repo.or.cz
/
gromacs
/
adressmacs.git
/
blob
commit
grep
author
committer
pickaxe
?
search:
re
summary
|
log
|
graphiclog1
|
graphiclog2
|
commit
|
commitdiff
|
tree
|
refs
|
edit
|
fork
blame
|
history
|
raw
|
HEAD
changed reading hint
[gromacs/adressmacs.git]
/
share
/
top
/
ffgmx2.rtp
blob
eba7c3183442d9751ddd680bb731c162b5ca4c2d
1
[ bondedtypes ]
2
; bonds angles dihedrals impropers
3
1 1 1 2
4
5
[ ACE ]
6
[ atoms ]
7
CA C3 0.000 1
8
HA1 HC 0.000 1
9
HA2 HC 0.000 1
10
HA3 HC 0.000 1
11
C C 0.380 2
12
O O -0.380 2
13
[ bonds ]
14
CA HA1
15
CA HA2
16
CA HA3
17
CA C
18
C O
19
20
[ ALA ]
21
[ atoms ]
22
N N -0.280 0
23
H H 0.280 0
24
CA C1 0.000 1
25
HA HC 0.000 1
26
CB C3 0.000 2
27
HB1 HC 0.000 2
28
HB2 HC 0.000 2
29
HB3 HC 0.000 2
30
C C 0.380 3
31
O O -0.380 3
32
[ bonds ]
33
N H
34
N CA
35
CA HA
36
CA CB
37
CA C
38
CB HB1
39
CB HB2
40
CB HB3
41
C O
42
-C N
43
[ impropers ]
44
N -C CA H
45
-C -CA N -O
46
CA N C CB
47
48
[ ARG ]
49
[ atoms ]
50
N N -0.280 0
51
H H 0.280 0
52
CA C1 0.000 1
53
HA HC 0.000 1
54
CB C2 0.000 2
55
HB1 HC 0.000 2
56
HB2 HC 0.000 2
57
CG C2 0.000 3
58
HG1 HC 0.000 3
59
HG2 HC 0.000 3
60
CD C2 0.090 4
61
HD1 HC 0.000 4
62
HD2 HC 0.000 4
63
NE NE -0.110 4
64
HE H 0.240 4
65
CZ C 0.340 4
66
NH1 NZ -0.260 4
67
HH11 H 0.240 4
68
HH12 H 0.240 4
69
NH2 NZ -0.260 4
70
HH21 H 0.240 4
71
HH22 H 0.240 4
72
C C 0.380 5
73
O O -0.380 5
74
[ bonds ]
75
N H
76
N CA
77
CA HA
78
CA CB
79
CA C
80
CB HB1
81
CB HB2
82
CB CG
83
CG HG1
84
CG HG2
85
CG CD
86
CD HD1
87
CD HD2
88
CD NE
89
NE HE
90
NE CZ
91
CZ NH1
92
CZ NH2
93
NH1 HH11
94
NH1 HH12
95
NH2 HH21
96
NH2 HH22
97
C O
98
-C N
99
[ impropers ]
100
N -C CA H
101
-C -CA N -O
102
CA N C CB
103
NE CD CZ HE
104
CZ NH1 NH2 NE
105
NH1 HH11 HH12 CZ
106
NH2 HH21 HH22 CZ
107
108
[ ASN ]
109
[ atoms ]
110
N N -0.280 0
111
H H 0.280 0
112
CA C1 0.000 1
113
HA HC 0.000 1
114
CB C2 0.000 2
115
HB1 HC 0.000 2
116
HB2 HC 0.000 2
117
CG C 0.380 3
118
OD1 O -0.380 3
119
ND2 NT -0.830 4
120
HD21 H 0.415 4
121
HD22 H 0.415 4
122
C C 0.380 5
123
O O -0.380 5
124
[ bonds ]
125
N H
126
N CA
127
CA HA
128
CA CB
129
CA C
130
CB HB1
131
CB HB2
132
CB CG
133
CG OD1
134
CG ND2
135
ND2 HD21
136
ND2 HD22
137
C O
138
-C N
139
[ impropers ]
140
N -C CA H
141
-C -CA N -O
142
CA N C CB
143
CG OD1 ND2 CB
144
ND2 HD21 HD22 CG
145
146
[ ASP ]
147
[ atoms ]
148
N N -0.280 0
149
H H 0.280 0
150
CA C1 0.000 1
151
HA HC 0.000 1
152
CB C2 0.000 2
153
HB1 HC 0.000 2
154
HB2 HC 0.000 2
155
CG C 0.270 3
156
OD1 OM -0.635 3
157
OD2 OM -0.635 3
158
C C 0.380 4
159
O O -0.380 4
160
[ bonds ]
161
N H
162
N CA
163
CA HA
164
CA CB
165
CA C
166
CB HB1
167
CB HB2
168
CB CG
169
CG OD1
170
CG OD2
171
C O
172
-C N
173
[ impropers ]
174
N -C CA H
175
-C -CA N -O
176
CA N C CB
177
CG OD1 OD2 CB
178
179
[ ASPH ]
180
[ atoms ]
181
N N -0.280 0
182
H H 0.280 0
183
CA C1 0.000 1
184
HA HC 0.000 1
185
CB C2 0.000 2
186
HB1 HC 0.000 2
187
HB2 HC 0.000 2
188
CG C 0.530 3
189
OD1 O -0.380 3
190
OD2 OA -0.548 3
191
HD2 HO 0.398 3
192
C C 0.380 4
193
O O -0.380 4
194
[ bonds ]
195
N H
196
N CA
197
CA HA
198
CA CB
199
CA C
200
CB HB1
201
CB HB2
202
CB CG
203
CG OD1
204
CG OD2
205
OD2 HD2
206
C O
207
-C N
208
[ impropers ]
209
N -C CA H
210
-C -CA N -O
211
CA N C CB
212
CG OD1 OD2 CB
213
214
[ CYS2 ]
215
[ atoms ]
216
N N -0.280 0
217
H H 0.280 0
218
CA C1 0.000 1
219
HA HC 0.000 1
220
CB C2 0.000 2
221
HB1 HC 0.000 2
222
HB2 HC 0.000 2
223
SG S 0.000 3
224
C C 0.380 4
225
O O -0.380 4
226
[ bonds ]
227
N H
228
N CA
229
CA HA
230
CA CB
231
CA C
232
CB HB1
233
CB HB2
234
CB SG
235
C O
236
-C N
237
[ impropers ]
238
N -C CA H
239
-C -CA N -O
240
CA N C CB
241
242
[ CYSH ]
243
[ atoms ]
244
N N -0.280 0
245
H H 0.280 0
246
CA C1 0.000 1
247
HA HC 0.000 1
248
CB C2 0.000 2
249
HB1 HC 0.000 2
250
HB2 HC 0.000 2
251
SG S -0.064 3
252
HG HS 0.064 3
253
C C 0.380 4
254
O O -0.380 4
255
[ bonds ]
256
N H
257
N CA
258
CA HA
259
CA CB
260
CA C
261
CB HB1
262
CB HB2
263
CB SG
264
SG HG
265
C O
266
-C N
267
[ impropers ]
268
N -C CA H
269
-C -CA N -O
270
CA N C CB
271
272
[ GLN ]
273
[ atoms ]
274
N N -0.280 0
275
H H 0.280 0
276
CA C1 0.000 1
277
HA HC 0.000 1
278
CB C2 0.000 2
279
HB1 HC 0.000 2
280
HB2 HC 0.000 2
281
CG C2 0.000 3
282
HG1 HC 0.000 3
283
HG2 HC 0.000 3
284
CD C 0.380 4
285
OE1 O -0.380 4
286
NE2 NT -0.830 5
287
HE21 H 0.415 5
288
HE22 H 0.415 5
289
C C 0.380 6
290
O O -0.380 6
291
[ bonds ]
292
N H
293
N CA
294
CA HA
295
CA CB
296
CA C
297
CB HB1
298
CB HB2
299
CB CG
300
CG HG1
301
CG HG2
302
CG CD
303
CD OE1
304
CD NE2
305
NE2 HE21
306
NE2 HE22
307
C O
308
-C N
309
[ impropers ]
310
N -C CA H
311
CA N C CB
312
CD OE1 NE2 CG
313
NE2 HE21 HE22 CD
314
-C -CA N -O
315
316
[ GLU ]
317
[ atoms ]
318
N N -0.280 0
319
H H 0.280 0
320
CA C1 0.000 1
321
HA HC 0.000 1
322
CB C2 0.000 2
323
HB1 HC 0.000 2
324
HB2 HC 0.000 2
325
CG C2 0.000 3
326
HG1 HC 0.000 3
327
HG2 HC 0.000 3
328
CD C 0.270 4
329
OE1 OM -0.635 4
330
OE2 OM -0.635 4
331
C C 0.380 5
332
O O -0.380 5
333
[ bonds ]
334
N H
335
N CA
336
CA HA
337
CA CB
338
CA C
339
CB HB1
340
CB HB2
341
CB CG
342
CG HG1
343
CG HG2
344
CG CD
345
CD OE1
346
CD OE2
347
C O
348
-C N
349
[ impropers ]
350
N -C CA H
351
CA N C CB
352
CD OE1 OE2 CG
353
-C -CA N -O
354
355
[ GLUH ]
356
[ atoms ]
357
N N -0.280 0
358
H H 0.280 0
359
CA C1 0.000 1
360
HA HC 0.000 1
361
CB C2 0.000 2
362
HB1 HC 0.000 2
363
HB2 HC 0.000 2
364
CG C2 0.000 3
365
HG1 HC 0.000 3
366
HG2 HC 0.000 3
367
CD C 0.530 4
368
OE1 O -0.380 4
369
OE2 OA -0.548 4
370
HE2 HO 0.398 4
371
C C 0.380 5
372
O O -0.380 5
373
[ bonds ]
374
N H
375
N CA
376
CA HA
377
CA CB
378
CB C
379
CB HB1
380
CB HB2
381
CB CG
382
CG HG1
383
CG HG2
384
CG CD
385
CD OE1
386
CD OE2
387
OE2 HE2
388
C O
389
-C N
390
[ impropers ]
391
N -C CA H
392
CA N C CB
393
CD OE1 OE2 CG
394
-C -CA N -O
395
396
[ GLY ]
397
[ atoms ]
398
N N -0.280 0
399
H H 0.280 0
400
CA C2 0.000 1
401
HA1 HC 0.000 1
402
HA2 HC 0.000 1
403
C C 0.380 2
404
O O -0.380 2
405
[ bonds ]
406
N H
407
N CA
408
CA HA1
409
CA HA2
410
CA C
411
C O
412
-C N
413
[ impropers ]
414
N -C CA H
415
-C -CA N -O
416
417
[ HIS1 ]
418
[ atoms ]
419
N N -0.280 0
420
H H 0.280 0
421
CA C1 0.000 1
422
HA HC 0.000 1
423
CB C2 0.000 2
424
HB1 HC 0.000 2
425
HB2 HC 0.000 2
426
CG CB 0.000 3
427
ND1 NR5* 0.000 4
428
HD1 H 0.190 5
429
CD2 CR51 0.130 5
430
CE1 CR51 0.260 5
431
NE2 NR5 -0.580 5
432
C C 0.380 6
433
O O -0.380 6
434
[ bonds ]
435
N H
436
N CA
437
CA C
438
C O
439
-C N
440
CA HA
441
CA CB
442
CB HB1
443
CB HB2
444
CB CG
445
CG ND1
446
CG CD2
447
ND1 HD1
448
ND1 CE1
449
CD2 NE2
450
CE1 NE2
451
[ impropers ]
452
N -C CA H
453
-C -CA N -O
454
CA N C CB
455
CG ND1 CD2 CB
456
CD2 CG ND1 CE1
457
ND1 CG CD2 NE2
458
CG ND1 CE1 NE2
459
CG CD2 NE2 CE1
460
CD2 NE2 CE1 ND1
461
ND1 CG CE1 HD1
462
463
[ HISA ]
464
[ atoms ]
465
N N -0.280 0
466
H H 0.280 0
467
CA C1 0.000 1
468
HA HC 0.000 1
469
CB C2 0.000 2
470
HB1 HC 0.000 2
471
HB2 HC 0.000 2
472
CG CB 0.000 3
473
ND1 NR5* 0.000 3
474
HD1 H 0.190 3
475
CD2 CR5 0.130 3
476
HD2 HC 0.000 3
477
CE1 CR5 0.260 3
478
HE1 HC 0.000 3
479
NE2 NR5 -0.580 3
480
C C 0.380 4
481
O O -0.380 4
482
[ bonds ]
483
N H
484
N CA
485
CA HA
486
CA CB
487
CA C
488
CB HB1
489
CB HB2
490
CB CG
491
CG ND1
492
CG CD2
493
ND1 HD1
494
ND1 CE1
495
CD2 HD2
496
CD2 NE2
497
CE1 HE1
498
CE1 NE2
499
C O
500
-C N
501
[ impropers ]
502
N -C CA H
503
CA N C CB
504
CG ND1 CD2 CB
505
CD2 CG ND1 CE1
506
ND1 CG CD2 NE2
507
CG ND1 CE1 NE2
508
CG CD2 NE2 CE1
509
CD2 NE2 CE1 ND1
510
ND1 CG CE1 HD1
511
CD2 CG NE2 HD2
512
CE1 ND1 NE2 HE1
513
-C -CA N -O
514
515
[ HISB ]
516
[ atoms ]
517
N N -0.280 0
518
H H 0.280 0
519
CA C1 0.000 1
520
HA HC 0.000 1
521
CB C2 0.000 2
522
HB1 HC 0.000 2
523
HB2 HC 0.000 2
524
CG CB 0.130 3
525
ND1 NR5 -0.580 3
526
CD2 CR5 0.000 3
527
HD2 HC 0.000 3
528
CE1 CR5 0.260 3
529
HE1 HC 0.000 3
530
NE2 NR5* 0.000 3
531
HE2 H 0.190 3
532
C C 0.380 4
533
O O -0.380 4
534
[ bonds ]
535
N H
536
N CA
537
CA HA
538
CA CB
539
CA C
540
CB HB1
541
CB HB2
542
CB CG
543
CG ND1
544
CG CD2
545
ND1 CE1
546
CD2 HD2
547
CD2 NE2
548
CE1 HE1
549
CE1 NE2
550
NE2 HE2
551
C O
552
-C N
553
[ impropers ]
554
N -C CA H
555
CA N C CB
556
CG ND1 CD2 CB
557
CD2 CG ND1 CE1
558
ND1 CG CD2 NE2
559
CG ND1 CE1 NE2
560
CG CD2 NE2 CE1
561
CD2 NE2 CE1 ND1
562
CE1 ND1 NE2 HE1
563
NE2 CD2 CE1 HE2
564
CD2 CG NE2 HD2
565
-C -CA N -O
566
567
[ HISH ]
568
[ atoms ]
569
N N -0.280 0
570
H H 0.280 0
571
CA C1 0.000 1
572
HA HC 0.000 1
573
CB C2 0.000 2
574
HB1 HC 0.000 2
575
HB2 HC 0.000 2
576
CG CB -0.050 3
577
ND1 NR5* 0.380 3
578
HD1 H 0.300 3
579
CD2 CR5 0.000 3
580
HD2 HC 0.000 3
581
CE1 CR5 -0.240 3
582
HE1 HC 0.000 3
583
NE2 NR5* 0.310 3
584
HE2 H 0.300 3
585
C C 0.380 4
586
O O -0.380 4
587
[ bonds ]
588
N H
589
N CA
590
CA HA
591
CA CB
592
CA C
593
CB HB1
594
CB HB2
595
CB CG
596
CG ND1
597
CG CD2
598
ND1 HD1
599
ND1 CE1
600
CD2 HD2
601
CD2 NE2
602
CE1 HE1
603
CE1 NE2
604
NE2 HE2
605
C O
606
-C N
607
[ impropers ]
608
N -C CA H
609
CA N C CB
610
CG ND1 CD2 CB
611
CD2 CG ND1 CE1
612
ND1 CG CD2 NE2
613
CG ND1 CE1 NE2
614
CG CD2 NE2 CE1
615
CD2 NE2 CE1 ND1
616
ND1 CG CE1 HD1
617
CE1 ND1 NE2 HE1
618
NE2 CE1 CD2 HE2
619
CD2 CG NE2 HD2
620
-C -CA N -O
621
622
[ HOH ]
623
[ atoms ]
624
OW OW -0.820 0
625
HW1 HW 0.410 0
626
HW2 HW 0.410 0
627
[ bonds ]
628
OW HW1
629
OW HW2
630
631
[ HYP ]
632
[ atoms ]
633
N N 0.000 0
634
CA C1 0.000 1
635
HA HC 0.000 1
636
CB C2 0.000 2
637
HB1 HC 0.000 2
638
HB2 HC 0.000 2
639
CG C1 0.150 3
640
HG HC 0.000 3
641
OD1 OA -0.548 3
642
HD1 HO 0.398 3
643
CD2 C2 0.000 4
644
HD1 HC 0.000 4
645
HD2 HC 0.000 4
646
C C 0.380 5
647
O O -0.380 5
648
[ bonds ]
649
N CA
650
CA C
651
C O
652
-C N
653
CA HA
654
CA CB
655
CB HB1
656
CB HB2
657
CB CG
658
CG HG
659
CG OD1
660
OD1 HD1
661
CG CD2
662
CD2 HD1
663
CD2 HD2
664
CD2 N
665
[ impropers ]
666
N -C CA CD2
667
-C -CA N -O
668
CA N C CB
669
CG CD2 CB OD1
670
671
[ ILE ]
672
[ atoms ]
673
N N -0.280 0
674
H H 0.280 0
675
CA C1 0.000 1
676
HA HC 0.000 1
677
CB C1 0.000 2
678
HB HC 0.000 2
679
CG1 C2 0.000 3
680
HG11 HC 0.000 3
681
HG12 HC 0.000 3
682
CG2 C3 0.000 4
683
HG21 HC 0.000 4
684
HG22 HC 0.000 4
685
HG23 HC 0.000 4
686
CD C3 0.000 5
687
HD1 HC 0.000 5
688
HD2 HC 0.000 5
689
HD3 HC 0.000 5
690
C C 0.380 6
691
O O -0.380 6
692
[ bonds ]
693
N H
694
N CA
695
CA HA
696
CA CB
697
CA C
698
CB HB
699
CB CG1
700
CB CG2
701
CG1 HG11
702
CG1 HG12
703
CG1 CD
704
CG2 HG21
705
CG2 HG22
706
CG2 HG23
707
CD HD1
708
CD HD2
709
CD HD3
710
C O
711
-C N
712
[ impropers ]
713
N -C CA H
714
-C -CA N -O
715
CA N C CB
716
CB CG1 CG2 CA
717
718
[ LEU ]
719
[ atoms ]
720
N N -0.280 0
721
H H 0.280 0
722
CA C1 0.000 1
723
HA HC 0.000 1
724
CB C2 0.000 2
725
HB1 HC 0.000 2
726
HB2 HC 0.000 2
727
CG C1 0.000 3
728
HG HC 0.000 3
729
CD1 C3 0.000 4
730
HD11 HC 0.000 4
731
HD12 HC 0.000 4
732
HD13 HC 0.000 4
733
CD2 C3 0.000 5
734
HD21 HC 0.000 5
735
HD22 HC 0.000 5
736
HD23 HC 0.000 5
737
C C 0.380 6
738
O O -0.380 6
739
[ bonds ]
740
N H
741
N CA
742
CA HA
743
CA CB
744
CA C
745
CB HB1
746
CB HB2
747
CB CG
748
CG HG
749
CG CD1
750
CG CD2
751
CD1 HD11
752
CD1 HD12
753
CD1 HD13
754
CD2 HD21
755
CD2 HD22
756
CD2 HD23
757
C O
758
-C N
759
[ impropers ]
760
N -C CA H
761
-C -CA N -O
762
CA N C CB
763
CG CD2 CD1 CB
764
765
[ LYS ]
766
[ atoms ]
767
N N -0.280 0
768
H H 0.280 0
769
CA C1 0.000 1
770
HA HC 0.000 1
771
CB C2 0.000 2
772
HB1 HC 0.000 2
773
HB2 HC 0.000 2
774
CG C2 0.000 3
775
HG1 HC 0.000 3
776
HG2 HC 0.000 3
777
CD C2 0.000 4
778
HD1 HC 0.000 4
779
HD2 HC 0.000 4
780
CE C2 0.000 5
781
HE1 HC 0.000 5
782
HE2 HC 0.000 5
783
NZ NL -0.830 5
784
HZ1 H 0.415 5
785
HZ2 H 0.415 5
786
C C 0.380 6
787
O O -0.380 6
788
[ bonds ]
789
N H
790
N CA
791
CA HA
792
CA CB
793
CA C
794
CB HB1
795
CB HB2
796
CB CG
797
CG HG1
798
CG HG2
799
CG CD
800
CD HD1
801
CD HD2
802
CD CE
803
CE HE1
804
CE HE2
805
CE NZ
806
NZ HZ1
807
NZ HZ2
808
C O
809
-C N
810
[ impropers ]
811
N -C CA H
812
NZ CE HZ2 NZ
813
-C -CA N -O
814
CA N C CB
815
NZ CE HZ2 HZ1
816
817
[ LYSH ]
818
[ atoms ]
819
N N -0.280 0
820
H H 0.280 0
821
CA C1 0.000 1
822
HA HC 0.000 1
823
CB C2 0.000 2
824
HB1 HC 0.000 2
825
HB2 HC 0.000 2
826
CG C2 0.000 3
827
HG1 HC 0.000 3
828
HG2 HC 0.000 3
829
CD C2 0.000 4
830
HD1 HC 0.000 4
831
HD2 HC 0.000 4
832
CE C2 0.127 5
833
HE1 HC 0.000 5
834
HE2 HC 0.000 5
835
NZ NL 0.129 5
836
HZ1 H 0.248 5
837
HZ2 H 0.248 5
838
HZ3 H 0.248 5
839
C C 0.380 6
840
O O -0.380 6
841
[ bonds ]
842
N H
843
N CA
844
CA HA
845
CA CB
846
CA C
847
CB HB1
848
CB HB2
849
CB CG
850
CG HG1
851
CG HG2
852
CG CD
853
CD HD1
854
CD HD2
855
CD CE
856
CE HE1
857
CE HE2
858
CE NZ
859
NZ HZ1
860
NZ HZ2
861
NZ HZ3
862
C O
863
-C N
864
[ impropers ]
865
N -C CA H
866
-C -CA N -O
867
CA N C CB
868
869
[ MET ]
870
[ atoms ]
871
N N -0.280 0
872
H H 0.280 0
873
CA C1 0.000 1
874
HA HC 0.000 1
875
CB C2 0.000 2
876
HB1 HC 0.000 2
877
HB2 HC 0.000 2
878
CG C2 0.000 3
879
HG1 HC 0.000 3
880
HG2 HC 0.000 3
881
SD S 0.000 4
882
CE C3 0.000 5
883
HE1 HC 0.000 5
884
HE2 HC 0.000 5
885
HE3 HC 0.000 5
886
C C 0.380 6
887
O O -0.380 6
888
[ bonds ]
889
N H
890
N CA
891
CA HA
892
CA CB
893
CA C
894
CB HB1
895
CB HB2
896
CB CG
897
CG HG1
898
CG HG2
899
CG SD
900
SD CE
901
CE HE1
902
CE HE2
903
CE HE3
904
C O
905
-C N
906
[ impropers ]
907
N -C CA H
908
-C -CA N -O
909
CA N C CB
910
911
[ NAC ]
912
[ atoms ]
913
N N -0.280 0
914
H H 0.280 0
915
CA C3 0.000 1
916
HA1 HC 0.000 1
917
HA2 HC 0.000 1
918
HA3 HC 0.000 1
919
[ bonds ]
920
N H
921
N CA
922
CA HA1
923
CA HA2
924
CA HA3
925
-C N
926
[ impropers ]
927
N -C CA H
928
929
[ NH2 ]
930
[ atoms ]
931
N NT -0.830 0
932
H1 H 0.415 0
933
H2 H 0.415 0
934
[ bonds ]
935
-C N
936
N H1
937
N H2
938
939
[ PHE ]
940
[ atoms ]
941
N N -0.280 0
942
H H 0.280 0
943
CA C1 0.000 1
944
HA HC 0.000 1
945
CB C2 0.000 2
946
HB1 HC 0.000 2
947
HB2 HC 0.000 2
948
CG CB 0.000 3
949
CD1 CR6 -0.140 4
950
HD1 HCR 0.140 4
951
CD2 CR6 -0.140 5
952
HD2 HCR 0.140 5
953
CE1 CR6 -0.140 6
954
HE1 HCR 0.140 6
955
CE2 CR6 -0.140 7
956
HE2 HCR 0.140 7
957
CZ CR6 -0.140 8
958
HZ HCR 0.140 8
959
C C 0.380 9
960
O O -0.380 9
961
[ bonds ]
962
N H
963
N CA
964
CA HA
965
CA CB
966
CA C
967
CB HB1
968
CB HB2
969
CB CG
970
CG CD1
971
CG CD2
972
CD1 HD1
973
CD1 CE1
974
CD2 HD2
975
CD2 CE2
976
CE1 HE1
977
CE1 CZ
978
CE2 HE2
979
CE2 CZ
980
CZ HZ
981
C O
982
-C N
983
[ impropers ]
984
N -C CA H
985
CA N C CB
986
CG CD1 CD2 CB
987
CD2 CG CD1 CE1
988
CD1 CG CD2 CE2
989
CG CD1 CE1 CZ
990
CG CD2 CE2 CZ
991
CD1 CE1 CZ CE2
992
CD2 CE2 CZ CE1
993
CD1 CE1 CG HD1
994
CE1 CZ CD1 HE1
995
CZ CE2 CE1 HZ
996
CE2 CD2 CZ HE2
997
CD2 CG CE2 HD2
998
-C -CA N -O
999
1000
[ PRO ]
1001
[ atoms ]
1002
N N 0.000 0
1003
CA C1 0.000 1
1004
HA HC 0.000 1
1005
CB C2 0.000 2
1006
HB1 HC 0.000 2
1007
HB2 HC 0.000 2
1008
CG C2 0.000 3
1009
HG1 HC 0.000 3
1010
HG2 HC 0.000 3
1011
CD C2 0.000 4
1012
HD1 HC 0.000 4
1013
HD2 HC 0.000 4
1014
C C 0.380 5
1015
O O -0.380 5
1016
[ bonds ]
1017
N CA
1018
CA HA
1019
CA CB
1020
CA C
1021
CB HB1
1022
CB HB2
1023
CB CG
1024
CG HG1
1025
CG HG2
1026
CG CD
1027
CD HD1
1028
CD HD2
1029
CD N
1030
C O
1031
-C N
1032
[ impropers ]
1033
N -C CA CD
1034
-C -CA N -O
1035
CA N C CB
1036
1037
[ SER ]
1038
[ atoms ]
1039
N N -0.280 0
1040
H H 0.280 0
1041
CA C1 0.000 1
1042
HA HC 0.000 1
1043
CB C2 0.150 2
1044
HB1 HC 0.000 2
1045
HB2 HC 0.000 2
1046
OG OA -0.548 2
1047
HG HO 0.398 2
1048
C C 0.380 3
1049
O O -0.380 3
1050
[ bonds ]
1051
N H
1052
N CA
1053
CA HA
1054
CA CB
1055
CA C
1056
CB HB1
1057
CB HB2
1058
CB OG
1059
OG HG
1060
C O
1061
-C N
1062
[ impropers ]
1063
N -C CA H
1064
-C -CA N -O
1065
CA N C CB
1066
1067
[ THR ]
1068
[ atoms ]
1069
N N -0.280 0
1070
H H 0.280 0
1071
CA C1 0.000 1
1072
HA HC 0.000 1
1073
CB C1 0.150 2
1074
HB HC 0.000 2
1075
OG1 OA -0.548 2
1076
HG1 HO 0.398 2
1077
CG2 C3 0.000 3
1078
HG21 HC 0.000 3
1079
HG22 HC 0.000 3
1080
HG23 HC 0.000 3
1081
C C 0.380 4
1082
O O -0.380 4
1083
[ bonds ]
1084
N H
1085
N CA
1086
CA HA
1087
CA CB
1088
CA C
1089
CB HB
1090
CB OG1
1091
CB CG2
1092
OG1 HG1
1093
CG2 HG21
1094
CG2 HG22
1095
CG2 HG23
1096
C O
1097
-C N
1098
[ impropers ]
1099
N -C CA H
1100
-C -CA N -O
1101
CA N C CB
1102
CB OG1 CG2 CA
1103
1104
[ TRP ]
1105
[ atoms ]
1106
N N -0.280 0
1107
H H 0.280 0
1108
CA C1 0.000 1
1109
HA HC 0.000 1
1110
CB C2 0.000 2
1111
HB1 HC 0.000 2
1112
HB2 HC 0.000 2
1113
CG CB -0.140 3
1114
CD1 CR5 -0.140 3
1115
HD1 HCR 0.140 3
1116
CD2 CB 0.000 3
1117
NE1 NR5* -0.050 3
1118
HE1 H 0.190 3
1119
CE2 CB 0.000 4
1120
CE3 CR6 -0.140 5
1121
HE3 HCR 0.140 5
1122
CZ2 CR6 -0.140 6
1123
HZ2 HCR 0.140 6
1124
CZ3 CR6 -0.140 7
1125
HZ3 HCR 0.140 7
1126
CH2 CR6 -0.140 8
1127
HH2 HCR 0.140 8
1128
C C 0.380 9
1129
O O -0.380 9
1130
[ bonds ]
1131
N H
1132
N CA
1133
CA HA
1134
CA CB
1135
CA C
1136
CB HB1
1137
CB HB2
1138
CB CG
1139
CG CD1
1140
CG CD2
1141
CD1 HD1
1142
CD1 NE1
1143
CD2 CE2
1144
CD2 CE3
1145
NE1 HE1
1146
NE1 CE2
1147
CE2 CZ2
1148
CE3 HE3
1149
CE3 CZ3
1150
CZ2 HZ2
1151
CZ2 CH2
1152
CZ3 HZ3
1153
CZ3 CH2
1154
CH2 HH2
1155
C O
1156
-C N
1157
[ impropers ]
1158
N -C CA H
1159
CA N C CB
1160
CG CD1 CD2 CB
1161
CD2 CG CD1 NE1
1162
CD1 CG CD2 CE2
1163
CG CD1 NE1 CE2
1164
CG CD2 CE2 NE1
1165
CD1 NE1 CE2 CD2
1166
NE1 CD1 CE2 HE1
1167
CD1 CG NE1 HD1
1168
CD2 CE2 CE3 CG
1169
CE2 CD2 CZ2 NE1
1170
CE3 CD2 CE2 CZ2
1171
CD2 CE2 CZ2 CH2
1172
CE2 CD2 CE3 CZ3
1173
CE2 CZ2 CH2 CZ3
1174
CD2 CE3 CZ3 CH2
1175
CE3 CZ3 CH2 CZ2
1176
CE3 CD2 CZ3 HE3
1177
CZ3 CE3 CH2 HZ3
1178
CH2 CZ3 CZ2 HH2
1179
CZ2 CH2 CE2 HZ2
1180
-C -CA N -O
1181
1182
[ TYR ]
1183
[ atoms ]
1184
N N -0.280 0
1185
H H 0.280 0
1186
CA C1 0.000 1
1187
HA HC 0.000 1
1188
CB C2 0.000 2
1189
HB1 HC 0.000 2
1190
HB2 HC 0.000 2
1191
CG CB 0.000 3
1192
CD1 CR6 -0.140 4
1193
HD1 HCR 0.140 4
1194
CD2 CR6 -0.140 5
1195
HD2 HCR 0.140 5
1196
CE1 CR6 -0.140 6
1197
HE1 HCR 0.140 6
1198
CE2 CR6 -0.140 7
1199
HE2 HCR 0.140 7
1200
CZ CB 0.150 8
1201
OH OA -0.548 8
1202
HH HO 0.398 8
1203
C C 0.380 9
1204
O O -0.380 9
1205
[ bonds ]
1206
N H
1207
N CA
1208
CA HA
1209
CA CB
1210
CA C
1211
CB HB1
1212
CB HB2
1213
CB CG
1214
CG CD1
1215
CG CD2
1216
CD1 HD1
1217
CD1 CE1
1218
CD2 HD2
1219
CD2 CE2
1220
CE1 HE1
1221
CE1 CZ
1222
CE2 HE2
1223
CE2 CZ
1224
CZ OH
1225
OH HH
1226
C O
1227
-C N
1228
[ impropers ]
1229
N -C CA H
1230
CA N C CB
1231
CG CD1 CD2 CB
1232
CD2 CG CD1 CE1
1233
CD1 CG CD2 CE2
1234
CG CD1 CE1 CZ
1235
CG CD2 CE2 CZ
1236
CD1 CE1 CZ CE2
1237
CD2 CE2 CZ CE1
1238
CD1 CE1 CG HD1
1239
CE1 CD1 CZ HE1
1240
CZ CE1 CE2 OH
1241
CE2 CZ CD2 HE2
1242
CD2 CE2 CG HD2
1243
-C -CA N -O
1244
1245
[ VAL ]
1246
[ atoms ]
1247
N N -0.280 0
1248
H H 0.280 0
1249
CA C1 0.000 1
1250
HA HC 0.000 1
1251
CB C1 0.000 2
1252
HB HC 0.000 2
1253
CG1 C3 0.000 3
1254
HG11 HC 0.000 3
1255
HG12 HC 0.000 3
1256
HG13 HC 0.000 3
1257
CG2 C3 0.000 4
1258
HG21 HC 0.000 4
1259
HG22 HC 0.000 4
1260
HG23 HC 0.000 4
1261
C C 0.380 5
1262
O O -0.380 5
1263
[ bonds ]
1264
N H
1265
N CA
1266
CA HA
1267
CA CB
1268
CA C
1269
CB HB
1270
CB CG1
1271
CB CG2
1272
CG1 HG11
1273
CG1 HG12
1274
CG1 HG13
1275
CG2 HG21
1276
CG2 HG22
1277
CG2 HG23
1278
C O
1279
-C N
1280
[ impropers ]
1281
N -C CA H
1282
-C -CA N -O
1283
CA N C CB
1284
CB CG2 CG1 CA