| blob | df422181d47fe653210cfe0fb4ca9e3669ed71d9 |
1 [ bondtypes ]
2 ; i j func b0 kb
3 C O 1 0.12300 502080.
4 C OM 1 0.12500 418400.
5 C OA 1 0.13600 376560.
6 C N 1 0.13300 418400.
7 C NT 1 0.13300 376560.
8 C NL 1 0.13300 376560.
9 CH1 OA 1 0.14300 334720.
10 CH1 N 1 0.14700 376560.
11 CH1 NT 1 0.14700 376560.
12 CH1 NL 1 0.14700 376560.
13 CH1 C 1 0.15300 334720.
14 CH1 CH1 1 0.15300 334720.
15 CH2 OM 1 0.14300 376560.
16 CH2 OA 1 0.14300 334720.
17 CH2 N 1 0.14700 376560.
18 CH2 NT 1 0.14700 376560.
19 CH2 NL 1 0.14700 376560.
20 CH2 C 1 0.15300 334720.
21 CH2 CH1 1 0.15300 334720.
22 CH2 CH2 1 0.15300 334720.
23 CH3 N 1 0.14700 376560.
24 CH3 C 1 0.15300 334720.
25 CH3 CH1 1 0.15300 334720.
26 CH3 CH2 1 0.15300 334720.
27 CR51 NR5 1 0.13300 418400.
28 CR51 NR5* 1 0.13300 418400.
29 CR61 CH2 1 0.13900 418400.
30 CR61 CR61 1 0.13900 418400.
31 CB O 1 0.12300 502080.
32 CB OA 1 0.13600 376560.
33 CB NT 1 0.13300 376560.
34 CB NR5 1 0.13300 418400.
35 CB NR5* 1 0.13300 418400.
36 CB NP 1 0.13800 418400.
37 CB C 1 0.15300 334720.
38 CB CH2 1 0.15300 334720.
39 CB CH3 1 0.15300 334720.
40 CB CR51 1 0.13300 418400.
41 CB CR61 1 0.13900 418400.
42 CB CB 1 0.13900 418400.
43 CHE O 1 0.12300 502080.
44 CHE OA 1 0.13600 376560.
45 CHE NT 1 0.13300 376560.
46 CHE NR5 1 0.13300 418400.
47 CHE NR5* 1 0.13300 418400.
48 CHE NP 1 0.13800 418400.
49 CHE C 1 0.15300 334720.
50 CHE CH2 1 0.15300 334720.
51 CHE CH3 1 0.15300 334720.
52 CHE CR51 1 0.13300 418400.
53 CHE CR61 1 0.13900 418400.
54 CHE CB 1 0.13900 418400.
55 CHE CHE 1 0.13900 418400.
56 H N 1 0.10000 374468.
57 H NT 1 0.10000 374468.
58 H NL 1 0.10000 374468.
59 H NR5* 1 0.10000 374468.
60 HO OA 1 0.10000 313800.
61 HW OW 1 0.10000 418400.
62 S O 1 0.15000 376560.
63 S CH2 1 0.18300 376560.
64 S CH3 1 0.17800 376560.
65 S HS 1 0.13300 313800.
66 S S 1 0.20400 418400.
67 FE NR5 1 0.19800 418400.
68 FE NP 1 0.20900 418400.
69 NZ C 1 0.13400 376560.
70 NZ H 1 0.10000 374468.
71 NE C 1 0.13400 376560.
72 NE CH2 1 0.14700 376560.
73 NE H 1 0.10000 374468.
74 P OM 1 0.14800 376560.
75 P OA 1 0.16100 251040.
76 OS CH2 1 0.14300 251040.
77 OS P 1 0.16100 251040.
78 CS1 OA 1 0.14300 251040.
79 CS1 NR5* 1 0.14800 251040.
80 CS1 CH2 1 0.15300 251040.
81 CS1 OS 1 0.14350 251040.
82 CS1 CS1 1 0.15200 251040.
83 NR6 CR61 1 0.13200 418400.
84 NR6 CB 1 0.13400 418400.
85 NR6 CHE 1 0.13400 418400.
86 NR6* CH2 1 0.14800 334720.
87 NR6* CH3 1 0.14800 334720.
88 NR6* CR61 1 0.14000 334720.
89 NR6* CB 1 0.14000 334720.
90 NR6* CHE 1 0.14000 334720.
91 NR6* H 1 0.10000 374468.
92 NR6* CS1 1 0.14800 334720.
93 CS2 OA 1 0.14300 251040.
94 CS2 CR61 1 0.13900 334720.
95 CS2 CB 1 0.13900 334720.
96 CS2 CHE 1 0.13900 334720.
97 CS2 OS 1 0.14350 251040.
98 CS2 CS1 1 0.15200 251040.
99 CS2 NR6* 1 0.14000 334720.
100 SI CH1 1 0.18700 251040.
101 SI OS 1 0.16300 251040.
102 F C 1 0.13600 418400.
103 CR5 HCR 1 0.10800 292880.
104 CR6 HCR 1 0.10800 292880.
105 CB CR6 1 0.13900 418400.
106 CHE CR6 1 0.13900 418400.
107 CR51 CR51 1 0.13300 418400.
108 NR6 CH2 1 0.13400 418400.
109 ; NR6* CH2 1 0.13400 418400.
110 NR6* CR5 1 0.13400 418400.
111 CB CR5 1 0.13900 418400.
112 CHE CR5 1 0.13900 418400.
113 CR5 NR5 1 0.13300 418400.
114 CR5 NR5* 1 0.13300 418400.
115 CR6 CH2 1 0.13900 418400.
116 CR6 CR6 1 0.13900 418400.
117 CP2 CP2 1 0.15300 334720.
118 CP3 CP2 1 0.15300 334720.
119 C CP2 1 0.15300 334720.
120 OS C 1 0.14350 251040.
121 CH1 OS 1 0.14350 251040.
122 OM S 1 0.15000 376650.
124 ; get the constraint distances:
125 #include "ff_dum.itp"
127 [ constrainttypes ]
128 ; now the constraints for the rigid NH3 groups
129 MNH3 C 2 DC_MNC1
130 MNH3 CB 2 DC_MNC1
131 MNH3 CHE 2 DC_MNC1
132 MNH3 CH1 2 DC_MNC2
133 MNH3 CH2 2 DC_MNC2
134 MNH3 MNH3 2 DC_MNMN
135 ; and the angle-constraints for OH and SH groups in proteins:
136 CH2 HS 2 DC_CS
137 CH2 HO 2 DC_CO
138 CH1 HO 2 DC_CO
139 CB HO 2 DC_CO
140 C HO 2 DC_CO
141 P HO 2 DC_PO
143 [ angletypes ]
144 ; i j k func th0 cth
145 HO OA C 1 109.500 397.480
146 HO OA CH1 1 109.500 397.480
147 HO OA CH2 1 109.500 397.480
148 HO OA CB 1 109.500 397.480
149 HO OA CHE 1 109.500 397.480
150 P OA HO 1 109.500 397.480
151 CS1 OA HO 1 109.500 397.480
152 CS2 OA HO 1 109.500 397.480
153 HW OW HW 1 109.500 502.080
154 CH1 N C 1 122.000 502.080
155 CH2 N C 1 122.000 502.080
156 CH2 N CH1 1 116.000 502.080
157 CH3 N C 1 117.000 502.080
158 CH3 N CH1 1 125.000 502.080
159 CH3 N CH2 1 125.000 502.080
160 H N C 1 123.000 292.880
161 H N CH1 1 115.000 376.560
162 H N CH2 1 115.000 376.560
163 H N CH3 1 120.000 376.560
164 H NT C 1 120.000 292.880
165 H NT CH1 1 120.000 376.560
166 H NT CH2 1 120.000 376.560
167 H NT CB 1 120.000 292.880
168 H NT CHE 1 120.000 292.880
169 H NT H 1 120.000 334.720
170 H NL C 1 109.500 376.560
171 H NL CH1 1 109.500 376.560
172 H NL CH2 1 109.500 376.560
173 H NL H 1 109.500 334.720
174 CR51 NR5 CR51 1 108.000 418.400
175 CB NR5 CR51 1 108.000 418.400
176 CHE NR5 CR51 1 108.000 418.400
177 FE NR5 CR51 1 125.000 251.040
178 CR51 NR5* CR51 1 108.000 418.400
179 CB NR5* CR51 1 108.000 418.400
180 CHE NR5* CR51 1 108.000 418.400
181 CS1 NR5* CR51 1 126.000 418.400
182 CS1 NR5* CB 1 126.000 418.400
183 CS1 NR5* CHE 1 126.000 418.400
184 H NR5* CR51 1 126.000 376.560
185 H NR5* CB 1 126.000 376.560
186 CB NP CB 1 108.000 418.400
187 FE NP CB 1 126.000 418.400
188 H NR5* CHE 1 126.000 376.560
189 CB NP CHE 1 108.000 418.400
190 FE NP CHE 1 126.000 418.400
191 CHE NP CHE 1 108.000 418.400
192 OM C OM 1 126.000 502.080
193 OA C O 1 124.000 502.080
194 N C O 1 124.000 502.080
195 NT C O 1 124.000 502.080
196 NL C O 1 124.000 502.080
197 CH1 C O 1 121.000 502.080
198 CH1 C OM 1 117.000 502.080
199 CH1 C OA 1 115.000 502.080
200 CH1 C N 1 115.000 502.080
201 CH1 C NT 1 115.000 502.080
202 CH2 C O 1 121.000 502.080
203 CH2 C OM 1 117.000 502.080
204 CH2 C OA 1 115.000 502.080
205 CH2 C N 1 115.000 502.080
206 CH2 C NT 1 115.000 502.080
207 CH2 C NL 1 115.000 502.080
208 CH3 C O 1 121.000 502.080
209 CH3 C N 1 115.000 502.080
210 CB C O 1 121.000 502.080
211 CB C N 1 115.000 502.080
212 CB C NT 1 115.000 502.080
213 CHE C O 1 121.000 502.080
214 CHE C N 1 115.000 502.080
215 CHE C NT 1 115.000 502.080
216 NZ C NZ 1 120.000 502.080
217 NE C NZ 1 120.000 502.080
218 C CH1 N 1 109.500 460.240
219 C CH1 NT 1 109.500 460.240
220 C CH1 NL 1 109.500 460.240
221 CH1 CH1 OA 1 109.500 460.240
222 CH1 CH1 N 1 109.500 460.240
223 CH1 CH1 NT 1 109.500 460.240
224 CH1 CH1 NL 1 109.500 460.240
225 CH1 CH1 C 1 109.500 460.240
226 CH1 CH1 CH1 1 111.000 460.240
227 CH2 CH1 OA 1 109.500 460.240
228 CH2 CH1 N 1 109.500 460.240
229 CH2 CH1 NT 1 109.500 460.240
230 CH2 CH1 NL 1 109.500 460.240
231 CH2 CH1 C 1 109.500 460.240
232 CH2 CH1 CH1 1 111.000 460.240
233 CH2 CH1 CH2 1 109.500 460.240
234 CH3 CH1 OA 1 111.000 460.240
235 CH3 CH1 N 1 109.500 460.240
236 CH3 CH1 NT 1 109.500 460.240
237 CH3 CH1 NL 1 109.500 460.240
238 CH3 CH1 C 1 109.500 460.240
239 CH3 CH1 CH1 1 111.000 460.240
240 CH3 CH1 CH2 1 111.000 460.240
241 CH3 CH1 CH3 1 111.000 460.240
242 SI CH1 CH3 1 109.500 460.240
243 C CH2 N 1 109.500 460.240
244 C CH2 NT 1 109.500 460.240
245 C CH2 NL 1 109.500 460.240
246 CH1 CH2 OA 1 109.500 460.240
247 CH1 CH2 N 1 109.500 460.240
248 CH1 CH2 C 1 111.000 460.240
249 CH1 CH2 CH1 1 109.500 460.240
250 CH2 CH2 OM 1 109.500 460.240
251 CH2 CH2 OA 1 109.500 460.240
252 CH2 CH2 N 1 109.500 460.240
253 CH2 CH2 NT 1 109.500 460.240
254 CH2 CH2 NL 1 109.500 460.240
255 CH2 CH2 C 1 111.000 460.240
256 CH2 CH2 CH1 1 111.000 460.240
257 CH2 CH2 CH2 1 111.000 460.240
258 CH3 CH2 OM 1 109.500 460.240
259 CH3 CH2 OA 1 111.000 460.240
260 CH3 CH2 CH2 1 111.000 460.240
261 CH3 CH2 CH1 1 111.000 460.240
262 CB CH2 OM 1 109.500 460.240
263 CB CH2 CH1 1 111.000 460.240
264 CB CH2 CH2 1 111.000 460.240
265 CHE CH2 OM 1 109.500 460.240
266 CHE CH2 CH1 1 111.000 460.240
267 CHE CH2 CH2 1 111.000 460.240
268 S CH2 CH1 1 113.000 460.240
269 S CH2 CH2 1 113.000 460.240
270 NE CH2 CH2 1 109.500 460.240
271 OS CH2 CH1 1 111.000 460.240
272 NR6* CH2 CH1 1 111.000 460.240
273 NR6* CH2 CB 1 109.500 460.240
274 NR6* CH2 CHE 1 109.500 460.240
275 NR6* CH2 CS1 1 109.500 460.240
276 NR5* CR51 NR5 1 108.000 418.400
277 NR5* CR51 NR5* 1 108.000 418.400
278 CB CR51 NR5 1 108.000 418.400
279 CB CR51 NR5* 1 108.000 418.400
280 CHE CR51 NR5 1 108.000 418.400
281 CHE CR51 NR5* 1 108.000 418.400
282 CR61 CR61 CR61 1 120.000 418.400
283 CB CR61 CH2 1 126.000 418.400
284 CB CR61 CR61 1 120.000 418.400
285 CB CR61 CB 1 120.000 418.400
286 CHE CR61 CH2 1 126.000 418.400
287 CHE CR61 CR61 1 120.000 418.400
288 CHE CR61 CB 1 120.000 418.400
289 NR6 CR61 CB 1 120.000 418.400
290 NR6 CR61 CHE 1 120.000 418.400
291 NR6 CR61 NR6 1 120.000 418.400
292 NR6* CR61 CR61 1 120.000 418.400
293 NR6* CR61 CB 1 120.000 418.400
294 NR6* CR61 CHE 1 120.000 418.400
295 CS2 CR61 CR61 1 120.000 418.400
296 CH2 CB NR5 1 126.000 418.400
297 CH2 CB NR5* 1 126.000 418.400
298 CR51 CB NR5 1 108.000 418.400
299 CR51 CB NR5* 1 108.000 418.400
300 CR51 CB CH2 1 126.000 418.400
301 CR61 CB OA 1 120.000 418.400
302 CR61 CB NT 1 120.000 418.400
303 CR61 CB NR5* 1 132.000 418.400
304 CR61 CB NP 1 126.000 418.400
305 CR61 CB C 1 120.000 418.400
306 CR61 CB CH2 1 120.000 418.400
307 CR61 CB CH3 1 120.000 418.400
308 CR61 CB CR61 1 120.000 418.400
309 CB CB O 1 120.000 418.400
310 CB CB NT 1 120.000 418.400
311 CB CB NR5 1 108.000 418.400
312 CB CB NR5* 1 108.000 418.400
313 CB CB NP 1 108.000 418.400
314 CB CB CH2 1 126.000 418.400
315 CB CB CH3 1 120.000 418.400
316 CB CB CR51 1 108.000 418.400
317 CB CB CR61 1 120.000 418.400
318 CB CB CB 1 120.000 418.400
319 NR6 CB O 1 120.000 418.400
320 NR6 CB NT 1 120.000 418.400
321 NR6 CB NR5* 1 132.000 418.400
322 NR6 CB CH2 1 120.000 418.400
323 NR6 CB CR61 1 120.000 418.400
324 NR6 CB CB 1 120.000 418.400
325 NR6 CB NR6 1 120.000 418.400
326 NR6* CB O 1 120.000 418.400
327 NR6* CB NT 1 120.000 418.400
328 NR6* CB CR61 1 120.000 418.400
329 NR6* CB CB 1 120.000 418.400
330 NR6* CB NR6 1 120.000 418.400
331 NR6* CB NR6* 1 120.000 418.400
332 CS2 CB C 1 120.000 418.400
333 CS2 CB CH2 1 120.000 418.400
334 CS2 CB CR61 1 120.000 418.400
335 CS2 CB NR6 1 120.000 418.400
336 CH2 CHE NR5 1 126.000 418.400
337 CH2 CHE NR5* 1 126.000 418.400
338 CR51 CHE NR5 1 108.000 418.400
339 CR51 CHE NR5* 1 108.000 418.400
340 CR51 CHE CH2 1 126.000 418.400
341 CR61 CHE OA 1 120.000 418.400
342 CR61 CHE NT 1 120.000 418.400
343 CR61 CHE NR5* 1 132.000 418.400
344 CR61 CHE NP 1 126.000 418.400
345 CR61 CHE C 1 120.000 418.400
346 CR61 CHE CH2 1 120.000 418.400
347 CR61 CHE CH3 1 120.000 418.400
348 CR61 CHE CR61 1 120.000 418.400
349 CB CHE O 1 120.000 418.400
350 CB CHE NT 1 120.000 418.400
351 CB CHE NR5 1 108.000 418.400
352 CB CHE NR5* 1 108.000 418.400
353 CB CHE NP 1 108.000 418.400
354 CB CHE CH2 1 126.000 418.400
355 CB CHE CH3 1 120.000 418.400
356 CB CHE CR51 1 108.000 418.400
357 CB CHE CR61 1 120.000 418.400
358 CB CHE CB 1 120.000 418.400
359 CHE CHE O 1 120.000 418.400
360 CHE CHE NT 1 120.000 418.400
361 CHE CHE NR5 1 108.000 418.400
362 CHE CHE NR5* 1 108.000 418.400
363 CHE CHE NP 1 108.000 418.400
364 CHE CHE CH2 1 126.000 418.400
365 CHE CHE CR51 1 108.000 418.400
366 CHE CHE CB 1 120.000 418.400
367 NR6 CHE O 1 120.000 418.400
368 NR6 CHE NT 1 120.000 418.400
369 NR6 CHE NR5* 1 132.000 418.400
370 NR6 CHE CH2 1 120.000 418.400
371 NR6 CHE CR61 1 120.000 418.400
372 NR6 CHE CB 1 120.000 418.400
373 NR6 CHE CHE 1 120.000 418.400
374 NR6 CHE NR6 1 120.000 418.400
375 NR6* CHE O 1 120.000 418.400
376 NR6* CHE NT 1 120.000 418.400
377 NR6* CHE CR61 1 120.000 418.400
378 NR6* CHE CB 1 120.000 418.400
379 NR6* CHE NR6 1 120.000 418.400
380 NR6* CHE NR6* 1 120.000 418.400
381 CS2 CHE C 1 120.000 418.400
382 CS2 CHE CH2 1 120.000 418.400
383 CS2 CHE CR61 1 120.000 418.400
384 CS2 CHE NR6 1 120.000 418.400
385 CH3 S O 1 107.000 460.240
386 CH3 S CH2 1 100.000 460.240
387 CH3 S CH3 1 97.000 460.240
388 HS S CH2 1 96.000 397.480
389 S S CH2 1 104.000 460.240
390 NP FE NR5 1 115.000 41.840
391 NP FE NP 1 90.000 418.400
392 H NZ C 1 120.000 292.880
393 H NZ H 1 120.000 334.720
394 CH2 NE C 1 124.000 502.080
395 H NE C 1 120.000 292.880
396 H NE CH2 1 116.000 376.560
397 OM P OM 1 120.000 585.760
398 OA P OM 1 109.600 397.480
399 OS P OM 1 109.600 397.480
400 OS P OA 1 103.000 397.480
401 OS P OS 1 103.000 397.480
402 P OS CH2 1 120.000 397.480
403 P OS P 1 120.000 397.480
404 CS1 OS P 1 120.000 397.480
405 CS1 OS CS1 1 109.500 334.720
406 CS2 OS P 1 120.000 397.480
407 SI OS CS1 1 120.000 397.480
408 SI OS CS2 1 120.000 397.480
409 SI OS SI 1 155.000 397.480
410 OS CS1 NR5* 1 109.500 284.512
411 CS1 CS1 OA 1 109.500 284.512
412 CS1 CS1 NR5* 1 109.500 284.512
413 CS1 CS1 OS 1 109.500 284.512
414 CS1 CS1 CS1 1 109.500 251.040
415 NR6* CS1 CH2 1 109.500 251.040
416 NR6* CS1 OS 1 109.500 284.512
417 NR6* CS1 CS1 1 109.500 251.040
418 CS2 CS1 OA 1 109.500 284.512
419 CS2 CS1 NR5* 1 109.500 284.512
420 CS2 CS1 CH2 1 109.500 251.040
421 CS2 CS1 OS 1 109.500 284.512
422 CS2 CS1 CS1 1 109.500 251.040
423 CS2 CS1 NR6* 1 109.500 251.040
424 CB NR6 CR61 1 120.000 418.400
425 CB NR6 CB 1 120.000 418.400
426 CHE NR6 CR61 1 120.000 418.400
427 CHE NR6 CB 1 120.000 418.400
428 CHE NR6 CHE 1 120.000 418.400
429 CH3 NR6* CH2 1 120.000 418.400
430 CR61 NR6* CR61 1 120.000 418.400
431 CB NR6* CH2 1 120.000 418.400
432 CB NR6* CH3 1 120.000 418.400
433 CB NR6* CR61 1 120.000 418.400
434 CB NR6* CB 1 120.000 418.400
435 CHE NR6* CH2 1 120.000 418.400
436 CHE NR6* CH3 1 120.000 418.400
437 CHE NR6* CR61 1 120.000 418.400
438 CHE NR6* CB 1 120.000 418.400
439 CHE NR6* CHE 1 120.000 418.400
440 H NR6* CH2 1 120.000 376.560
441 H NR6* CB 1 120.000 376.560
442 H NR6* CHE 1 120.000 376.560
443 CS1 NR6* CR61 1 120.000 418.400
444 CS1 NR6* CB 1 120.000 418.400
445 CS1 NR6* CHE 1 120.000 418.400
446 CS1 NR6* H 1 120.000 376.560
447 CS2 NR6* CB 1 120.000 418.400
448 CS2 NR6* CHE 1 120.000 418.400
449 CS2 NR6* H 1 120.000 376.560
450 CB CS2 CR61 1 120.000 418.400
451 CHE CS2 CR61 1 120.000 418.400
452 CS1 CS2 OA 1 109.500 284.512
453 CS1 CS2 OS 1 109.500 284.512
454 CS1 CS2 CS1 1 109.500 251.040
455 NR6* CS2 CB 1 120.000 418.400
456 NR6* CS2 CHE 1 120.000 418.400
457 NR6* CS2 CS1 1 120.000 418.400
458 CH1 SI CH1 1 109.500 397.480
459 OS SI CH1 1 109.500 397.480
460 OS SI OS 1 109.500 397.480
461 F C F 1 107.600 460.240
462 CH2 C F 1 111.400 460.240
463 C CH2 OA 1 110.900 460.240
464 CS1 OS CH2 1 112.900 397.480
465 OS CH2 CH2 1 107.900 460.240
466 CR6 CR6 HCR 1 120.000 376.560
467 CR5 CR6 HCR 1 120.000 376.560
468 CB CR6 HCR 1 120.000 376.560
469 CB CR5 HCR 1 120.000 376.560
470 CHE CR6 HCR 1 120.000 376.560
471 CHE CR5 HCR 1 120.000 376.560
472 NR5* CR5 HCR 1 120.000 376.560
473 NR5* CR6 HCR 1 120.000 376.560
474 CB CR51 CR51 1 108.000 418.400
475 CHE CR51 CR51 1 108.000 418.400
476 H N H 1 109.500 334.720
477 C CH1 OA 1 109.500 460.240
478 NL CH1 CH3 1 109.500 460.240
479 CH2 S S 1 104.000 460.240
480 NR5* CB CR61 1 132.000 418.400
481 CH1 CB NR5 1 126.000 418.400
482 ; CB NR5 CR51 1 125.000 251.040
483 CB C NR6* 1 120.000 418.400
484 NR5* CHE CR61 1 132.000 418.400
485 CH1 CHE NR5 1 126.000 418.400
486 ; CHE NR5 CR51 1 125.000 251.040
487 CHE C NR6* 1 120.000 418.400
488 O C NR6* 1 120.000 418.400
489 C NR6* H 1 120.000 376.560
490 CB CB C 1 120.000 418.400
491 NR6 CB C 1 120.000 418.400
492 CHE CB C 1 120.000 418.400
493 CB CHE C 1 120.000 418.400
494 CHE CHE C 1 120.000 418.400
495 NR6 CHE C 1 120.000 418.400
496 C NR6* C 1 120.000 418.400
497 NR6 CB NR6* 1 120.000 418.400
498 NR6 CB O 1 120.000 418.400
499 NR6 CHE NR6* 1 120.000 418.400
500 NR6 CHE O 1 120.000 418.400
501 CH2 NT CH1 1 116.000 502.080
502 CR5 CB CH2 1 126.000 418.400
503 CR5 CHE CH2 1 126.000 418.400
504 CB CB CR5 1 108.000 418.400
505 CHE CB CR5 1 108.000 418.400
506 CB CHE CR5 1 108.000 418.400
507 CHE CHE CR5 1 108.000 418.400
508 CB CR5 NR5* 1 108.000 418.400
509 CHE CR5 NR5* 1 108.000 418.400
510 CB CB CR6 1 120.000 418.400
511 CB CHE CR6 1 120.000 418.400
512 CHE CB CR6 1 120.000 418.400
513 CHE CHE CR6 1 120.000 418.400
514 H NR5* CR5 1 126.000 376.560
515 CB NR5* CR5 1 108.000 418.400
516 CHE NR5* CR5 1 108.000 418.400
517 CR6 CB NR5* 1 132.000 418.400
518 CR6 CHE NR5* 1 132.000 418.400
519 CB CR6 CH2 1 126.000 418.400
520 CHE CR6 CH2 1 126.000 418.400
521 CB CR6 CR6 1 120.000 418.400
522 CHE CR6 CR6 1 120.000 418.400
523 CB CR6 CB 1 120.000 418.400
524 CB CR6 CHE 1 120.000 418.400
525 CHE CR6 CB 1 120.000 418.400
526 CHE CR6 CHE 1 120.000 418.400
527 NR6 CR6 CB 1 120.000 418.400
528 CR6 CR6 CR6 1 120.000 418.400
529 CR6 CB CH2 1 120.000 418.400
530 CR6 CHE CH2 1 120.000 418.400
531 CR6 CB CR6 1 120.000 418.400
532 CR6 CHE CR6 1 120.000 418.400
533 CB CR6 CH2 1 126.000 418.400
534 CHE CR6 CH2 1 126.000 418.400
535 CB CR6 CR6 1 120.000 418.400
536 CHE CR6 CR6 1 120.000 418.400
537 CB CR6 CB 1 120.000 418.400
538 CB CR6 CHE 1 120.000 418.400
539 CHE CR6 CB 1 120.000 418.400
540 CHE CR6 CHE 1 120.000 418.400
541 NR6 CR6 CB 1 120.000 418.400
542 NR6 CR6 CHE 1 120.000 418.400
543 NR6 CR6 NR6 1 120.000 418.400
544 NR6* CR6 CR6 1 120.000 418.400
545 NR6* CR6 CB 1 120.000 418.400
546 NR6* CR6 CHE 1 120.000 418.400
547 CS2 CR6 CR6 1 120.000 418.400
548 CR6 CB OA 1 120.000 418.400
549 CR6 CB NT 1 120.000 418.400
550 CR6 CB NR5* 1 132.000 418.400
551 CR6 CB NP 1 126.000 418.400
552 CR6 CB C 1 120.000 418.400
553 CR6 CB CH2 1 120.000 418.400
554 CR6 CB CH3 1 120.000 418.400
555 CR6 CB CR6 1 120.000 418.400
556 CR6 CHE OA 1 120.000 418.400
557 CR6 CHE NT 1 120.000 418.400
558 CR6 CHE NR5* 1 132.000 418.400
559 CR6 CHE NP 1 126.000 418.400
560 CR6 CHE C 1 120.000 418.400
561 CR6 CHE CH2 1 120.000 418.400
562 CR6 CHE CH3 1 120.000 418.400
563 CR6 CHE CR6 1 120.000 418.400
564 CP2 CP2 CP2 1 111.000 460.240
565 CP2 CP2 CP3 1 111.000 460.240
566 C CP2 CP2 1 111.000 460.240
567 O C CP2 1 121.000 502.080
568 OA C CP2 1 115.000 502.080
569 OS C CP2 1 121.000 502.080
570 CH1 CH2 OS 1 111.000 460.240
571 CH1 OS C 1 119.000 397.480
572 CH2 CH1 OS 1 106.000 397.480
573 OS C O 1 124.000 397.480
574 CH2 OS C 1 119.000 397.480
575 NE C NE 1 120.000 502.080
576 CR61 CHE CHE 1 126.000 418.400
577 CHE CHE CHE 1 108.000 418.400
578 CHE CHE CH3 1 126.000 418.400
579 CHE CR61 CHE 1 126.000 418.400
580 OM S OM 1 109.500 520.000
582 [ dihedraltypes ]
583 ; i l func q0 cq
584 NR5* NR5 2 0.000 167.360
585 NR5* NR5* 2 0.000 167.360
586 C O 2 0.000 167.360
587 C OM 2 0.000 167.360
588 C NT 2 0.000 167.360
589 CH1 OA 2 35.264 334.720
590 CH1 CH1 2 35.264 334.720
591 CH2 N 2 0.000 167.360
592 CH2 NT 2 0.000 167.360
593 CH2 C 2 0.000 167.360
594 CH2 CH1 2 35.264 334.720
595 CH3 CH1 2 35.264 334.720
596 CR51 NR5 2 0.000 167.360
597 CR51 NR5* 2 0.000 167.360
598 CR51 CR51 2 0.000 167.360
599 CR61 CR61 2 0.000 167.360
600 CB O 2 0.000 167.360
601 CB OA 2 0.000 167.360
602 CB NT 2 0.000 167.360
603 CB NR5 2 0.000 167.360
604 CB NR5* 2 0.000 167.360
605 CB NP 2 0.000 167.360
606 CB C 2 0.000 167.360
607 CB CH2 2 0.000 167.360
608 CB CH3 2 0.000 167.360
609 CB CR51 2 0.000 167.360
610 CB CR61 2 0.000 167.360
611 CB CB 2 0.000 167.360
612 CHE O 2 0.000 167.360
613 CHE OA 2 0.000 167.360
614 CHE NT 2 0.000 167.360
615 CHE NR5 2 0.000 167.360
616 CHE NR5* 2 0.000 167.360
617 CHE NP 2 0.000 167.360
618 CHE C 2 0.000 167.360
619 CHE CH2 2 0.000 167.360
620 CHE CH3 2 0.000 167.360
621 CHE CR51 2 0.000 167.360
622 CHE CR61 2 0.000 167.360
623 CHE CB 2 0.000 167.360
624 CHE CHE 2 0.000 167.360
625 H N 2 0.000 167.360
626 H NT 2 0.000 167.360
627 H NL 2 35.264 334.720
628 H NR5* 2 0.000 167.360
629 FE NP 2 0.000 167.360
630 NZ C 2 0.000 167.360
631 NE C 2 0.000 167.360
632 NE H 2 0.000 167.360
633 CS1 NR5* 2 0.000 167.360
634 CS1 CH2 2 35.264 334.720
635 CS1 CB 2 0.000 167.360
636 CS1 CHE 2 0.000 167.360
637 CS1 CS1 2 35.264 334.720
638 NR6 CR61 2 0.000 167.360
639 NR6 CB 2 0.000 167.360
640 NR6 CHE 2 0.000 167.360
641 NR6 NR6 2 0.000 167.360
642 NR6* CH2 2 0.000 167.360
643 NR6* CH3 2 0.000 167.360
644 NR6* CR61 2 0.000 167.360
645 NR6* CB 2 0.000 167.360
646 NR6* CHE 2 0.000 167.360
647 NR6* H 2 0.000 167.360
648 NR6* CS1 2 0.000 167.360
649 NR6* NR6 2 0.000 167.360
650 NR6* NR6* 2 0.000 167.360
651 CS2 CB 2 0.000 167.360
652 CS2 CHE 2 0.000 167.360
653 CS2 CS1 2 35.264 334.720
654 CS2 NR6* 2 0.000 167.360
655 SI CH1 2 35.264 334.720
656 C CH1 2 0.000 167.360
657 NR6 C 2 0.000 167.360
658 C C 2 0.000 167.360
659 C NR6* 2 0.000 167.360
660 NR6 CH2 2 0.000 167.360
661 CR5 HCR 2 0.000 167.360
662 CR6 HCR 2 0.000 167.360
663 CR5 CR5 2 0.000 167.360
664 CB CR5 2 0.000 167.360
665 CHE CR5 2 0.000 167.360
666 NR6 CR5 2 0.000 167.360
667 NR6* CR5 2 0.000 167.360
668 CR5 NR5 2 0.000 167.360
669 CR5 NR5* 2 0.000 167.360
670 CR5 CR5 2 0.000 167.360
671 CB CR5 2 0.000 167.360
672 CB CR6 2 0.000 167.360
673 CHE CR5 2 0.000 167.360
674 CHE CR6 2 0.000 167.360
675 CR6 CR6 2 0.000 167.360
676 OS C 2 0.000 167.360
677 C O 2 0.000 167.360
678 CH1 OS 2 35.264 334.720
679 CH1 OA 2 35.264 334.720
681 [ dihedraltypes ]
682 ; j k func phi0 cp mult
683 C OA 1 180.000 16.736 2
684 C N 1 180.000 33.472 2
685 C NT 1 180.000 33.472 2
686 C NL 1 0.000 3.766 3
687 CH1 OA 1 0.000 1.255 3
688 CH1 N 1 180.000 0.418 6
689 CH1 NT 1 0.000 3.766 6
690 CH1 NL 1 0.000 3.766 3
691 CH1 C 1 0.000 0.418 6
692 CH1 CH1 1 0.000 5.858 3
693 CH2 OA 1 0.000 1.255 3
694 CH2 N 1 180.000 0.418 6
695 CH2 NT 1 0.000 3.766 6
696 CH2 NL 1 0.000 3.766 3
697 CH2 C 1 0.000 0.418 6
698 CH2 CH1 1 0.000 5.858 3
699 CH2 CH2 1 0.000 5.858 3
700 CB OA 1 180.000 7.113 2
701 CB NT 1 180.000 33.472 2
702 CB C 1 180.000 5.858 2
703 CB CH2 1 0.000 0.418 6
704 CB CR61 1 180.000 41.840 2
705 CHE OA 1 180.000 7.113 2
706 CHE NT 1 180.000 33.472 2
707 CHE C 1 180.000 5.858 2
708 CHE CH2 1 0.000 0.418 6
709 CHE CR61 1 180.000 41.840 2
710 S CH2 1 0.000 2.929 3
711 S S 1 0.000 16.736 2
712 FE NR5 1 0.000 0.000 4
713 NZ C 1 180.000 33.472 2
714 NE C 1 180.000 33.472 2
715 NE CH2 1 180.000 0.418 6
716 ; two or three dihedral potentials are needed over some bonds,
717 ; put the parameters in your topology manually
718 ; P OA 1 0.000 1.046 3
719 ; P OA 1 0.000 3.138 2
720 OS CH2 1 0.000 3.766 3
721 ; OS P 1 0.000 1.046 3
722 ; OS P 1 0.000 3.138 2
723 CS1 OA 1 0.000 1.255 3
724 CS1 NR5* 1 0.000 0.000 2
725 CS1 CH2 1 0.000 5.858 3
726 CS1 OS 1 0.000 3.766 3
727 ; CS1 CS1 1 0.000 5.858 3
728 ; CS1 CS1 1 0.000 0.418 2
729 ; CS1 CS1 1 0.000 2.092 2
730 NR6 CB 1 180.000 33.472 2
731 NR6 CHE 1 180.000 33.472 2
732 NR6* CH2 1 0.000 0.418 6
733 NR6* CB 1 180.000 33.472 2
734 NR6* CHE 1 180.000 33.472 2
735 NR6* CS1 1 0.000 0.000 2
736 CS2 OA 1 0.000 1.255 3
737 CS2 OS 1 0.000 3.766 3
738 ; CS2 CS1 1 0.000 5.858 3
739 ; CS2 CS1 1 0.000 0.418 2
740 ; CS2 CS1 1 0.000 2.092 2
741 SI CH1 1 0.000 5.858 3
742 SI OS 1 0.000 3.766 3
743 C CP2 1 0.000 0.418 6
744 CH1 OS 1 0.000 3.766 3
745 C OS 1 0.000 3.766 3
746 CP2 CP2 1 0.000 0.418 6
748 [ dihedraltypes ]
749 CP2 CP2 3 9.2789 12.156 -13.120 -3.0597 26.240 -31.495
750 CH2 CH2 3 9.2789 12.156 -13.120 -3.0597 26.240 -31.495
752 #define ANG_180_0 180 0
753 #define DIH_0_0_2 0 0 2