src/makef/README

   1 In the Makefile.$CPU you set compiler, linker & archiver to use
   2 on your machine.
   3
   4 In the table below you'll find some info about the variables
   5 these are just example values that might be useful on your machine
   6
   7 Variable=       Value                   Meaning
   8 SYSDEFS =                               System dependent defines, which
   9                                         usually must not be changed
  10 CC      =       cc                      This is the Ansi-C compiler
  11 CFLAGS  =       -O2                     C Compiler Flags (optimize)
  12 LDFLAGS =       -g -L$(LIBDIR)          Linker options
  13 LD      =       $(CC) $(LDFLAGS)        The link command
  14 F77     =       f77                     Fortran compiler (optional)
  15 FFLAGS  =       -O3                     Fortran compiler options
  16 SYSLIBS =       -lm                     System dependent default
  17                                         libraries
  18 XLIBS   =       $(SYSLIBS) -lX11        System libraries for X-Windows
  19 ARFLAGS =       q                       The options for the archiver (to make
  20                                         GROMACS library files from objects)
  21 RANLIB  =       echo                    Some systems use ranlib to postprocess
  22                                         library files (esp. BSD systems)
  23 X11INC  =       -I/usr1/local/include   Include directory for X Windows
  24                                         header files
  25
  26 SHAREIT   Optional, here you can enter the compile line to make a static
  27           library shared, Gromacs will then use shared libraries
  28
  29 CC_MKINL  Optional, special compile command for mkinl
  30 LD_MKINL  Optional, special link command for mkinl
  31           These options are needed for machines like IBM SP2 where code
  32           compiled with the MPI cc command (e.g. mpcc) does not run without
  33           allocating processor time. mkinl is needed at compile time
  34           to make the innerloops and does not run in parallel.
  35
  36 #
  37 #       MDRUN STUFF
  38 #
  39 #
  40 RUNLDOPT     Special link options for mdrun
  41 LINKSTATIC   Option to link the gromacs libraries static
  42 LINKDYNAMIC  Option to link the system libraries dynamic
  43 #
  44 PARALLEL_ONLY_MDRUN  Useful only when compiling parallel code on machines
  45                      which can not execute non-parallel programs linked
  46                      with the mpi (or pvm) library, such as IBM SP2.
  47                      When set to yes only mdrun is made and placed
  48                      in a directory ending in _mpi or _pvm,
  49                      The libraries are also in seperate directories.
  50
  51 #
  52 #       USER MODIFIABLE SECTION
  53 #
  54 #WARNING
  55 #WARNING The fortran innerloops are only tested on the following
  56 #WARNING architectures:
  57 #WARNING
  58 #WARNING SGI, SUN, ULT, SP2, SMP, DEC
  59 #WARNING
  60 #WARNING On LNX they work in single precision, but with egcs 1.1.2
  61 #WARNING you hardly get any performance gain at all.
  62 #
  63 #       If you want to use fortran innerloops set this to yes
  64 USEF77          = yes
  65 #
  66 #       If you want to use MPI to run in parallel set this to yes
  67 USE_MPI         = no
  68 #       If you want to use PVM to run in parallel set this to yes
  69 USE_PVM3        = no
  70 #       If you want to use portable binary files set this to yes
  71 USE_XDR         = yes
  72
  73 # Note that these variables are also used in Makefile.std
  74 # If you experience any problems using PVM also check that file.