| blob | c18343a46f8ea96cae32d3c3f3cbb5e475225cd7 |
1 ; topology for 1,2-dilauroyl-sn-glycerol. Peter Tieleman, April 2 1995
3 [ moleculetype ]
4 ;name nrexcl
5 DLG 3
7 [ atoms ]
8 ; nr type resnr residu atom cgnr charge ; total charge
9 1 CH2 1 DLG C1 1 0.1500 ; 0.15
10 2 OA 1 DLG OA2 1 -0.5480 ; -0.4
11 3 HO 1 DLG HO3 1 0.3980 ; 0
12 4 CH1 1 DLG C4 2 0.1000 ; 0.10
13 5 OS 1 DLG OS5 2 -0.1800 ; -0.08
14 6 C 1 DLG C6 2 0.2700 ; 0.19
15 7 O 1 DLG O7 2 -0.1900 ; 0
16 8 CP2 1 DLG C8 3 0
17 9 CP2 1 DLG C9 4 0
18 10 CP2 1 DLG C10 5 0
19 11 CP2 1 DLG C11 6 0
20 12 CP2 1 DLG C12 7 0
21 13 CP2 1 DLG C13 8 0
22 14 CP2 1 DLG C14 9 0
23 15 CP2 1 DLG C15 10 0
24 16 CP2 1 DLG C16 11 0
25 17 CP2 1 DLG C17 12 0
26 18 CP3 1 DLG C18 13 0
27 19 CH2 1 DLG C19 14 0.1000
28 20 OS 1 DLG OS2 14 -0.1800
29 21 C 1 DLG C21 14 0.2700
30 22 O 1 DLG O22 14 -0.1900
31 23 CP2 1 DLG C23 15 0
32 24 CP2 1 DLG C24 16 0
33 25 CP2 1 DLG C25 17 0
34 26 CP2 1 DLG C26 18 0
35 27 CP2 1 DLG C27 19 0
36 28 CP2 1 DLG C28 20 0
37 29 CP2 1 DLG C29 21 0
38 30 CP2 1 DLG C30 22 0
39 31 CP2 1 DLG C31 23 0
40 32 CP2 1 DLG C32 24 0
41 33 CP3 1 DLG C33 25 0
43 [ bonds ]
44 ; ai aj funct c0 c1
45 3 2 1
46 1 2 1
47 1 4 1
48 4 5 1
49 6 5 1
50 6 7 1
51 8 6 1
52 8 9 1
53 9 10 1
54 10 11 1
55 11 12 1
56 12 13 1
57 13 14 1
58 14 15 1
59 15 16 1
60 16 17 1
61 17 18 1
62 19 4 1
63 19 20 1
64 20 21 1
65 21 22 1
66 23 21 1
67 23 24 1
68 24 25 1
69 25 26 1
70 26 27 1
71 27 28 1
72 28 29 1
73 29 30 1
74 30 31 1
75 31 32 1
76 32 33 1
78 [ pairs ]
79 ; ai aj funct
80 1 6 1 ;
81 1 20 1 ;
82 2 5 1 ;
83 2 19 1 ;
84 3 4 1 ;
85 4 7 1 ;
86 4 8 1 ;
87 4 21 1 ;
88 5 9 1 ;
89 5 20 1 ;
90 6 10 1 ;
91 6 19 1 ;
92 7 9 1 ;
93 ; 8 11 1 ; Not used for Ryckaert-Bellemans potential
94 ; 9 12 1 ;
95 ; 10 13 1 ;
96 ; 11 14 1 ;
97 ; 12 15 1 ;
98 ; 13 16 1 ;
99 ; 14 17 1 ;
100 ; 15 18 1 ;
101 19 22 1 ;
102 19 23 1 ;
103 20 24 1 ;
104 21 25 1 ;
105 22 24 1 ;
106 ; 23 26 1 ;
107 ; 24 27 1 ;
108 ; 25 28 1 ;
109 ; 26 29 1 ;
110 ; 27 30 1 ;
111 ; 28 31 1 ;
112 ; 29 32 1 ;
113 ; 30 33 1
115 [ angles ]
116 ; ai aj ak funct c0 c1
117 3 2 1 1
118 4 1 2 1
119 1 4 5 1
120 4 5 6 1
121 5 6 7 1
122 8 6 7 1
123 9 8 6 1
124 8 9 10 1
125 9 10 11 1
126 10 11 12 1
127 11 12 13 1
128 12 13 14 1
129 13 14 15 1
130 14 15 16 1
131 15 16 17 1
132 16 17 18 1
133 1 4 19 1
134 19 4 5 1
135 4 19 20 1
136 19 20 21 1
137 20 21 22 1
138 23 21 22 1
139 21 23 24 1
140 23 24 25 1
141 24 25 26 1
142 25 26 27 1
143 26 27 28 1
144 27 28 29 1
145 28 29 30 1
146 29 30 31 1
147 30 31 32 1
148 31 32 33 1
150 [ dihedrals ]
151 ; ai aj ak al funct c0 c1 c2
152 4 1 2 3 1
153 2 1 4 5 1
154 2 1 4 19 1
155 20 19 4 1 1
156 20 19 4 5 1
157 1 4 5 6 1
158 19 4 5 6 1
159 7 6 5 4 1
160 8 6 5 4 1
161 9 8 6 5 1
162 9 8 6 7 1
163 6 8 9 10 1
164 8 9 10 11 3
165 9 10 11 12 3
166 10 11 12 13 3
167 11 12 13 14 3
168 12 13 14 15 3
169 13 14 15 16 3
170 14 15 16 17 3
171 15 16 17 18 3
172 21 20 19 4 1
173 22 21 20 19 1
174 23 21 20 19 1
175 24 23 21 20 1
176 24 23 21 22 1
177 21 23 24 25 1
178 23 24 25 26 3
179 24 25 26 27 3
180 25 26 27 28 3
181 26 27 28 29 3
182 27 28 29 30 3
183 28 29 30 31 3
184 29 30 31 32 3
185 30 31 32 33 3
187 [ dihedrals ]
188 ; ai aj ak al funct
189 4 1 19 5 2
190 6 5 8 7 2
191 21 20 23 22 2