changed reading hint
[gromacs/adressmacs.git] / share / top / ffgmx2.rtp
blobeba7c3183442d9751ddd680bb731c162b5ca4c2d
1 [ bondedtypes ]
2 ; bonds  angles  dihedrals  impropers
3      1       1          1          2
5 [ ACE ]
6  [ atoms ]
7     CA    C3   0.000     1
8    HA1    HC   0.000     1
9    HA2    HC   0.000     1
10    HA3    HC   0.000     1
11      C     C   0.380     2
12      O     O  -0.380     2
13  [ bonds ]
14     CA   HA1
15     CA   HA2
16     CA   HA3
17     CA     C
18      C     O
20 [ ALA ]
21  [ atoms ]
22      N     N  -0.280     0
23      H     H   0.280     0
24     CA    C1   0.000     1
25     HA    HC   0.000     1
26     CB    C3   0.000     2
27    HB1    HC   0.000     2
28    HB2    HC   0.000     2
29    HB3    HC   0.000     2
30      C     C   0.380     3
31      O     O  -0.380     3
32  [ bonds ]
33      N     H
34      N    CA
35     CA    HA
36     CA    CB
37     CA     C
38     CB   HB1
39     CB   HB2
40     CB   HB3
41      C     O
42     -C     N
43  [ impropers ]
44      N    -C    CA     H
45     -C   -CA     N    -O
46     CA     N     C    CB
48 [ ARG ]
49  [ atoms ]
50      N     N  -0.280     0
51      H     H   0.280     0
52     CA    C1   0.000     1
53     HA    HC   0.000     1
54     CB    C2   0.000     2
55    HB1    HC   0.000     2
56    HB2    HC   0.000     2
57     CG    C2   0.000     3
58    HG1    HC   0.000     3
59    HG2    HC   0.000     3
60     CD    C2   0.090     4
61    HD1    HC   0.000     4
62    HD2    HC   0.000     4
63     NE    NE  -0.110     4
64    HE     H   0.240     4
65     CZ     C   0.340     4
66    NH1    NZ  -0.260     4
67   HH11     H   0.240     4
68   HH12     H   0.240     4
69    NH2    NZ  -0.260     4
70   HH21     H   0.240     4
71   HH22     H   0.240     4
72      C     C   0.380     5
73      O     O  -0.380     5
74  [ bonds ]
75      N     H
76      N    CA
77     CA    HA
78     CA    CB
79     CA     C
80     CB   HB1
81     CB   HB2
82     CB    CG
83     CG   HG1
84     CG   HG2
85     CG    CD
86     CD   HD1
87     CD   HD2
88     CD    NE
89     NE   HE
90     NE    CZ
91     CZ   NH1
92     CZ   NH2
93    NH1  HH11
94    NH1  HH12
95    NH2  HH21
96    NH2  HH22
97      C     O
98     -C     N
99  [ impropers ]
100      N    -C    CA     H
101     -C   -CA     N    -O
102     CA     N     C    CB
103     NE    CD    CZ    HE
104     CZ   NH1   NH2    NE
105    NH1  HH11  HH12    CZ
106    NH2  HH21  HH22    CZ
108 [ ASN ]
109  [ atoms ]
110      N     N  -0.280     0
111      H     H   0.280     0
112     CA    C1   0.000     1
113     HA    HC   0.000     1
114     CB    C2   0.000     2
115    HB1    HC   0.000     2
116    HB2    HC   0.000     2
117     CG     C   0.380     3
118    OD1     O  -0.380     3
119    ND2    NT  -0.830     4
120   HD21     H   0.415     4
121   HD22     H   0.415     4
122      C     C   0.380     5
123      O     O  -0.380     5
124  [ bonds ]
125      N     H
126      N    CA
127     CA    HA
128     CA    CB
129     CA     C
130     CB   HB1
131     CB   HB2
132     CB    CG
133     CG   OD1
134     CG   ND2
135    ND2  HD21
136    ND2  HD22
137      C     O
138     -C     N
139  [ impropers ]
140      N    -C    CA     H
141     -C   -CA     N    -O
142     CA     N     C    CB
143     CG   OD1   ND2    CB
144    ND2  HD21  HD22    CG
146 [ ASP ]
147  [ atoms ]
148      N     N  -0.280     0
149      H     H   0.280     0
150     CA    C1   0.000     1
151     HA    HC   0.000     1
152     CB    C2   0.000     2
153    HB1    HC   0.000     2
154    HB2    HC   0.000     2
155     CG     C   0.270     3
156    OD1    OM  -0.635     3
157    OD2    OM  -0.635     3
158      C     C   0.380     4
159      O     O  -0.380     4
160  [ bonds ]
161      N     H
162      N    CA
163     CA    HA
164     CA    CB
165     CA     C
166     CB   HB1
167     CB   HB2
168     CB    CG
169     CG   OD1
170     CG   OD2
171      C     O
172     -C     N
173  [ impropers ]
174      N    -C    CA     H
175     -C   -CA     N    -O
176     CA     N     C    CB
177     CG   OD1   OD2    CB
179 [ ASPH ]
180  [ atoms ]
181      N     N  -0.280     0
182      H     H   0.280     0
183     CA    C1   0.000     1
184     HA    HC   0.000     1
185     CB    C2   0.000     2
186    HB1    HC   0.000     2
187    HB2    HC   0.000     2
188     CG     C   0.530     3
189    OD1     O  -0.380     3
190    OD2    OA  -0.548     3
191    HD2    HO   0.398     3
192      C     C   0.380     4
193      O     O  -0.380     4
194  [ bonds ]
195      N     H
196      N    CA
197     CA    HA
198     CA    CB
199     CA     C
200     CB   HB1
201     CB   HB2
202     CB    CG
203     CG   OD1
204     CG   OD2
205    OD2   HD2
206      C     O
207     -C     N
208  [ impropers ]
209      N    -C    CA     H
210     -C   -CA     N    -O
211     CA     N     C    CB
212     CG   OD1   OD2    CB
214 [ CYS2 ]
215  [ atoms ]
216      N     N  -0.280     0
217      H     H   0.280     0
218     CA    C1   0.000     1
219     HA    HC   0.000     1
220     CB    C2   0.000     2
221    HB1    HC   0.000     2
222    HB2    HC   0.000     2
223     SG     S   0.000     3
224      C     C   0.380     4
225      O     O  -0.380     4
226  [ bonds ]
227      N     H
228      N    CA
229     CA    HA
230     CA    CB
231     CA     C
232     CB   HB1
233     CB   HB2
234     CB    SG
235      C     O
236     -C     N
237  [ impropers ]
238      N    -C    CA     H
239     -C   -CA     N    -O
240     CA     N     C    CB
242 [ CYSH ]
243  [ atoms ]
244      N     N  -0.280     0
245      H     H   0.280     0
246     CA    C1   0.000     1
247     HA    HC   0.000     1
248     CB    C2   0.000     2
249    HB1    HC   0.000     2
250    HB2    HC   0.000     2
251     SG     S  -0.064     3
252     HG    HS   0.064     3
253      C     C   0.380     4
254      O     O  -0.380     4
255  [ bonds ]
256      N     H
257      N    CA
258     CA    HA
259     CA    CB
260     CA     C
261     CB   HB1
262     CB   HB2
263     CB    SG
264     SG    HG
265      C     O
266     -C     N
267  [ impropers ]
268      N    -C    CA     H
269     -C   -CA     N    -O
270     CA     N     C    CB
272 [ GLN ]
273  [ atoms ]
274      N     N  -0.280     0
275      H     H   0.280     0
276     CA    C1   0.000     1
277     HA    HC   0.000     1
278     CB    C2   0.000     2
279    HB1    HC   0.000     2
280    HB2    HC   0.000     2
281     CG    C2   0.000     3
282    HG1    HC   0.000     3
283    HG2    HC   0.000     3
284     CD     C   0.380     4
285    OE1     O  -0.380     4
286    NE2    NT  -0.830     5
287   HE21     H   0.415     5
288   HE22     H   0.415     5
289      C     C   0.380     6
290      O     O  -0.380     6
291  [ bonds ]
292      N     H
293      N    CA
294     CA    HA
295     CA    CB
296     CA     C
297     CB   HB1
298     CB   HB2
299     CB    CG
300     CG   HG1
301     CG   HG2
302     CG    CD
303     CD   OE1
304     CD   NE2
305    NE2  HE21
306    NE2  HE22
307      C     O
308     -C     N
309  [ impropers ]
310      N    -C    CA     H
311     CA     N     C    CB
312     CD   OE1   NE2    CG
313    NE2  HE21  HE22    CD
314     -C   -CA     N    -O
316 [ GLU ]
317  [ atoms ]
318      N     N  -0.280     0
319      H     H   0.280     0
320     CA    C1   0.000     1
321     HA    HC   0.000     1
322     CB    C2   0.000     2
323    HB1    HC   0.000     2
324    HB2    HC   0.000     2
325     CG    C2   0.000     3
326    HG1    HC   0.000     3
327    HG2    HC   0.000     3
328     CD     C   0.270     4
329    OE1    OM  -0.635     4
330    OE2    OM  -0.635     4
331      C     C   0.380     5
332      O     O  -0.380     5
333  [ bonds ]
334      N     H
335      N    CA
336     CA    HA
337     CA    CB
338     CA     C
339     CB   HB1
340     CB   HB2
341     CB    CG
342     CG   HG1
343     CG   HG2
344     CG    CD
345     CD   OE1
346     CD   OE2
347      C     O
348     -C     N
349  [ impropers ]
350      N    -C    CA     H
351     CA     N     C    CB
352     CD   OE1   OE2    CG
353     -C   -CA     N    -O
355 [ GLUH ]
356  [ atoms ]
357      N     N  -0.280     0
358      H     H   0.280     0
359     CA    C1   0.000     1
360     HA    HC   0.000     1
361     CB    C2   0.000     2
362    HB1    HC   0.000     2
363    HB2    HC   0.000     2
364     CG    C2   0.000     3
365    HG1    HC   0.000     3
366    HG2    HC   0.000     3
367     CD     C   0.530     4
368    OE1     O  -0.380     4
369    OE2    OA  -0.548     4
370    HE2    HO   0.398     4
371      C     C   0.380     5
372      O     O  -0.380     5
373  [ bonds ]
374      N     H
375      N    CA
376     CA    HA
377     CA    CB
378     CB     C
379     CB   HB1
380     CB   HB2
381     CB    CG
382     CG   HG1
383     CG   HG2
384     CG    CD
385     CD   OE1
386     CD   OE2
387    OE2   HE2
388      C     O
389     -C     N
390  [ impropers ]
391      N    -C    CA     H
392     CA     N     C    CB
393     CD   OE1   OE2    CG
394     -C   -CA     N    -O
396 [ GLY ]
397  [ atoms ]
398      N     N  -0.280     0
399      H     H   0.280     0
400     CA    C2   0.000     1
401    HA1    HC   0.000     1
402    HA2    HC   0.000     1
403      C     C   0.380     2
404      O     O  -0.380     2
405  [ bonds ]
406      N     H
407      N    CA
408     CA   HA1
409     CA   HA2
410     CA     C
411      C     O
412     -C     N
413  [ impropers ]
414      N    -C    CA     H
415     -C   -CA     N    -O
417 [ HIS1 ]
418  [ atoms ]
419      N     N  -0.280     0
420      H     H   0.280     0
421     CA    C1   0.000     1
422     HA    HC   0.000     1
423     CB    C2   0.000     2
424    HB1    HC   0.000     2
425    HB2    HC   0.000     2
426     CG    CB   0.000     3
427    ND1  NR5*   0.000     4
428    HD1     H   0.190     5
429    CD2  CR51   0.130     5
430    CE1  CR51   0.260     5
431    NE2   NR5  -0.580     5
432      C     C   0.380     6
433      O     O  -0.380     6
434  [ bonds ]
435      N     H
436      N    CA
437     CA     C
438      C     O
439     -C     N
440     CA    HA
441     CA    CB
442     CB   HB1
443     CB   HB2
444     CB    CG
445     CG   ND1
446     CG   CD2
447    ND1   HD1
448    ND1   CE1
449    CD2   NE2
450    CE1   NE2
451  [ impropers ]
452      N    -C    CA     H
453     -C   -CA     N    -O
454     CA     N     C    CB
455     CG   ND1   CD2    CB
456    CD2    CG   ND1   CE1
457    ND1    CG   CD2   NE2
458     CG   ND1   CE1   NE2
459     CG   CD2   NE2   CE1
460    CD2   NE2   CE1   ND1
461    ND1    CG   CE1   HD1
463 [ HISA ]
464  [ atoms ]
465      N     N  -0.280     0
466      H     H   0.280     0
467     CA    C1   0.000     1
468     HA    HC   0.000     1
469     CB    C2   0.000     2
470    HB1    HC   0.000     2
471    HB2    HC   0.000     2
472     CG    CB   0.000     3
473    ND1  NR5*   0.000     3
474    HD1     H   0.190     3
475    CD2   CR5   0.130     3
476    HD2    HC   0.000     3
477    CE1   CR5   0.260     3
478    HE1    HC   0.000     3
479    NE2   NR5  -0.580     3
480      C     C   0.380     4
481      O     O  -0.380     4
482  [ bonds ]
483      N     H
484      N    CA
485     CA    HA
486     CA    CB
487     CA     C
488     CB   HB1
489     CB   HB2
490     CB    CG
491     CG   ND1
492     CG   CD2
493    ND1   HD1
494    ND1   CE1
495    CD2   HD2
496    CD2   NE2
497    CE1   HE1
498    CE1   NE2
499      C     O
500     -C     N
501  [ impropers ]
502      N    -C    CA     H
503     CA     N     C    CB
504     CG   ND1   CD2    CB
505    CD2    CG   ND1   CE1
506    ND1    CG   CD2   NE2
507     CG   ND1   CE1   NE2
508     CG   CD2   NE2   CE1
509    CD2   NE2   CE1   ND1
510    ND1    CG   CE1   HD1
511    CD2    CG   NE2   HD2
512    CE1   ND1   NE2   HE1
513     -C   -CA     N    -O
515 [ HISB ]
516  [ atoms ]
517      N     N  -0.280     0
518      H     H   0.280     0
519     CA    C1   0.000     1
520     HA    HC   0.000     1
521     CB    C2   0.000     2
522    HB1    HC   0.000     2
523    HB2    HC   0.000     2
524     CG    CB   0.130     3
525    ND1   NR5  -0.580     3
526    CD2   CR5   0.000     3
527    HD2    HC   0.000     3
528    CE1   CR5   0.260     3
529    HE1    HC   0.000     3
530    NE2  NR5*   0.000     3
531    HE2     H   0.190     3
532      C     C   0.380     4
533      O     O  -0.380     4
534  [ bonds ]
535      N     H
536      N    CA
537     CA    HA
538     CA    CB
539     CA     C
540     CB   HB1
541     CB   HB2
542     CB    CG
543     CG   ND1
544     CG   CD2
545    ND1   CE1
546    CD2   HD2
547    CD2   NE2
548    CE1   HE1
549    CE1   NE2
550    NE2   HE2
551      C     O
552     -C     N
553  [ impropers ]
554      N    -C    CA     H
555     CA     N     C    CB
556     CG   ND1   CD2    CB
557    CD2    CG   ND1   CE1
558    ND1    CG   CD2   NE2
559     CG   ND1   CE1   NE2
560     CG   CD2   NE2   CE1
561    CD2   NE2   CE1   ND1
562    CE1   ND1   NE2   HE1
563    NE2   CD2   CE1   HE2
564    CD2    CG   NE2   HD2
565     -C   -CA     N    -O
567 [ HISH ]
568  [ atoms ]
569      N     N  -0.280     0
570      H     H   0.280     0
571     CA    C1   0.000     1
572     HA    HC   0.000     1
573     CB    C2   0.000     2
574    HB1    HC   0.000     2
575    HB2    HC   0.000     2
576     CG    CB  -0.050     3
577    ND1  NR5*   0.380     3
578    HD1     H   0.300     3
579    CD2   CR5   0.000     3
580    HD2    HC   0.000     3
581    CE1   CR5  -0.240     3
582    HE1    HC   0.000     3
583    NE2  NR5*   0.310     3
584    HE2     H   0.300     3
585      C     C   0.380     4
586      O     O  -0.380     4
587  [ bonds ]
588      N     H
589      N    CA
590     CA    HA
591     CA    CB
592     CA     C
593     CB   HB1
594     CB   HB2
595     CB    CG
596     CG   ND1
597     CG   CD2
598    ND1   HD1
599    ND1   CE1
600    CD2   HD2
601    CD2   NE2
602    CE1   HE1
603    CE1   NE2
604    NE2   HE2
605      C     O
606     -C     N
607  [ impropers ]
608      N    -C    CA     H
609     CA     N     C    CB
610     CG   ND1   CD2    CB
611    CD2    CG   ND1   CE1
612    ND1    CG   CD2   NE2
613     CG   ND1   CE1   NE2
614     CG   CD2   NE2   CE1
615    CD2   NE2   CE1   ND1
616    ND1    CG   CE1   HD1
617    CE1   ND1   NE2   HE1
618    NE2   CE1   CD2   HE2
619    CD2    CG   NE2   HD2
620     -C   -CA     N    -O
622 [ HOH ]
623  [ atoms ]
624     OW    OW  -0.820     0
625    HW1    HW   0.410     0
626    HW2    HW   0.410     0
627  [ bonds ]
628     OW   HW1
629     OW   HW2
631 [ HYP ]
632  [ atoms ]
633      N     N   0.000     0
634     CA    C1   0.000     1
635     HA    HC   0.000     1
636     CB    C2   0.000     2
637    HB1    HC   0.000     2
638    HB2    HC   0.000     2
639     CG    C1   0.150     3
640     HG    HC   0.000     3
641    OD1    OA  -0.548     3
642    HD1    HO   0.398     3
643    CD2    C2   0.000     4
644    HD1    HC   0.000     4
645    HD2    HC   0.000     4
646      C     C   0.380     5
647      O     O  -0.380     5
648  [ bonds ]
649      N    CA
650     CA     C
651      C     O
652     -C     N
653     CA    HA
654     CA    CB
655     CB   HB1
656     CB   HB2
657     CB    CG
658     CG    HG
659     CG   OD1
660    OD1   HD1
661     CG   CD2
662    CD2   HD1
663    CD2   HD2
664    CD2     N
665  [ impropers ]
666      N    -C    CA   CD2
667     -C   -CA     N    -O
668     CA     N     C    CB
669     CG   CD2    CB   OD1
671 [ ILE ]
672  [ atoms ]
673      N     N  -0.280     0
674      H     H   0.280     0
675     CA    C1   0.000     1
676     HA    HC   0.000     1
677     CB    C1   0.000     2
678     HB    HC   0.000     2
679    CG1    C2   0.000     3
680   HG11    HC   0.000     3
681   HG12    HC   0.000     3
682    CG2    C3   0.000     4
683   HG21    HC   0.000     4
684   HG22    HC   0.000     4
685   HG23    HC   0.000     4
686     CD    C3   0.000     5
687    HD1    HC   0.000     5
688    HD2    HC   0.000     5
689    HD3    HC   0.000     5
690      C     C   0.380     6
691      O     O  -0.380     6
692  [ bonds ]
693      N     H
694      N    CA
695     CA    HA
696     CA    CB
697     CA     C
698     CB    HB
699     CB   CG1
700     CB   CG2
701    CG1  HG11
702    CG1  HG12
703    CG1    CD
704    CG2  HG21
705    CG2  HG22
706    CG2  HG23
707     CD   HD1
708     CD   HD2
709     CD   HD3
710      C     O
711     -C     N
712  [ impropers ]
713      N    -C    CA     H
714     -C   -CA     N    -O
715     CA     N     C    CB
716     CB   CG1   CG2    CA
718 [ LEU ]
719  [ atoms ]
720      N     N  -0.280     0
721      H     H   0.280     0
722     CA    C1   0.000     1
723     HA    HC   0.000     1
724     CB    C2   0.000     2
725    HB1    HC   0.000     2
726    HB2    HC   0.000     2
727     CG    C1   0.000     3
728     HG    HC   0.000     3
729    CD1    C3   0.000     4
730   HD11    HC   0.000     4
731   HD12    HC   0.000     4
732   HD13    HC   0.000     4
733    CD2    C3   0.000     5
734   HD21    HC   0.000     5
735   HD22    HC   0.000     5
736   HD23    HC   0.000     5
737      C     C   0.380     6
738      O     O  -0.380     6
739  [ bonds ]
740      N     H
741      N    CA
742     CA    HA
743     CA    CB
744     CA     C
745     CB   HB1
746     CB   HB2
747     CB    CG
748     CG    HG
749     CG   CD1
750     CG   CD2
751    CD1  HD11
752    CD1  HD12
753    CD1  HD13
754    CD2  HD21
755    CD2  HD22
756    CD2  HD23
757      C     O
758     -C     N
759  [ impropers ]
760      N    -C    CA     H
761     -C   -CA     N    -O
762     CA     N     C    CB
763     CG   CD2   CD1    CB
765 [ LYS ]
766  [ atoms ]
767      N     N  -0.280     0
768      H     H   0.280     0
769     CA    C1   0.000     1
770     HA    HC   0.000     1
771     CB    C2   0.000     2
772    HB1    HC   0.000     2
773    HB2    HC   0.000     2
774     CG    C2   0.000     3
775    HG1    HC   0.000     3
776    HG2    HC   0.000     3
777     CD    C2   0.000     4
778    HD1    HC   0.000     4
779    HD2    HC   0.000     4
780     CE    C2   0.000     5
781    HE1    HC   0.000     5
782    HE2    HC   0.000     5
783     NZ    NL  -0.830     5
784    HZ1     H   0.415     5
785    HZ2     H   0.415     5
786      C     C   0.380     6
787      O     O  -0.380     6
788  [ bonds ]
789      N     H
790      N    CA
791     CA    HA
792     CA    CB
793     CA     C
794     CB   HB1
795     CB   HB2
796     CB    CG
797     CG   HG1
798     CG   HG2
799     CG    CD
800     CD   HD1
801     CD   HD2
802     CD    CE
803     CE   HE1
804     CE   HE2
805     CE    NZ
806     NZ   HZ1
807     NZ   HZ2
808      C     O
809     -C     N
810  [ impropers ]
811      N    -C    CA     H
812     NZ    CE   HZ2    NZ
813     -C   -CA     N    -O
814     CA     N     C    CB
815     NZ    CE   HZ2   HZ1
817 [ LYSH ]
818  [ atoms ]
819      N     N  -0.280     0
820      H     H   0.280     0
821     CA    C1   0.000     1
822     HA    HC   0.000     1
823     CB    C2   0.000     2
824    HB1    HC   0.000     2
825    HB2    HC   0.000     2
826     CG    C2   0.000     3
827    HG1    HC   0.000     3
828    HG2    HC   0.000     3
829     CD    C2   0.000     4
830    HD1    HC   0.000     4
831    HD2    HC   0.000     4
832     CE    C2   0.127     5
833    HE1    HC   0.000     5
834    HE2    HC   0.000     5
835     NZ    NL   0.129     5
836    HZ1     H   0.248     5
837    HZ2     H   0.248     5
838    HZ3     H   0.248     5
839      C     C   0.380     6
840      O     O  -0.380     6
841  [ bonds ]
842      N     H
843      N    CA
844     CA    HA
845     CA    CB
846     CA     C
847     CB   HB1
848     CB   HB2
849     CB    CG
850     CG   HG1
851     CG   HG2
852     CG    CD
853     CD   HD1
854     CD   HD2
855     CD    CE
856     CE   HE1
857     CE   HE2
858     CE    NZ
859     NZ   HZ1
860     NZ   HZ2
861     NZ   HZ3
862      C     O
863     -C     N
864  [ impropers ]
865      N    -C    CA     H
866     -C   -CA     N    -O
867     CA     N     C    CB
869 [ MET ]
870  [ atoms ]
871      N     N  -0.280     0
872      H     H   0.280     0
873     CA    C1   0.000     1
874     HA    HC   0.000     1
875     CB    C2   0.000     2
876    HB1    HC   0.000     2
877    HB2    HC   0.000     2
878     CG    C2   0.000     3
879    HG1    HC   0.000     3
880    HG2    HC   0.000     3
881     SD     S   0.000     4
882     CE    C3   0.000     5
883    HE1    HC   0.000     5
884    HE2    HC   0.000     5
885    HE3    HC   0.000     5
886      C     C   0.380     6
887      O     O  -0.380     6
888  [ bonds ]
889      N     H
890      N    CA
891     CA    HA
892     CA    CB
893     CA     C
894     CB   HB1
895     CB   HB2
896     CB    CG
897     CG   HG1
898     CG   HG2
899     CG    SD
900     SD    CE
901     CE   HE1
902     CE   HE2
903     CE   HE3
904      C     O
905     -C     N
906  [ impropers ]
907      N    -C    CA     H
908     -C   -CA     N    -O
909     CA     N     C    CB
911 [ NAC ]
912  [ atoms ]
913      N     N  -0.280     0
914      H     H   0.280     0
915     CA    C3   0.000     1
916    HA1    HC   0.000     1
917    HA2    HC   0.000     1
918    HA3    HC   0.000     1
919  [ bonds ]
920      N     H
921      N    CA
922     CA   HA1
923     CA   HA2
924     CA   HA3
925     -C     N
926  [ impropers ]
927      N    -C    CA     H
929 [ NH2 ]
930  [ atoms ]
931      N    NT  -0.830     0
932     H1     H   0.415     0
933     H2     H   0.415     0
934  [ bonds ]
935     -C     N
936      N     H1
937      N     H2
939 [ PHE ]
940  [ atoms ]
941      N     N  -0.280     0
942      H     H   0.280     0
943     CA    C1   0.000     1
944     HA    HC   0.000     1
945     CB    C2   0.000     2
946    HB1    HC   0.000     2
947    HB2    HC   0.000     2
948     CG    CB   0.000     3
949    CD1   CR6  -0.140     4
950    HD1   HCR   0.140     4
951    CD2   CR6  -0.140     5
952    HD2   HCR   0.140     5
953    CE1   CR6  -0.140     6
954    HE1   HCR   0.140     6
955    CE2   CR6  -0.140     7
956    HE2   HCR   0.140     7
957     CZ   CR6  -0.140     8
958     HZ   HCR   0.140     8
959      C     C   0.380     9
960      O     O  -0.380     9
961  [ bonds ]
962      N     H
963      N    CA
964     CA    HA
965     CA    CB
966     CA     C
967     CB   HB1
968     CB   HB2
969     CB    CG
970     CG   CD1
971     CG   CD2
972    CD1   HD1
973    CD1   CE1
974    CD2   HD2
975    CD2   CE2
976    CE1   HE1
977    CE1    CZ
978    CE2   HE2
979    CE2    CZ
980     CZ    HZ
981      C     O
982     -C     N
983  [ impropers ]
984      N    -C    CA     H
985     CA     N     C    CB
986     CG   CD1   CD2    CB
987    CD2    CG   CD1   CE1
988    CD1    CG   CD2   CE2
989     CG   CD1   CE1    CZ
990     CG   CD2   CE2    CZ
991    CD1   CE1    CZ   CE2
992    CD2   CE2    CZ   CE1
993    CD1   CE1    CG   HD1
994    CE1    CZ   CD1   HE1
995     CZ   CE2   CE1    HZ
996    CE2   CD2    CZ   HE2
997    CD2    CG   CE2   HD2
998     -C   -CA     N    -O
1000 [ PRO ]
1001  [ atoms ]
1002      N     N   0.000     0
1003     CA    C1   0.000     1
1004     HA    HC   0.000     1
1005     CB    C2   0.000     2
1006    HB1    HC   0.000     2
1007    HB2    HC   0.000     2
1008     CG    C2   0.000     3
1009    HG1    HC   0.000     3
1010    HG2    HC   0.000     3
1011     CD    C2   0.000     4
1012    HD1    HC   0.000     4
1013    HD2    HC   0.000     4
1014      C     C   0.380     5
1015      O     O  -0.380     5
1016  [ bonds ]
1017      N    CA
1018     CA    HA
1019     CA    CB
1020     CA     C
1021     CB   HB1
1022     CB   HB2
1023     CB    CG
1024     CG   HG1
1025     CG   HG2
1026     CG    CD
1027     CD   HD1
1028     CD   HD2
1029     CD     N
1030      C     O
1031     -C     N
1032  [ impropers ]
1033      N    -C    CA    CD
1034     -C   -CA     N    -O
1035     CA     N     C    CB
1037 [ SER ]
1038  [ atoms ]
1039      N     N  -0.280     0
1040      H     H   0.280     0
1041     CA    C1   0.000     1
1042     HA    HC   0.000     1
1043     CB    C2   0.150     2
1044    HB1    HC   0.000     2
1045    HB2    HC   0.000     2
1046     OG    OA  -0.548     2
1047     HG    HO   0.398     2
1048      C     C   0.380     3
1049      O     O  -0.380     3
1050  [ bonds ]
1051      N     H
1052      N    CA
1053     CA    HA
1054     CA    CB
1055     CA     C
1056     CB   HB1
1057     CB   HB2
1058     CB    OG
1059     OG    HG
1060      C     O
1061     -C     N
1062  [ impropers ]
1063      N    -C    CA     H
1064     -C   -CA     N    -O
1065     CA     N     C    CB
1067 [ THR ]
1068  [ atoms ]
1069      N     N  -0.280     0
1070      H     H   0.280     0
1071     CA    C1   0.000     1
1072     HA    HC   0.000     1
1073     CB    C1   0.150     2
1074     HB    HC   0.000     2
1075    OG1    OA  -0.548     2
1076    HG1    HO   0.398     2
1077    CG2    C3   0.000     3
1078   HG21    HC   0.000     3
1079   HG22    HC   0.000     3
1080   HG23    HC   0.000     3
1081      C     C   0.380     4
1082      O     O  -0.380     4
1083  [ bonds ]
1084      N     H
1085      N    CA
1086     CA    HA
1087     CA    CB
1088     CA     C
1089     CB    HB
1090     CB   OG1
1091     CB   CG2
1092    OG1   HG1
1093    CG2  HG21
1094    CG2  HG22
1095    CG2  HG23
1096      C     O
1097     -C     N
1098  [ impropers ]
1099      N    -C    CA     H
1100     -C   -CA     N    -O
1101     CA     N     C    CB
1102     CB   OG1   CG2    CA
1103   
1104 [ TRP ]
1105  [ atoms ]
1106      N     N  -0.280     0
1107      H     H   0.280     0
1108     CA    C1   0.000     1
1109     HA    HC   0.000     1
1110     CB    C2   0.000     2
1111    HB1    HC   0.000     2
1112    HB2    HC   0.000     2
1113     CG    CB  -0.140     3
1114    CD1   CR5  -0.140     3
1115    HD1   HCR   0.140     3
1116    CD2    CB   0.000     3
1117    NE1  NR5*  -0.050     3
1118    HE1     H   0.190     3
1119    CE2    CB   0.000     4
1120    CE3   CR6  -0.140     5
1121    HE3   HCR   0.140     5
1122    CZ2   CR6  -0.140     6
1123    HZ2   HCR   0.140     6
1124    CZ3   CR6  -0.140     7
1125    HZ3   HCR   0.140     7
1126    CH2   CR6  -0.140     8
1127    HH2   HCR   0.140     8
1128      C     C   0.380     9
1129      O     O  -0.380     9
1130  [ bonds ]
1131      N     H
1132      N    CA
1133     CA    HA
1134     CA    CB
1135     CA     C
1136     CB   HB1
1137     CB   HB2
1138     CB    CG
1139     CG   CD1
1140     CG   CD2
1141    CD1   HD1
1142    CD1   NE1
1143    CD2   CE2
1144    CD2   CE3
1145    NE1   HE1
1146    NE1   CE2
1147    CE2   CZ2
1148    CE3   HE3
1149    CE3   CZ3
1150    CZ2   HZ2
1151    CZ2   CH2
1152    CZ3   HZ3
1153    CZ3   CH2
1154    CH2   HH2
1155      C     O
1156     -C     N
1157  [ impropers ]
1158      N    -C    CA     H
1159     CA     N     C    CB
1160     CG   CD1   CD2    CB
1161    CD2    CG   CD1   NE1
1162    CD1    CG   CD2   CE2
1163     CG   CD1   NE1   CE2
1164     CG   CD2   CE2   NE1
1165    CD1   NE1   CE2   CD2
1166    NE1   CD1   CE2   HE1
1167    CD1    CG   NE1   HD1
1168    CD2   CE2   CE3    CG
1169    CE2   CD2   CZ2   NE1
1170    CE3   CD2   CE2   CZ2
1171    CD2   CE2   CZ2   CH2
1172    CE2   CD2   CE3   CZ3
1173    CE2   CZ2   CH2   CZ3
1174    CD2   CE3   CZ3   CH2
1175    CE3   CZ3   CH2   CZ2
1176    CE3   CD2   CZ3   HE3
1177    CZ3   CE3   CH2   HZ3
1178    CH2   CZ3   CZ2   HH2
1179    CZ2   CH2   CE2   HZ2
1180     -C   -CA     N    -O
1182 [ TYR ]
1183  [ atoms ]
1184      N     N  -0.280     0
1185      H     H   0.280     0
1186     CA    C1   0.000     1
1187     HA    HC   0.000     1
1188     CB    C2   0.000     2
1189    HB1    HC   0.000     2
1190    HB2    HC   0.000     2
1191     CG    CB   0.000     3
1192    CD1   CR6  -0.140     4
1193    HD1   HCR   0.140     4
1194    CD2   CR6  -0.140     5
1195    HD2   HCR   0.140     5
1196    CE1   CR6  -0.140     6
1197    HE1   HCR   0.140     6
1198    CE2   CR6  -0.140     7
1199    HE2   HCR   0.140     7
1200     CZ    CB   0.150     8
1201     OH    OA  -0.548     8
1202     HH    HO   0.398     8
1203      C     C   0.380     9
1204      O     O  -0.380     9
1205  [ bonds ]
1206      N     H
1207      N    CA
1208     CA    HA
1209     CA    CB
1210     CA     C
1211     CB   HB1
1212     CB   HB2
1213     CB    CG
1214     CG   CD1
1215     CG   CD2
1216    CD1   HD1
1217    CD1   CE1
1218    CD2   HD2
1219    CD2   CE2
1220    CE1   HE1
1221    CE1    CZ
1222    CE2   HE2
1223    CE2    CZ
1224     CZ    OH
1225     OH    HH
1226      C     O
1227     -C     N
1228  [ impropers ]
1229      N    -C    CA     H
1230     CA     N     C    CB
1231     CG   CD1   CD2    CB
1232    CD2    CG   CD1   CE1
1233    CD1    CG   CD2   CE2
1234     CG   CD1   CE1    CZ
1235     CG   CD2   CE2    CZ
1236    CD1   CE1    CZ   CE2
1237    CD2   CE2    CZ   CE1
1238    CD1   CE1    CG   HD1
1239    CE1   CD1    CZ   HE1
1240     CZ   CE1   CE2    OH
1241    CE2    CZ   CD2   HE2
1242    CD2   CE2    CG   HD2
1243     -C   -CA     N    -O
1245 [ VAL ]
1246  [ atoms ]
1247      N     N  -0.280     0
1248      H     H   0.280     0
1249     CA    C1   0.000     1
1250     HA    HC   0.000     1
1251     CB    C1   0.000     2
1252     HB    HC   0.000     2
1253    CG1    C3   0.000     3
1254   HG11    HC   0.000     3
1255   HG12    HC   0.000     3
1256   HG13    HC   0.000     3
1257    CG2    C3   0.000     4
1258   HG21    HC   0.000     4
1259   HG22    HC   0.000     4
1260   HG23    HC   0.000     4
1261      C     C   0.380     5
1262      O     O  -0.380     5
1263  [ bonds ]
1264      N     H
1265      N    CA
1266     CA    HA
1267     CA    CB
1268     CA     C
1269     CB    HB
1270     CB   CG1
1271     CB   CG2
1272    CG1  HG11
1273    CG1  HG12
1274    CG1  HG13
1275    CG2  HG21
1276    CG2  HG22
1277    CG2  HG23
1278      C     O
1279     -C     N
1280  [ impropers ]
1281      N    -C    CA     H
1282     -C   -CA     N    -O
1283     CA     N     C    CB
1284     CB   CG2   CG1    CA