bench/log.6Oct16.chain.scaled.icc.4

   1 LAMMPS (6 Oct 2016)
   2 # FENE beadspring benchmark
   3
   4 variable        x index 1
   5 variable        y index 1
   6 variable        z index 1
   7
   8 units           lj
   9 atom_style      bond
  10 atom_modify     map hash
  11 special_bonds   fene
  12
  13 read_data       data.chain
  14   orthogonal box = (-16.796 -16.796 -16.796) to (16.796 16.796 16.796)
  15   1 by 2 by 2 MPI processor grid
  16   reading atoms ...
  17   32000 atoms
  18   reading velocities ...
  19   32000 velocities
  20   scanning bonds ...
  21   1 = max bonds/atom
  22   reading bonds ...
  23   31680 bonds
  24   2 = max # of 1-2 neighbors
  25   2 = max # of special neighbors
  26
  27 replicate       $x $y $z
  28 replicate       2 $y $z
  29 replicate       2 2 $z
  30 replicate       2 2 1
  31   orthogonal box = (-16.796 -16.796 -16.796) to (50.388 50.388 16.796)
  32   2 by 2 by 1 MPI processor grid
  33   128000 atoms
  34   126720 bonds
  35   2 = max # of 1-2 neighbors
  36   2 = max # of special neighbors
  37
  38 neighbor        0.4 bin
  39 neigh_modify    every 1 delay 1
  40
  41 bond_style      fene
  42 bond_coeff      1 30.0 1.5 1.0 1.0
  43
  44 pair_style      lj/cut 1.12
  45 pair_modify     shift yes
  46 pair_coeff      1 1 1.0 1.0 1.12
  47
  48 fix             1 all nve
  49 fix             2 all langevin 1.0 1.0 10.0 904297
  50
  51 thermo          100
  52 timestep        0.012
  53
  54 run             100
  55 Neighbor list info ...
  56   1 neighbor list requests
  57   update every 1 steps, delay 1 steps, check yes
  58   max neighbors/atom: 2000, page size: 100000
  59   master list distance cutoff = 1.52
  60   ghost atom cutoff = 1.52
  61   binsize = 0.76 -> bins = 89 89 45
  62 Memory usage per processor = 13.2993 Mbytes
  63 Step Temp E_pair E_mol TotEng Press
  64        0   0.97027498   0.44484087    20.494523    22.394765    4.6721833
  65      100   0.97682955   0.44239968    20.500229    22.407862    4.6527025
  66 Loop time of 1.14845 on 4 procs for 100 steps with 128000 atoms
  67
  68 Performance: 90277.919 tau/day, 87.074 timesteps/s
  69 99.9% CPU use with 4 MPI tasks x no OpenMP threads
  70
  71 MPI task timing breakdown:
  72 Section |  min time  |  avg time  |  max time  |%varavg| %total
  73 ---------------------------------------------------------------
  74 Pair    | 0.2203     | 0.22207    | 0.22386    |   0.3 | 19.34
  75 Bond    | 0.094861   | 0.095302   | 0.095988   |   0.1 |  8.30
  76 Neigh   | 0.52127    | 0.5216     | 0.52189    |   0.0 | 45.42
  77 Comm    | 0.079585   | 0.082159   | 0.084366   |   0.7 |  7.15
  78 Output  | 0.00013304 | 0.00015306 | 0.00018501 |   0.2 |  0.01
  79 Modify  | 0.18351    | 0.18419    | 0.1856     |   0.2 | 16.04
  80 Other   |            | 0.04298    |            |       |  3.74
  81
  82 Nlocal:    32000 ave 32015 max 31983 min
  83 Histogram: 1 0 1 0 0 0 0 0 1 1
  84 Nghost:    9492 ave 9522 max 9432 min
  85 Histogram: 1 0 0 0 0 0 1 0 0 2
  86 Neighs:    155837 ave 156079 max 155506 min
  87 Histogram: 1 0 0 0 0 1 0 0 1 1
  88
  89 Total # of neighbors = 623349
  90 Ave neighs/atom = 4.86991
  91 Ave special neighs/atom = 1.98
  92 Neighbor list builds = 25
  93 Dangerous builds = 0
  94 Total wall time: 0:00:01