share/hoomd/examples/pair_table_file

   1 hoomd_script::pair::table
   2 # Due to deficiencies in doxygen, the commands used in this example are listed explicitly here
   3 # run this script with "python -x filename" to skip the first line, or remove this header
   4
   5 # ---- pair_table_file.py ----
   6 from hoomd_script import *
   7
   8 # create 1000 random particles of name A
   9 init.create_random(N=1000, phi_p=0.01, name='A')
  10
  11 # read the pair interaction from a specified table
  12 table = pair.table(width=171);
  13 table.set_from_file('A', 'A', filename='pair_table_file.dat')
  14
  15 # integrate at constant temperature
  16 all = group.all()
  17 integrate.mode_standard(dt=0.005)
  18 integrate.nvt(group=all, T=1.2, tau=0.5)
  19
  20 # run 10,000 time steps
  21 run(10e3)