00  1.6736  2
940 HP      CY      CA      HP      9       180.00  4.184   2
941 HP      CY      CPT     CA      9       180.00  11.7152 2
942 HP      CY      CPT     CPT     9       180.00  11.7152 2
943 HR1     CPH1    CPH1    CT2     9       180.00  4.184   2
944 HR1     CPH1    CPH1    CT3     9       180.00  4.184   2
945 HR1     CPH1    CPH1    HR1     9       180.00  4.184   2
946 HR1     CPH1    NR3     CPH2    9       180.00  10.46   2
947 HR1     CPH1    NR3     H       9       180.00  12.552  2
948 HR1     CPH2    NR1     CPH1    9       180.00  12.552  2
949 HR1     CPH2    NR1     H       9       180.00  4.184   2
950 HR1     CPH2    NR2     CPH1    9       180.00  12.552  2
951 HR2     CPH2    NR3     CPH1    9       180.00  12.552  2
952 HR2     CPH2    NR3     H       9       180.00  0.0     2
953 HR3     CPH1    CPH1    CT2     9       180.00  8.368   2
954 HR3     CPH1    CPH1    CT3     9       180.00  8.368   2
955 HR3     CPH1    CPH1    HR3     9       180.00  8.368   2
956 HR3     CPH1    NR1     CPH2    9       180.00  12.552  2
957 HR3     CPH1    NR1     H       9       180.00  4.184   2
958 HR3     CPH1    NR2     CPH2    9       180.00  12.552  2
959 HS      S       CT2     CT1     9       0.00    1.00416 1
960 HS      S       CT2     CT1     9       0.00    0.6276  2
961 HS      S       CT2     CT1     9       0.00    1.12968 3
962 HS      S       CT2     CT3     9       0.00    1.00416 1
963 HS      S       CT2     CT3     9       0.00    0.6276  2
964 HS      S       CT2     CT3     9       0.00    1.12968 3
965 HS      S       CT2     HA      9       0.00    0.8368  3
966 HS      S       CT3     HA      9       0.00    0.8368  3
967 N       C       CP1     CP2     9       0.00    1.6736  1
968 N       C       CP1     CP2     9       0.00    2.5104  2
969 N       C       CP1     HB      9       180.00  1.6736  1
970 N       C       CP1     HB      9       0.00    2.5104  2
971 N       C       CP1     N       9       0.00    1.2552  1
972 N       C       CP1     N       9       0.00    -1.2552 4
973 N       C       CT1     CT1     9       0.00    0.0     1
974 N       C       CT1     CT2     9       0.00    0.0     1
975 N       C       CT1     CT3     9       0.00    0.0     1
976 N       C       CT1     HB      9       0.00    0.0     1
977 N       C       CT2     HB      9       0.00    0.0     1
978 N       C       CT3     HA      9       0.00    0.0     1
979 N       CT1     CT2     CA      9       0.00    0.16736 3
980 NH1     C       CP1     CP2     9       0.00    1.6736  1
981 NH1     C       CP1     CP2     9       0.00    2.5104  2
982 NH1     C       CP1     HB      9       180.00  1.6736  1
983 NH1     C       CP1     HB      9       0.00    2.5104  2
984 NH1     C       CP1     N       9       0.00    1.2552  1
985 NH1     C       CP1     N       9       0.00    -1.2552 4
986 NH1     C       CT1     CT1     9       0.00    0.0     1
987 NH1     C       CT1     CT2     9       0.00    0.0     1
988 NH1     C       CT1     CT3     9       0.00    0.0     1
989 NH1     C       CT1     HB      9       0.00    0.0     1
990 NH1     C       CT1     NH1     9       0.00    2.5104  1
991 NH1     C       CT2     CT2     9       0.00    0.0     1
992 NH1     C       CT2     HA      9       0.00    0.0     3
993 NH1     C       CT2     HB      9       0.00    0.0     1
994 NH1     C       CT2     NH1     9       0.00    2.5104  1
995 NH1     C       CT3     HA      9       0.00    0.0     3
996 NH1     CT1     C       N       9       0.00    1.6736  1
997 NH1     CT2     C       N       9       0.00    1.6736  1
998 NH2     CC      CP1     CP2     9       0.00    1.6736  1
999 NH2     CC      CP1     CP2     9       0.00    2.5104  2
1000 NH2     CC      CP1     HB      9       180.00  1.6736  1
1001 NH2     CC      CP1     HB      9       0.00    2.5104  2
1002 NH2     CC      CP1     N       9       0.00    1.2552  1
1003 NH2     CC      CP1     N       9       0.00    -1.2552 4
1004 NH2     CC      CT2     HA      9       180.00  0.0     3
1005 NH3     CT1     C       N       9       0.00    1.6736  1
1006 NH3     CT1     C       NH1     9       0.00    2.5104  1
1007 NH3     CT1     CC      NH2     9       0.00    1.6736  1
1008 NH3     CT2     C       N       9       0.00    1.6736  1
1009 NH3     CT2     C       NH1     9       0.00    1.6736  1
1010 NH3     CT2     CC      NH2     9       0.00    1.6736  1
1011 NP      CP1     C       N       9       0.00    1.2552  1
1012 NP      CP1     C       NH1     9       0.00    1.2552  1
1013 NP      CP1     CC      NH2     9       0.00    1.2552  1
1014 NR1     CPH1    CPH1    CT2     9       180.00  12.552  2
1015 NR1     CPH1    CPH1    CT3     9       180.00  12.552  2
1016 NR1     CPH1    CPH1    HR3     9       180.00  12.552  2
1017 NR1     CPH1    CT2     CT1     9       0.00    0.79496 3
1018 NR1     CPH1    CT2     CT2     9       0.00    0.79496 3
1019 NR1     CPH1    CT2     CT3     9       0.00    0.79496 3
1020 NR1     CPH1    CT2     HA      9       0.00    0.79496 3
1021 NR1     CPH1    CT3     HA      9       0.00    0.79496 3
1022 NR1     CPH2    NR2     CPH1    9       180.00  58.576  2
1023 NR2     CPH1    CPH1    CT2     9       180.00  12.552  2
1024 NR2     CPH1    CPH1    CT3     9       180.00  12.552  2
1025 NR2     CPH1    CPH1    HR3     9       180.00  12.552  2
1026 NR2     CPH1    CPH1    NR1     9       180.00  58.576  2
1027 NR2     CPH1    CT2     CT1     9       0.00    0.79496 3
1028 NR2     CPH1    CT2     CT2     9       0.00    0.79496 3
1029 NR2     CPH1    CT2     CT3     9       0.00    0.79496 3
1030 NR2     CPH1    CT2     HA      9       0.00    0.79496 3
1031 NR2     CPH1    CT3     HA      9       0.00    0.79496 3
1032 NR2     CPH2    NR1     CPH1    9       180.00  58.576  2
1033 NR2     CPH2    NR1     H       9       180.00  4.184   2
1034 NR3     CPH1    CPH1    CT2     9       180.00  10.46   2
1035 NR3     CPH1    CPH1    CT3     9       180.00  10.46   2
1036 NR3     CPH1    CPH1    HR1     9       180.00  10.46   2
1037 NR3     CPH1    CPH1    NR3     9       180.00  50.208  2
1038 NR3     CPH1    CT2     CT1     9       0.00    0.79496 3
1039 NR3     CPH1    CT2     CT2     9       0.00    0.79496 3
1040 NR3     CPH1    CT2     CT3     9       0.00    0.79496 3
1041 NR3     CPH1    CT2     HA      9       0.00    0.79496 3
1042 NR3     CPH1    CT3     HA      9       0.00    0.79496 3
1043 NR3     CPH2    NR3     CPH1    9       180.00  50.208  2
1044 NR3     CPH2    NR3     H       9       180.00  5.8576  2
1045 NY      CA      CY      CPT     9       180.00  16.736  2
1046 NY      CA      CY      CT2     9       180.00  14.644  2
1047 NY      CA      CY      HA      9       180.00  14.644  2
1048 NY      CA      CY      HP      9       180.00  14.644  2
1049 NY      CPT     CA      CA      9       180.00  11.7152 2
1050 NY      CPT     CA      HA      9       180.00  16.736  2
1051 NY      CPT     CA      HP      9       180.00  12.552  2
1052 NY      CPT     CPT     CA      9       180.00  41.84   2
1053 NY      CPT     CPT     CY      9       180.00  20.92   2
1054 O       C       CP1     CP2     9       180.00  1.6736  1
1055 O       C       CP1     CP2     9       0.00    2.5104  2
1056 O       C       CP1     HB      9       0.00    1.6736  1
1057 O       C       CP1     HB      9       0.00    2.5104  2
1058 O       C       CP1     N       9       0.00    -1.2552 4
1059 O       C       CT1     CT1     9       0.00    5.8576  1
1060 O       C       CT1     CT2     9       0.00    5.8576  1
1061 O       C       CT1     CT3     9       0.00    5.8576  1
1062 O       C       CT1     HB      9       0.00    0.0     1
1063 O       C       CT1     NH1     9       0.00    0.0     1
1064 O       C       CT1     NH3     9       0.00    0.0     1
1065 O       C       CT2     CT2     9       0.00    5.8576  1
1066 O       C       CT2     HA      9       180.00  0.0     3
1067 O       C       CT2     HB      9       0.00    0.0     1
1068 O       C       CT2     NH1     9       0.00    0.0     1
1069 O       C       CT2     NH3     9       0.00    0.0     1
1070 O       C       CT3     HA      9       180.00  0.0     3
1071 O       C       N       CP1     9       180.00  11.506  2
1072 O       C       N       CP1     9       0.00    1.2552  4
1073 O       C       N       CP3     9       180.00  11.506  2
1074 O       C       N       CP3     9       0.00    1.2552  4
1075 O       C       NH1     CT1     9       180.00  10.46   2
1076 O       C       NH1     CT2     9       180.00  10.46   2
1077 O       C       NH1     CT3     9       180.00  10.46   2
1078 O       C       NH1     H       9       180.00  10.46   2
1079 O       CC      CP1     CP2     9       180.00  1.6736  1
1080 O       CC      CP1     CP2     9       0.00    2.5104  2
1081 O       CC      CP1     HB      9       0.00    1.6736  1
1082 O       CC      CP1     HB      9       0.00    2.5104  2
1083 O       CC      CP1     N       9       0.00    -1.2552 4
1084 O       CC      CT2     HA      9       180.00  0.0     3
1085 O       CC      NH2     H       9       180.00  5.8576  2
1086 OB      CD      OS      CT2     9       180.00  4.03756 1
1087 OB      CD      OS      CT2     9       180.00  16.1084 2
1088 OB      CD      OS      CT3     9       180.00  4.03756 1
1089 OB      CD      OS      CT3     9       180.00  16.1084 2
1090 OC      CA      CA      CA      9       180.00  12.9704 2
1091 OC      CA      CA      HP      9       180.00  17.5728 2
1092 OC      CC      CP1     CP2     9       0.00    0.66944 3
1093 OC      CC      CP1     HB      9       0.00    0.66944 3
1094 OC      CC      CP1     N       9       0.00    0.66944 3
1095 OC      CC      CP1     NP      9       0.00    0.66944 3
1096 OC      CC      CT1     NH3     9       180.00  13.3888 2
1097 OC      CC      CT2     NH3     9       180.00  13.3888 2
1098 OH1     CA      CA      CA      9       180.00  12.9704 2
1099 OH1     CA      CA      HP      9       180.00  17.5728 2
1100 S       CT2     CT2     HA      9       0.00    0.04184 3
1101 SM      CT2     CT2     HA      9       0.00    0.04184 3
1102 SM      SM      CT2     CT1     9       0.00    1.29704 3
1103 SM      SM      CT2     CT2     9       0.00    1.29704 3
1104 SM      SM      CT2     HA      9       0.00    0.661072        3
1105 SM      SM      CT3     HA      9       0.00    0.661072        3
1106 SS      CS      CT3     HA      9       0.00    0.6276  3
1107 OBL     CL      CTL2    HAL2    9       180.00  0.0     6
1108 OBL     CL      CTL3    HAL3    9       180.00  0.0     6
1109 OSL     CL      CTL2    HAL2    9       180.00  0.0     6
1110 OSL     CL      CTL3    HAL3    9       180.00  0.0     6
1111 OBL     CL      OSL     CTL1    9       180.00  4.03756 1
1112 OBL     CL      OSL     CTL1    9       180.00  16.1084 2
1113 OBL     CL      OSL     CTL2    9       180.00  4.03756 1
1114 OBL     CL      OSL     CTL2    9       180.00  16.1084 2
1115 OBL     CL      OSL     CTL3    9       180.00  4.03756 1
1116 OBL     CL      OSL     CTL3    9       180.00  16.1084 2
1117 HAL2    CTL2    CL      OHL     9       180.00  0.0     6
1118 HAL3    CTL3    CL      OHL     9       180.00  0.0     6
1119 OSL     PL      OSL     CTL2    9       180.00  5.0208  1
1120 OSL     PL      OSL     CTL2    9       180.00  0.4184  2
1121 OSL     PL      OSL     CTL2    9       180.00  0.4184  3
1122 O2L     PL      OSL     CTL2    9       0.00    0.4184  3
1123 OSL     PL      OSL     CTL3    9       180.00  5.0208  1
1124 OSL     PL      OSL     CTL3    9       180.00  0.4184  2
1125 OSL     PL      OSL     CTL3    9       180.00  0.4184  3
1126 O2L     PL      OSL     CTL3    9       0.00    0.4184  3
1127 OHL     PL      OSL     CTL2    9       0.00    3.9748  2
1128 OHL     PL      OSL     CTL2    9       0.00    2.092   3
1129 OHL     PL      OSL     CTL3    9       0.00    3.9748  2
1130 OHL     PL      OSL     CTL3    9       0.00    2.092   3
1131 CTL3    CTL2    OSL     CL      9       180.00  2.9288  1
1132 CTL2    CTL2    OSL     CL      9       180.00  2.9288  1
1133 CTL3    CTL1    OSL     CL      9       180.00  2.9288  1
1134 CTL2    CTL1    OSL     CL      9       180.00  2.9288  1
1135 CTL1    CTL2    CL      OSL     9       180.00  -0.6276 1
1136 CTL1    CTL2    CL      OSL     9       180.00  2.21752 2
1137 CTL2    CTL2    CL      OSL     9       180.00  -0.6276 1
1138 CTL2    CTL2    CL      OSL     9       180.00  2.21752 2
1139 CTL3    CTL2    CL      OSL     9       180.00  -0.6276 1
1140 CTL3    CTL2    CL      OSL     9       180.00  2.21752 2
1141 NH3L    CTL2    CTL2    OHL     9       180.00  2.9288  1
1142 NH3L    CTL2    CTL2    OSL     9       180.00  2.9288  1
1143 NTL     CTL2    CTL2    OHL     9       180.00  17.9912 1
1144 NTL     CTL2    CTL2    OHL     9       180.00  -1.6736 3
1145 NTL     CTL2    CTL2    OSL     9       180.00  13.8072 1
1146 NTL     CTL2    CTL2    OSL     9       180.00  -1.6736 3
1147 CTL3    CTL2    CTL2    CTL3    9       180.00  0.4184  2
1148 CTL3    CTL2    CTL2    CTL3    9       0.00    0.6276  4
1149 CTL3    CTL2    CTL2    CTL3    9       180.00  0.4184  6
1150 CTL2    CTL2    CTL2    CTL3    9       180.00  0.4184  2
1151 CTL2    CTL2    CTL2    CTL3    9       0.00    0.6276  4
1152 CTL2    CTL2    CTL2    CTL3    9       180.00  0.4184  6
1153 CTL2    CTL2    CTL2    CTL2    9       180.00  0.4184  2
1154 CTL2    CTL2    CTL2    CTL2    9       0.00    0.6276  4
1155 CTL2    CTL2    CTL2    CTL2    9       180.00  0.4184  6
1156 HAL3    CTL3    OSL     SL      9       0.00    0.0     3
1157 CTL2    OSL     SL      O2L     9       0.00    0.0     3
1158 CTL3    OSL     SL      O2L     9       0.00    0.0     3
1159 HEL1    CEL1    CEL1    HEL1    9       180.00  4.184   2
1160 CTL3    CEL1    CEL1    HEL1    9       180.00  4.184   2
1161 CTL2    CEL1    CEL2    HEL2    9       180.00  21.7568 2
1162 CTL3    CEL1    CEL2    HEL2    9       180.00  21.7568 2
1163 HEL1    CEL1    CEL2    HEL2    9       180.00  21.7568 2
1164 CEL1    CEL1    CTL2    HAL2    9       0.00    0.12552 3
1165 CEL1    CEL1    CTL3    HAL3    9       0.00    0.12552 3
1166 CEL1    CEL1    CTL2    CTL2    9       180.00  2.092   1
1167 CEL1    CEL1    CTL2    CTL2    9       180.00  5.4392  3
1168 CEL1    CEL1    CTL2    CTL3    9       180.00  2.092   1
1169 CEL1    CEL1    CTL2    CTL3    9       180.00  5.4392  3
1170 CEL2    CEL1    CTL2    CTL2    9       180.00  2.092   1
1171 CEL2    CEL1    CTL2    CTL2    9       180.00  5.4392  3
1172 CEL2    CEL1    CTL2    CTL3    9       180.00  2.092   1
1173 CEL2    CEL1    CTL2    CTL3    9       180.00  5.4392  3
1174 CEL2    CEL1    CTL2    HAL2    9       0.00    0.50208 3
1175 CEL2    CEL1    CTL3    HAL3    9       180.00  0.2092  3
1176 HEL1    CEL1    CTL2    CTL2    9       0.00    0.50208 3
1177 HEL1    CEL1    CTL2    CTL3    9       0.00    0.50208 3
1178 HEL1    CEL1    CTL2    HAL2    9       0.00    0.0     3
1179 HEL1    CEL1    CTL3    HAL3    9       0.00    0.0     3
1180 CEL2    CEL1    CTL2    CEL1    9       180.00  5.0208  1
1181 CEL2    CEL1    CTL2    CEL1    9       180.00  1.6736  2
1182 CEL2    CEL1    CTL2    CEL1    9       180.00  5.4392  3
1183 CEL1    CTL2    CEL1    HEL1    9       0.00    0.0     2
1184 CEL1    CTL2    CEL1    HEL1    9       0.00    0.0     3
1185 CEL1    CEL1    CTL2    CEL1    9       180.00  4.184   1
1186 CEL1    CEL1    CTL2    CEL1    9       0.00    0.4184  2
1187 CEL1    CEL1    CTL2    CEL1    9       180.00  1.2552  3
1188 CEL1    CEL1    CTL2    CEL1    9       0.00    0.8368  4
1189 CTL3    CTL2    CTL2    CL      9       180.00  0.87864 1
1190 CTL3    CTL2    CTL2    CL      9       0.00    1.63176 2
1191 CTL3    CTL2    CTL2    CL      9       180.00  1.4644  3
1192 CTL3    CTL2    CTL2    CL      9       0.00    0.46024 4
1193 CTL3    CTL2    CTL2    CL      9       180.00  0.37656 6
1194 CTL2    CTL2    CTL2    CL      9       180.00  0.87864 1
1195 CTL2    CTL2    CTL2    CL      9       0.00    1.63176 2
1196 CTL2    CTL2    CTL2    CL      9       180.00  1.4644  3
1197 CTL2    CTL2    CTL2    CL      9       0.00    0.46024 4
1198 CTL2    CTL2    CTL2    CL      9       180.00  0.37656 6
1199 ; ### for COOH terminal
1200 CP3     N       CP1     CD      9       0.00    0.4184  3
1201 ; ### for NH2 terminal
1202 H       NH2     CT1     C       9       0.00    0.0     1
1203 H       NH2     CT1     CT1     9       0.00    0       1       ; from H-NH1-CT1-CT1
1204 H       NH2     CT1     CT2     9       0.00    0.46024 3       ; correct?
1205 H       NH2     CT1     CT3     9       0.00    0.0     1
1206 H       NH2     CT1     HB      9       0.00    0.46024 3
1207 NH2     CT1     C       O       9       0.00    0.0     1
1208 NH2     CT1     C       NH1     9       0.00    2.5104  1       ; from NH1-C-CT1-NH1 and NH3-CT1-C-NH1
1209 NH2     CT1     C       N       9       0.00    1.6736  1       ; from NH1-CT2-C-N and NH3-CT1-C-N
1210 ; ### for GLY-NH2 terminal
1211 H       NH2     CT2     HB      9       0.00    0.46024 3       ; from H-NH2-CT1-HB
1212 H       NH2     CT2     C       9       0.00    0.0     1       ; from H-NH2-CT1-C
1213 NH2     CT2     C       O       9       0.00    0.0     1       ; from NH2-CT1-C-O
1214 NH2     CT2     C       NH1     9       0.00    2.5104  1       ; from NH1-C-CT1-NH1 and NH3-CT1-C-NH1
1215 NH2     CT2     C       N       9       0.00    1.6736  1       ; from NH1-CT2-C-N and NH3-CT1-C-N
1216 ; ###
1217 X       FE      SS      X       9       0.00    0.0     4
1218 X       CS      SS      X       9       0.20    0.0     3
1219 X       C       NC2     X       9       180.00  9.414   2
1220 X       CD      OH1     X       9       180.00  8.5772  2
1221 X       CD      OS      X       9       180.00  8.5772  2
1222 X       CE1     CE1     X       9       0.00    0.6276  1
1223 X       CE1     CE1     X       9       180.00  35.564  2
1224 X       CE2     CE2     X       9       180.00  20.5016 2
1225 X       CP1     C       X       9       180.00  0.0     6
1226 X       CP1     CC      X       9       180.00  0.0     6
1227 X       CP1     CD      X       9       180.00  0.0     6
1228 X       CP1     CP2     X       9       0.00    0.58576 3
1229 X       CP2     CP2     X       9       0.00    0.66944 3
1230 X       CP3     CP2     X       9       0.00    0.58576 3
1231 X       CPA     CPB     X       9       0.00    0.0     2
1232 X       CPA     CPM     X       9       0.00    0.0     2
1233 X       CPB     CE1     X       9       180.00  12.552  2
1234 X       CPB     CPB     X       9       0.00    0.0     2
1235 X       CPB     CT2     X       9       0.00    0.0     6
1236 X       CPB     CT3     X       9       0.00    0.0     6
1237 X       CPT     CPT     X       9       180.00  0.0     2
1238 X       CT1     CC      X       9       180.00  0.2092  6
1239 X       CT1     CD      X       9       180.00  0.0     6
1240 X       CT1     CT1     X       9       0.00    0.8368  3
1241 X       CT1     CT2     X       9       0.00    0.8368  3
1242 X       CT1     CT3     X       9       0.00    0.8368  3
1243 X       CT1     NH3     X       9       0.00    0.4184  3
1244 X       CT1     OH1     X       9       0.00    0.58576 3
1245 X       CT1     OS      X       9       0.00    -0.4184 3
1246 X       CT2     CA      X       9       0.00    0.0     6
1247 X       CT2     CC      X       9       180.00  0.2092  6
1248 X       CT2     CD      X       9       180.00  0.0     6
1249 X       CT2     CT2     X       9       0.00    0.81588 3
1250 X       CT2     CT3     X       9       0.00    0.66944 3
1251 X       CT2     NC2     X       9       180.00  0.0     6
1252 X       CT2     NH3     X       9       0.00    0.4184  3
1253 X       CT2     OH1     X       9       0.00    0.58576 3
1254 X       CT2     OS      X       9       0.00    -0.4184 3
1255 X       CT3     CA      X       9       0.00    0.0     6
1256 X       CT3     CC      X       9       180.00  0.2092  6
1257 X       CT3     CD      X       9       180.00  0.0     6
1258 X       CT3     CT3     X       9       0.00    0.64852 3
1259 X       CT3     NC2     X       9       180.00  0.0     6
1260 X       CT3     NH2     X       9       0.00    0.46024 3
1261 X       CT3     NH3     X       9       0.00    0.37656 3
1262 X       CT3     OH1     X       9       0.00    0.58576 3
1263 X       CT3     OS      X       9       0.00    -0.4184 3
1264 X       FE      CM      X       9       0.00    0.2092  4
1265 X       FE      NPH     X       9       0.00    0.0     2
1266 ; ### For Heme bound to HSD
1267 ; Charmm patch PHEM defines only one dihedral term: 1CD2  1NE2  2FE  2NA
1268 ;                                                   (1 = HSD, 2 = HEME)
1269 ; In gromacs we cannot differentiate between NA, NB, NC, and ND of the heme.
1270 ;   (values cannot be attributed in the rtp file for dihedrals involving atoms
1271 ;   from other residues)
1272 ; So we divide the original force constant (0.2092) by four.  
1273 NPH     FE      NR2     CPH1    9       0.00    0.0     4  ; This one is always zero.
1274 NPH     FE      NR2     CPH2    9       0.00    0.0523  4  ; This is X-FE-NR2-X from charmm
1275 FE      NR2     CPH1    X       9       0.00    0.0     1
1276 FE      NR2     CPH2    X       9       0.00    0.0     1
1277 ; ### For Heme bound to O2 or CO, we dont have to do this trick, because the force constant is 0.0
1278 X       FE      OM      X       9       0.00    0.0     4
1279 OM      FE      NR2     X       9       0.00    0.0     1
1280 CM      FE      NR2     X       9       0.00    0.0     1
1281 ; ###
1282 X       NPH     CPA     X       9       0.00    0.0     2
1283 X       CTL1    OHL     X       9       0.00    0.58576 3
1284 X       CTL2    OHL     X       9       0.00    0.58576 3
1285 X       CTL3    OHL     X       9       0.00    0.58576 3
1286 X       CL      OSL     X       9       180.00  8.5772  2
1287 X       CTL2    CL      X       9       180.00  0.2092  6
1288 X       CTL3    CL      X       9       180.00  0.2092  6
1289 X       CL      OHL     X       9       180.00  8.5772  2
1290 X       OHL     PL      X       9       0.00    1.2552  3
1291 X       CTL1    OSL     X       9       0.00    0.0     3
1292 X       CTL2    OSL     X       9       0.00    0.0     3
1293 X       CTL3    OSL     X       9       0.00    0.0     3
1294 X       CTL2    NTL     X       9       0.00    1.08784 3
1295 X       CTL5    NTL     X       9       0.00    0.96232 3
1296 X       CTL2    NH3L    X       9       0.00    0.4184  3
1297 X       CTL1    CTL1    X       9       0.00    0.8368  3
1298 X       CTL1    CTL2    X       9       0.00    0.8368  3
1299 X       CTL1    CTL3    X       9       0.00    0.8368  3
1300 X       CTL2    CTL2    X       9       0.00    0.79496 3
1301 X       CTL2    CTL3    X       9       0.00    0.66944 3
1302 X       CTL3    CTL3    X       9       0.00    0.63806 3
1303 X       CEL1    CEL1    X       9       0.00    0.6276  1
1304 X       CEL1    CEL1    X       9       180.00  35.564  2
1305 X       CEL2    CEL2    X       9       180.00  20.5016 2
1307 [ dihedraltypes ]
1308 ; i     j       k       l       func    q0      cq
1309 CPB     CPA     NPH     CPA     2       0.0000  174.0544
1310 HA      CPA     CPA     CPM     2       0.0000  246.0192
1311 HE2     HE2     CE2     CE2     2       0.00    25.104
1312 HR1     NR1     NR2     CPH2    2       0.0000  4.184
1313 HR1     NR2     NR1     CPH2    2       0.0000  4.184
1314 HR3     CPH1    NR1     CPH1    2       0.0000  4.184
1315 HR3     CPH1    NR2     CPH1    2       0.0000  4.184
1316 HR3     CPH1    NR3     CPH1    2       0.0000  8.368
1317 HR3     NR1     CPH1    CPH1    2       0.0000  4.184
1318 HR3     NR2     CPH1    CPH1    2       0.0000  4.184
1319 N       C       CP1     CP3     2       0.0000  0.0
1320 NPH     CPA     CPA     FE      2       0.0000  1149.7632
1321 NPH     CPA     CPB     CPB     2       0.0000  339.7408
1322 NPH     CPA     CPM     CPA     2       0.0000  153.1344
1323 NPH     CPM     CPB     CPA     2       0.0000  273.6336
1324 NR1     CPH1    CPH2    H       2       0.0000  3.7656
1325 NR1     CPH2    CPH1    H       2       0.0000  3.7656
1326 NR3     CPH1    CPH2    H       2       0.0000  10.0416
1327 NR3     CPH2    CPH1    H       2       0.0000  10.0416
1328 NY      CA      CY      CPT     2       0.0000  836.8
1329 O       CP1     NH2     CC      2       0.0000  376.56
1330 O       CT1     NH2     CC      2       0.0000  376.56
1331 O       CT2     NH2     CC      2       0.0000  376.56
1332 O       CT3     NH2     CC      2       0.0000  376.56
1333 O       HA      NH2     CC      2       0.0000  376.56
1334 O       N       CT2     CC      2       0.0000  1004.16
1335 O       NH2     CP1     CC      2       0.0000  376.56
1336 O       NH2     CT1     CC      2       0.0000  376.56
1337 O       NH2     CT2     CC      2       0.0000  376.56
1338 O       NH2     CT3     CC      2       0.0000  376.56
1339 O       NH2     HA      CC      2       0.0000  376.56
1340 HEL2    HEL2    CEL2    CEL2    2       0.00    25.104
1341 CPB     X       X       CE1     2       0.0000  753.12
1342 CT2     X       X       CPB     2       0.0000  753.12
1343 CT3     X       X       CPB     2       0.0000  753.12
1344 NC2     X       X       C       2       0.0000  334.72
1345 NH1     X       X       H       2       0.0000  167.36
1346 NH2     X       X       H       2       0.0000  33.472
1347 O       X       X       C       2       0.0000  1004.16
1348 OB      X       X       CD      2       0.0000  836.8
1349 OC      X       X       CC      2       0.0000  803.328
1350 CC      X       X       CT1     2       0.0000  803.328
1351 CC      X       X       CT2     2       0.0000  803.328
1352 CC      X       X       CT3     2       0.0000  803.328
1353 OBL     X       X       CL      2       0.00    836.8
1354 OCL     X       X       CL      2       0.00    803.328