doc/src/compute_temp_deform_eff.txt

   1 "LAMMPS WWW Site"_lws - "LAMMPS Documentation"_ld - "LAMMPS Commands"_lc :c
   2
   3 :link(lws,http://lammps.sandia.gov)
   4 :link(ld,Manual.html)
   5 :link(lc,Section_commands.html#comm)
   6
   7 :line
   8
   9 compute temp/deform/eff command :h3
  10
  11 [Syntax:]
  12
  13 compute ID group-ID temp/deform/eff :pre
  14
  15 ID, group-ID are documented in "compute"_compute.html command
  16 temp/deform/eff = style name of this compute command :ul
  17
  18 [Examples:]
  19
  20 compute myTemp all temp/deform/eff :pre
  21
  22 [Description:]
  23
  24 Define a computation that calculates the temperature of a group of
  25 nuclei and electrons in the "electron force field"_pair_eff.html
  26 model, after subtracting out a streaming velocity induced by the
  27 simulation box changing size and/or shape, for example in a
  28 non-equilibrium MD (NEMD) simulation.  The size/shape change is
  29 induced by use of the "fix deform"_fix_deform.html command.  A
  30 compute of this style is created by the "fix
  31 nvt/sllod/eff"_fix_nvt_sllod_eff.html command to compute the thermal
  32 temperature of atoms for thermostatting purposes.  A compute of this
  33 style can also be used by any command that computes a temperature,
  34 e.g. "thermo_modify"_thermo_modify.html, "fix npt/eff"_fix_nh_eff.html,
  35 etc.
  36
  37 The calculation performed by this compute is exactly like that
  38 described by the "compute temp/deform"_compute_temp_deform.html
  39 command, except that the formula for the temperature includes the
  40 radial electron velocity contributions, as discussed by the "compute
  41 temp/eff"_compute_temp_eff.html command.  Note that only the
  42 translational degrees of freedom for each nuclei or electron are
  43 affected by the streaming velocity adjustment.  The radial velocity
  44 component of the electrons is not affected.
  45
  46 [Output info:]
  47
  48 This compute calculates a global scalar (the temperature) and a global
  49 vector of length 6 (KE tensor), which can be accessed by indices 1-6.
  50 These values can be used by any command that uses global scalar or
  51 vector values from a compute as input.  See "this
  52 section"_Section_howto.html#howto_15 for an overview of LAMMPS output
  53 options.
  54
  55 The scalar value calculated by this compute is "intensive".  The
  56 vector values are "extensive".
  57
  58 The scalar value will be in temperature "units"_units.html.  The
  59 vector values will be in energy "units"_units.html.
  60
  61 [Restrictions:]
  62
  63 This compute is part of the USER-EFF package.  It is only enabled if
  64 LAMMPS was built with that package.  See the "Making
  65 LAMMPS"_Section_start.html#start_3 section for more info.
  66
  67 [Related commands:]
  68
  69 "compute temp/ramp"_compute_temp_ramp.html, "fix deform"_fix_deform.html,
  70 "fix nvt/sllod/eff"_fix_nvt_sllod_eff.html
  71
  72 [Default:] none