doc/src/fix_nvk.txt

   1 "LAMMPS WWW Site"_lws - "LAMMPS Documentation"_ld - "LAMMPS Commands"_lc :c
   2
   3 :link(lws,http://lammps.sandia.gov)
   4 :link(ld,Manual.html)
   5 :link(lc,Section_commands.html#comm)
   6
   7 :line
   8
   9 fix nvk command :h3
  10
  11 [Syntax:]
  12
  13 fix ID group-ID nvk :pre
  14
  15 ID, group-ID are documented in "fix"_fix.html command
  16 nvk = style name of this fix command :ul
  17
  18 [Examples:]
  19
  20 fix 1 all nvk :pre
  21
  22 [Description:]
  23
  24 Perform constant kinetic energy integration using the Gaussian
  25 thermostat to update position and velocity for atoms in the group each
  26 timestep.  V is volume; K is kinetic energy. This creates a system
  27 trajectory consistent with the isokinetic ensemble.
  28
  29 The equations of motion used are those of Minary et al in
  30 "(Minary)"_#nvk-Minary, a variant of those initially given by Zhang in
  31 "(Zhang)"_#nvk-Zhang.
  32
  33 The kinetic energy will be held constant at its value given when fix
  34 nvk is initiated. If a different kinetic energy is desired, the
  35 "velocity"_velocity.html command should be used to change the kinetic
  36 energy prior to this fix.
  37
  38 :line
  39
  40 [Restart, fix_modify, output, run start/stop, minimize info:]
  41
  42 No information about this fix is written to "binary restart
  43 files"_restart.html.  None of the "fix_modify"_fix_modify.html options
  44 are relevant to this fix.  No global or per-atom quantities are stored
  45 by this fix for access by various "output
  46 commands"_Section_howto.html#howto_15.  No parameter of this fix can
  47 be used with the {start/stop} keywords of the "run"_run.html command.
  48 This fix is not invoked during "energy minimization"_minimize.html.
  49
  50 [Restrictions:]
  51
  52 The Gaussian thermostat only works when it is applied to all atoms in
  53 the simulation box. Therefore, the group must be set to all.
  54
  55 This fix has not yet been implemented to work with the RESPA integrator.
  56
  57 This fix is part of the USER-MISC package.  It is only enabled if LAMMPS
  58 was built with that package.  See the "Making
  59 LAMMPS"_Section_start.html#start_3 section for more info.
  60
  61 [Related commands:] none
  62
  63 [Default:] none
  64
  65 :line
  66
  67 :link(nvk-Minary)
  68 [(Minary)] Minary, Martyna, and Tuckerman, J Chem Phys, 18, 2510 (2003).
  69
  70 :link(nvk-Zhang)
  71 [(Zhang)] Zhang, J Chem Phys, 106, 6102 (1997).