Removed refs to charmm files in share/top/Makefile.am
[gromacs/qmmm-gamess-us.git] / share / top / ffgmx2.hdb
blob6d2ce5e61b1250ffdaf3cd674ec939e568518a6a
1 ACE     1       
2 3       4       HA      CA      C       O
3 ALA     3       
4 1       1       H       N       -C      CA
5 1       5       HA      CA      N       C       CB
6 3       4       HB      CB      CA      N
7 ARG     8       
8 1       1       H       N       -C      CA
9 1       5       HA      CA      N       C       CB
10 2       6       HB      CB      CG      CA
11 2       6       HG      CG      CD      CB
12 2       6       HD      CD      NE      CG
13 1       1       HE      NE      CD      CZ
14 2       3       HH1     NH1     CZ      NE
15 2       3       HH2     NH2     CZ      NE
16 ASN     4       
17 1       1       H       N       -C      CA
18 1       5       HA      CA      N       C       CB
19 2       6       HB      CB      CG      CA
20 2       3       HD2     ND2     CG      CB
21 ASP     3       
22 1       1       H       N       -C      CA
23 1       5       HA      CA      N       C       CB
24 2       6       HB      CB      CG      CA
25 ASPH    4       
26 1       1       H       N       -C      CA
27 1       5       HA      CA      N       C       CB
28 2       6       HB      CB      CG      CA
29 1       2       HD1     OD1     CG      CB
30 CYS2    3       
31 1       1       H       N       -C      CA
32 1       5       HA      CA      N       C       CB
33 2       6       HB      CB      SG      CA
34 CYSH    4       
35 1       1       H       N       -C      CA
36 1       5       HA      CA      N       C       CB
37 2       6       HB      CB      SG      CA
38 1       2       HG      SG      CB      CA
39 FAD     7       
40 2       3       HN6     AN6     AC6     AC5
41 1       2       HO2*    AO2*    AC2*    AC1*
42 1       2       HO3*    AO3*    AC3*    AC2*
43 1       2       H4*     O4*     C4*     C5*
44 1       2       H3*     O3*     C3*     C4*
45 1       2       H2*     O2*     C2*     C3*
46 1       2       H3      N3      C4      C4A
47 GLN     5       
48 1       1       H       N       -C      CA
49 1       5       HA      CA      N       C       CB
50 2       6       HB      CB      CG      CA
51 2       6       HG      CG      CD      CB
52 2       3       HE2     NE2     CD      CG
53 GLU     4       
54 1       1       H       N       -C      CA
55 1       5       HA      CA      N       C       CB
56 2       6       HB      CB      CG      CA
57 2       6       HG      CG      CD      CB
58 GLUH    5       
59 1       1       H       N       -C      CA
60 1       5       HA      CA      N       C       CB
61 2       6       HB      CB      CG      CA
62 2       6       HG      CG      CD      CB
63 1       2       HE2     OE2     CD      CG
64 GLY     2       
65 1       1       H       N       -C      CA
66 2       6       HA      CA      C       N
67 HEME    18      
68 3       4       HMA     CMA     C3A     C4A
69 3       4       HMB     CMB     C2B     C3B
70 3       4       HMC     CMC     C2C     C3C
71 3       4       HMD     CMD     C2D     C1D
72 3       4       HBC     CBC     CAC     C3C
73 2       6       HAC     CAC     C3C     CBC
74 2       6       HAB     CAB     CBB     C3B
75 3       4       HBB     CBB     CAB     C3B
76 1       1       HHC     CHC     C4B     C1C
77 1       1       HHD     CHD     C4C     C1D
78 1       1       HHB     CHB     C4A     C1B
79 1       1       HHA     CHA     C4D     C1A
80 2       6       HBA     CBA     CAA     CGA
81 2       6       HAA     CAA     CBA     C2A
82 2       6       HBD     CBD     CAD     CGD
83 2       6       HAD     CAD     CBD     C2D
84 1       4       H2A     O2A     CGA     CBA
85 1       4       H2D     O2D     CGD     CBD
86 HIS1    6       
87 1       1       H       N       -C      CA
88 1       5       HA      CA      N       C       CB
89 2       6       HB      CB      CG      CA
90 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
91 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
92 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
93 HISA    6       
94 1       1       H       N       -C      CA
95 1       5       HA      CA      N       C       CB
96 2       6       HB      CB      CG      CA
97 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
98 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
99 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
100 HISB    6       
101 1       1       H       N       -C      CA
102 2       6       HB      CB      CG      CA
103 1       5       HA      CA      N       C       CB
104 1       1       HE2     NE2     CE1     CD2
105 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
106 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
107 HISH    7       
108 1       1       H       N       -C      CA
109 1       5       HA      CA      N       C       CB
110 2       6       HB      CB      CG      CA
111 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
112 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
113 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
114 1       1       HE2     NE2     CE1     CD2
115 HO4     1       
116 3       10      HW      OW
117 HOH     1       
118 2       7       HW      OW
119 HYP     3       
120 1       5       HA      CA      N       C       CB
121 1       2       HD1     OD1     CG      CB
122 1       5       HG      CG      CB      OD1     CD2
123 ILE     6       
124 1       1       H       N       -C      CA
125 1       5       HA      CA      N       C       CB
126 1       5       HB      CB      CA      CG1     CG2
127 2       6       HG1     CG1     CD      CB
128 3       4       HG2     CG2     CB      CA
129 3       4       HD      CD      CG1     CB
130 LEU     6       
131 1       1       H       N       -C      CA
132 1       5       HA      CA      N       C       CB
133 2       6       HB      CB      CG      CA
134 1       5       HG      CG      CB      CD1     CD2
135 3       4       HD1     CD1     CG      CB
136 3       4       HD2     CD2     CG      CB
137 LYS     7       
138 1       1       H       N       -C      CA
139 1       5       HA      CA      N       C       CB
140 2       6       HB      CB      CG      CA
141 2       6       HG      CG      CD      CB
142 2       6       HD      CD      CE      CG
143 2       6       HE      CE      NZ      CD
144 2       4       HZ      NZ      CE      CD
145 LYSH    7       
146 1       1       H       N       -C      CA
147 1       5       HA      CA      N       C       CB
148 2       6       HB      CB      CG      CA
149 2       6       HG      CG      CD      CB
150 2       6       HD      CD      CE      CG
151 2       6       HE      CE      NZ      CD
152 3       4       HZ      NZ      CE      CD
153 MET     5       
154 1       1       H       N       -C      CA
155 1       5       HA      CA      N       C       CB
156 2       6       HB      CB      CG      CA
157 2       6       HG      CG      SD      CB
158 3       4       HE      CE      SD      CG
159 NAC     2       
160 1       1       H       N       -C      CA
161 3       4       HA      CA      N       -C
162 NH2     1       
163 2       3       H       N       -C      -CA
164 OCT     8       
165 3       4       H1      C1      C2      C3
166 2       6       H2      C2      C1      C3
167 2       6       H3      C3      C2      C4
168 2       6       H4      C4      C3      C5
169 2       6       H5      C5      C4      C6
170 2       6       H6      C6      C5      C7
171 2       6       H7      C7      C6      C8
172 2       6       H8      C8      C7      O9
173 PHE     8       
174 1       1       H       N       -C      CA
175 1       5       HA      CA      N       C       CB
176 2       6       HB      CB      CG      CA
177 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
178 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
179 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
180 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
181 1       1       HZ      CZ      CE1     CE2
182 PRO     4       
183 1       5       HA      CA      N       C       CB
184 2       6       HB      CB      CG      CA
185 2       6       HG      CG      CD      CB
186 2       6       HD      CD      N       CG
187 SER     4       
188 1       1       H       N       -C      CA
189 1       5       HA      CA      N       C       CB
190 2       6       HB      CB      OG      CA
191 1       2       HG      OG      CB      CA
192 TFE     1       
193 1       2       H       O       C2      C1
194 THR     5       
195 1       1       H       N       -C      CA
196 1       5       HA      CA      N       C       CB
197 1       5       HB      CB      CA      OG1     CG2
198 1       2       HG1     OG1     CB      CA
199 3       4       HG2     CG2     CB      CA
200 TRP     9       
201 1       1       H       N       -C      CA
202 1       5       HA      CA      N       C       CB
203 2       6       HB      CB      CG      CA
204 1       1       HD1     CD1     NE1     CG
205 1       1       HE1     NE1     CD1     CE2
206 1       1       HE3     CE3     CD2     CZ3
207 1       1       HZ3     CZ3     CE3     CH2
208 1       1       HH2     CH2     CZ3     CZ2
209 1       1       HZ2     CZ2     CE2     CH2
210 TYR     8       
211 1       1       H       N       -C      CA
212 1       5       HA      CA      N       C       CB
213 2       6       HB      CB      CG      CA
214 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
215 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
216 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
217 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
218 1       2       HH      OH      CZ      CE1
219 VAL     5       
220 1       1       H       N       -C      CA
221 1       5       HA      CA      N       C       CB
222 1       5       HB      CB      CA      CG1     CG2
223 3       4       HG1     CG1     CB      CA
224 3       4       HG2     CG2     CB      CA