share/top/dmso.itp

   1 [ moleculetype ]
   2 ; name  nrexcl
   3 DMSO    2
   4
   5 [ atoms ]
   6 ;   nr    type   resnr  residu  atom    cgnr    charge
   7     1     SD     1      DMSO    SD      1        0.139
   8     2     CD     1      DMSO    CD1     1        0.16
   9     3     OD     1      DMSO    OD      1       -0.459
  10     4     CD     1      DMSO    CD2     1        0.16
  11
  12 [ bonds ]
  13 ;  ai    aj funct          b0       kb
  14     1     2     1       0.195   376560  ; kb from Methionine
  15     1     3     1       0.153   502080  ; kb from C=O bond
  16     1     4     1       0.195   376560
  17
  18 [ angles ]
  19 ;  ai    aj    ak   funct        theta       kt
  20 3       1       2       1       106.75  460.240
  21 3       1       4       1       106.75  460.240
  22 2       1       4       1        97.40  460.240 ; kt from Methionine
  23
  24 [ dihedrals ]
  25 ;  ai  aj      ak      al   funct     xi         kxi
  26 1       2       4       3       2 35.264     334.720    ; default params