share/top/ions.itp

   1 #ifdef _FF_GROMACS
   2
   3 [ moleculetype ]
   4 ; molname       nrexcl
   5 K               1
   6
   7 [ atoms ]
   8 ; id    at type res nr  residu name     at name  cg nr   charge
   9 1       K       1       K               K        1       1
  10
  11 [ moleculetype ]
  12 ; molname       nrexcl
  13 Na              1
  14
  15 [ atoms ]
  16 ; id    at type res nr  residu name     at name  cg nr  charge
  17 1       Na      1       Na              Na       1      1
  18
  19 [ moleculetype ]
  20 ; molname       nrexcl
  21 Ca              1
  22
  23 [ atoms ]
  24 ; id    at type res nr  residu name     at name  cg nr  charge
  25 1       Ca      1       Ca              Ca       1      2
  26
  27 [ moleculetype ]
  28 ; molname       nrexcl
  29 Mg              1
  30
  31 [ atoms ]
  32 ; id    at type res nr  residu name     at name  cg nr  charge
  33 1       Mg      1       Mg              Mg       1      2
  34
  35 [ moleculetype ]
  36 ; molname       nrexcl
  37 Cl              1
  38
  39 [ atoms ]
  40 ; id    at type res nr  residu name     at name  cg nr  charge
  41 1       Cl      1       Cl              Cl       1      -1
  42
  43 [ moleculetype ]
  44 ; molname       nrexcl
  45 Zn              1
  46
  47 [ atoms ]
  48 ; id    at type res nr  residu name     at name  cg nr  charge
  49 1       Zn      1       Zn              Zn       1      2
  50
  51 #endif
  52
  53 #ifdef _FF_GROMOS96
  54
  55 [ moleculetype ]
  56 ; molname       nrexcl
  57 CU1+            1
  58
  59 [ atoms ]
  60 ; id    at type res nr  residu name     at name  cg nr  charge   mass
  61 1       CU1+    1       CU1+            CU1+     1      1        63.54600
  62
  63 [ moleculetype ]
  64 ; molname       nrexcl
  65 CU2+            1
  66
  67 [ atoms ]
  68 ; id    at type res nr  residu name     at name  cg nr  charge   mass
  69 1       CU2+    1       CU2+            CU       1      2        63.54600
  70
  71 [ moleculetype ]
  72 ; molname       nrexcl
  73 ZN2+            1
  74
  75 [ atoms ]
  76 ; id    at type res nr  residu name     at name  cg nr  charge   mass
  77 1       ZN2+    1       ZN2+            ZN       1      2        65.37000
  78
  79 [ moleculetype ]
  80 ; molname       nrexcl
  81 MG2+            1
  82
  83 [ atoms ]
  84 ; id    at type res nr  residu name     at name  cg nr  charge   mass
  85 1       MG2+    1       MG2+            MG       1      2        24.30500
  86
  87 [ moleculetype ]
  88 ; molname       nrexcl
  89 CA2+            1
  90
  91 [ atoms ]
  92 ; id    at type res nr  residu name     at name  cg nr  charge   mass
  93 1       CA2+    1       CA2+            CA       1      2        40.08000
  94
  95 [ moleculetype ]
  96 ; molname       nrexcl
  97 NA+             1
  98
  99 [ atoms ]
 100 ; id    at type res nr  residu name     at name  cg nr  charge   mass
 101 1       NA+     1       NA+             NA       1      1        22.9898
 102
 103 [ moleculetype ]
 104 ; molname       nrexcl
 105 CL-             1
 106
 107 [ atoms ]
 108 ; id    at type res nr  residu name     at name  cg nr  charge   mass
 109 1       CL-     1       CL-             CL       1      -1       35.45300
 110
 111 #endif