Removed refs to charmm files in share/top/Makefile.am
[gromacs/qmmm-gamess-us.git] / share / top / ffG43a2.atp
blob3fa34e288501fda3bf79434a9e8872b5456cbc01
1     O  15.99940 ;     carbonyl oxygen (C=O)
2    OM  15.99940 ;     carboxyl oxygen (CO-)
3    OA  15.99940 ;     hydroxyl, sugar or ester oxygen
4    OW  15.99940 ;     water oxygen
5     N  14.00670 ;     peptide nitrogen (N or NH)
6    NT  14.00670 ;     terminal nitrogen (NH2)
7    NL  14.00670 ;     terminal nitrogen (NH3)
8    NR  14.00670 ;     aromatic nitrogen
9    NZ  14.00670 ;     Arg NH (NH2)
10    NE  14.00670 ;     Arg NE (NH)
11     C  12.01100 ;     bare carbon
12   CH1  13.01900 ;     aliphatic or sugar CH-group
13   CH2  14.02700 ;     aliphatic or sugar CH2-group
14   CH3  15.03500 ;     aliphatic CH3-group
15   CH4  16.04300 ;     methane
16   CR1  13.01900 ;     aromatic CH-group 
17    HC   1.00800 ;     hydrogen bound to carbon
18     H   1.00800 ;     hydrogen not bound to carbon
19   DUM   0.00000 ;     dummy atom, no idea what the mass should be. PT3-99
20     S  32.06000 ;     sulfur
21  CU1+  63.54600 ;     copper (charge 1+)
22  CU2+  63.54600 ;     copper (charge 2+)
23    FE  55.84700 ;     iron (heme)
24  ZN2+  65.37000 ;     zinc (charge 2+)
25  MG2+  24.30500 ;     magnesium (charge 2+)
26  CA2+  40.08000 ;     calcium (charge 2+)
27     P  30.97380 ;     phosphor
28    AR  39.94800 ;     argon
29     F  18.99840 ;     fluor (non-ionic)
30    CL  35.45300 ;     chlorine (non-ionic)
31    BR  79.90400 ;     bromine (non-ionic)
32  CMET  15.035   ;     CH3-group in methanol (solvent)
33  OMET  15.9994  ;     oxygen in methanol (solvent)
34   NA+  22.9898  ;     sodium (charge 1+)
35   CL-  35.45300 ;     chlorine (charge 1-)
36  CCHL  12.011   ;     carbon in chloroform (solvent)
37 CLCHL  35.453   ;     chloride in chloroform (solvent)
38  HCHL  1.008    ;     hydrogen in chloroform (solvent)
39 SDMSO  32.06000 ;     DMSO Sulphur (solvent)
40 CDMSO  15.03500 ;     DMSO Carbon (solvent)
41 ODMSO  15.99940 ;     DMSO Oxygen (solvent)
42  CCL4  12.011   ;     carbon in carbontetrachloride (solvent)
43 CLCL4  35.453   ;     chloride in carbontetrachloride (solvent)
44    SI  28.08    ;     silicon
45  MNH3   0       ;     Dummy mass in rigid tetraedrical NH3 group
46    MW   0       ;     Dummy mass in rigid tyrosine rings
47    IW   0       ;     Dummy particle in TIP4P etc.
48  OWT3  15.99940 ;     TIP3P WATER OXYGEN                 
49  OWT4  15.99940 ;     TIP4P WATER OXYGEN