share/top/ffG43a2-n.tdb

   1 [ None ]
   2
   3 [ NH3+ ]
   4 [ replace ]
   5 N       N       NL      14.0067 0.129
   6 CA      CA      CH1     13.0190 0.127   0
   7 [ add ]
   8 3       4       N       CA      C
   9         H       H       1.008   0.248
  10 [ delete ]
  11 H
  12 [ bonds ]
  13 N       H1      gb_2
  14 N       H2      gb_2
  15 N       H3      gb_2
  16 [ angles ]
  17 H1      N       H2      ga_9
  18 H2      N       H3      ga_9
  19 H3      N       H1      ga_9
  20 CA      N       H1      ga_10
  21 CA      N       H2      ga_10
  22 CA      N       H3      ga_10
  23 [ dihedrals ]
  24 H1      N       CA      C       gd_14
  25
  26 [ NH2 ]
  27 [ replace ]
  28 N       N       NL      14.0067 -0.83
  29 [ add ]
  30 2       4       N       CA      C
  31         H       H       1.008   0.415
  32 [ delete ]
  33 H
  34 [ bonds ]
  35 N       H1      gb_2
  36 N       H2      gb_2
  37 [ angles ]
  38 H1      N       H2      ga_9
  39 CA      N       H1      ga_10
  40 CA      N       H2      ga_10
  41 [ dihedrals ]
  42 H1      N       CA      C       gd_14
  43
  44 [ PRO-NH2+ ]
  45 [ replace ]
  46 N       N       NT      14.0067 0.2
  47 [ add ]
  48 2       4       N       CA      C
  49         H       H       1.008   0.4
  50 [ bonds ]
  51 N       H1      gb_2
  52 N       H2      gb_2
  53 [ angles ]
  54 ; we're not sure about these parameters,
  55 ; they were inferred from the comments in the ffG43a1bon.itp
  56 H1      N       H2      ga_9
  57 CA      N       H1      ga_10
  58 CA      N       H2      ga_10
  59 CD      N       H1      ga_10
  60 CD      N       H2      ga_10
  61 [ dihedrals ]
  62 H1      N       CA      C       gd_14
  63
  64 [ PRO-NH ]
  65 [ replace ]
  66 N       N       N       14.0067 -0.28
  67 [ add ]
  68 1       4       N       CA      C
  69         H       H       1.008   0.28
  70 [ bonds ]
  71 N       H       gb_2
  72 [ angles ]
  73 CA      N       H       ga_10
  74 CD      N       H       ga_10
  75
  76 [ GLY-NH3+ ]
  77 [ replace ]
  78 N       N       NL      14.0067 0.129
  79 CA      CA      CH2     14.0270 0.127
  80 [ add ]
  81 3       4       N       CA      C
  82         H       H       1.008   0.248
  83 [ bonds ]
  84 N       H1      gb_2
  85 N       H2      gb_2
  86 N       H3      gb_2
  87 [ angles ]
  88 H1      N       H2      ga_9
  89 H2      N       H3      ga_9
  90 H3      N       H1      ga_9
  91 CA      N       H1      ga_10
  92 CA      N       H2      ga_10
  93 CA      N       H3      ga_10
  94 [ dihedrals ]
  95 H1      N       CA      C       gd_14
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