man/man1/xrama.1

   1 .TH xrama 1 "Thu 16 Oct 2008"
   2 .SH NAME
   3 xrama - shows animated Ramachandran plots
   4
   5 .B VERSION 4.0
   6 .SH SYNOPSIS
   7 \f3xrama\fP
   8 .BI "-f" " traj.xtc "
   9 .BI "-s" " topol.tpr "
  10 .BI "-[no]h" ""
  11 .BI "-nice" " int "
  12 .BI "-b" " time "
  13 .BI "-e" " time "
  14 .BI "-dt" " time "
  15 .SH DESCRIPTION
  16 xrama shows a Ramachandran movie, that is, it shows
  17 the Phi/Psi angles as a function of time in an X-Window.
  18
  19 Static Phi/Psi plots for printing can be made with g_rama.
  20
  21
  22 Some of the more common X command line options can be used:
  23
  24 -bg, -fg change colors, -font fontname, changes the font.
  25 .SH FILES
  26 .BI "-f" " traj.xtc"
  27 .B Input
  28  Trajectory: xtc trr trj gro g96 pdb cpt
  29
  30 .BI "-s" " topol.tpr"
  31 .B Input
  32  Run input file: tpr tpb tpa
  33
  34 .SH OTHER OPTIONS
  35 .BI "-[no]h"  "no    "
  36  Print help info and quit
  37
  38 .BI "-nice"  " int" " 0"
  39  Set the nicelevel
  40
  41 .BI "-b"  " time" " 0     "
  42  First frame (ps) to read from trajectory
  43
  44 .BI "-e"  " time" " 0     "
  45  Last frame (ps) to read from trajectory
  46
  47 .BI "-dt"  " time" " 0     "
  48  Only use frame when t MOD dt = first time (ps)
  49