doc/src/compute_dpd_atom.txt

   1 "LAMMPS WWW Site"_lws - "LAMMPS Documentation"_ld - "LAMMPS Commands"_lc :c
   2
   3 :link(lws,http://lammps.sandia.gov)
   4 :link(ld,Manual.html)
   5 :link(lc,Section_commands.html#comm)
   6
   7 :line
   8
   9 compute dpd/atom command :h3
  10
  11 [Syntax:]
  12
  13 compute ID group-ID dpd/atom :pre
  14
  15 ID, group-ID are documented in "compute"_compute.html command
  16 dpd/atom = style name of this compute command :ul
  17
  18 [Examples:]
  19
  20 compute 1 all dpd/atom
  21
  22 [Description:]
  23
  24 Define a computation that accesses the per-particle internal
  25 conductive energy (u_cond), internal mechanical energy (u_mech),
  26 internal chemical energy (u_chem) and
  27 internal temperatures (dpdTheta) for each particle in a group.  See
  28 the "compute dpd"_compute_dpd.html command if you want the total
  29 internal conductive energy, the total internal mechanical energy, the
  30 total chemical energy and
  31 average internal temperature of the entire system or group of dpd
  32 particles.
  33
  34 [Output info:]
  35
  36 This compute calculates a per-particle array with 4 columns (u_cond,
  37 u_mech, u_chem, dpdTheta), which can be accessed by indices 1-4 by any command
  38 that uses per-particle values from a compute as input.  See
  39 "Section 6.15"_Section_howto.html#howto_15 for an overview of
  40 LAMMPS output options.
  41
  42 The per-particle array values will be in energy (u_cond, u_mech, u_chem)
  43 and temperature (dpdTheta) "units"_units.html.
  44
  45 [Restrictions:]
  46
  47 This command is part of the USER-DPD package.  It is only enabled if
  48 LAMMPS was built with that package.  See the "Making
  49 LAMMPS"_Section_start.html#start_3 section for more info.
  50
  51 This command also requires use of the "atom_style dpd"_atom_style.html
  52 command.
  53
  54 [Related commands:]
  55
  56 "dump custom"_dump.html, "compute dpd"_compute_dpd.html
  57
  58 [Default:] none
  59
  60 :line
  61
  62 :link(Larentzos)
  63 [(Larentzos)] J.P. Larentzos, J.K. Brennan, J.D. Moore, and
  64 W.D. Mattson, "LAMMPS Implementation of Constant Energy Dissipative
  65 Particle Dynamics (DPD-E)", ARL-TR-6863, U.S. Army Research
  66 Laboratory, Aberdeen Proving Ground, MD (2014).