examples/streitz/log.5Oct16.streitz.ewald.g++.4

   1 LAMMPS (5 Oct 2016)
   2 # Streitz-Mintmire potential with alpha-alumina
   3 # option to use with Ewald or Wolf sum
   4 # EAM (AlO.eam.alloy) includes 1994 SM and 2004 Zhou versions
   5 # Streitz Mintmire (coul/streitz) does not include 2004 Zhou modifications
   6 # Contributing authors: Ray Shan, Chris Weinberger (Sandia)
   7
   8 units           metal
   9 atom_style      charge
  10 dimension       3
  11 boundary        p p p
  12
  13 read_data       data.streitz
  14   orthogonal box = (0 0 0) to (24.7337 28.56 25.9798)
  15   1 by 2 by 2 MPI processor grid
  16   reading atoms ...
  17   2160 atoms
  18
  19 group           type1 type 1
  20 864 atoms in group type1
  21 compute         charge1 type1 property/atom q
  22 compute         q1 type1 reduce ave c_charge1
  23 group           type2 type 2
  24 1296 atoms in group type2
  25 compute         charge2 type2 property/atom q
  26 compute         q2 type2 reduce ave c_charge2
  27
  28 variable        qcat equal 2.8
  29 variable        qani equal -${qcat}*count(type1)/count(type2)
  30 variable        qani equal -2.8*count(type1)/count(type2)
  31 set             group type1 charge ${qcat}
  32 set             group type1 charge 2.8
  33   864 settings made for charge
  34 set             group type2 charge ${qani}
  35 set             group type2 charge -1.86666666666667
  36   1296 settings made for charge
  37 variable        qsum equal count(type1)*c_q1+count(type2)*c_q2
  38
  39 # Ewald sum for coul/streitz
  40 pair_style      hybrid/overlay coul/streitz 12.0 ewald eam/alloy
  41 kspace_style    ewald 1e-6
  42
  43 # Wolf sum for coul/streitz
  44 #pair_style     hybrid/overlay coul/streitz 12.0 wolf 0.31 eam/alloy
  45
  46 pair_coeff      * * coul/streitz AlO.streitz Al O
  47 pair_coeff      * * eam/alloy AlO.eam.alloy Al O
  48 Reading potential file AlO.eam.alloy with DATE: 2015-02-19
  49
  50 neighbor        1.0 bin
  51 neigh_modify    every 10 delay 0 check yes
  52 timestep        0.0004
  53
  54 thermo_style    custom step temp etotal pe evdwl ecoul elong                 c_q1 c_q2 v_qsum press spcpu
  55 thermo_modify   norm yes
  56 thermo          10
  57
  58 velocity        all create 300.0 42128
  59 fix             1 all qeq/slater 1 12.0 1.0e-6 100 coul/streitz
  60 fix             2 all nve
  61
  62 run             100
  63 Ewald initialization ...
  64 WARNING: Using 12-bit tables for long-range coulomb (../kspace.cpp:316)
  65   G vector (1/distance) = 0.310132
  66   estimated absolute RMS force accuracy = 1.9688e-05
  67   estimated relative force accuracy = 1.36725e-06
  68   KSpace vectors: actual max1d max3d = 2541 11 6083
  69                   kxmax kymax kzmax  = 10 11 10
  70 Neighbor list info ...
  71   3 neighbor list requests
  72   update every 10 steps, delay 0 steps, check yes
  73   max neighbors/atom: 2000, page size: 100000
  74   master list distance cutoff = 13
  75   ghost atom cutoff = 13
  76   binsize = 6.5 -> bins = 4 5 4
  77 Memory usage per processor = 32.3255 Mbytes
  78 Step Temp TotEng PotEng E_vdwl E_coul E_long c_q1 c_q2 v_qsum Press S/CPU
  79        0          300   -6.3402658   -6.3790259   -2.7952901    10.218189   -13.801925    2.8665317   -1.9110211 4.5474735e-13     -26072.6            0
  80       10    272.45429    -6.340306   -6.3755071    -2.790294    10.191122   -13.776335    2.8636996   -1.9091331 4.5474735e-13   -21774.214    3.7998441
  81       20    219.94295   -6.3402438   -6.3686605   -2.7790335    10.192018   -13.781645    2.8638746   -1.9092497 -4.5474735e-13   -16694.015    4.0421334
  82       30    179.36109   -6.3401905    -6.363364   -2.7689124    10.190566   -13.785018    2.8639192   -1.9092795 9.094947e-13   -12974.238    4.1358956
  83       40    162.68485    -6.340179   -6.3611979   -2.7652026    10.173296   -13.769291    2.8621763   -1.9081175 -4.5474735e-13   -12735.472    4.1616104
  84       50    152.76249   -6.3401898   -6.3599268   -2.7673924    10.132267   -13.724801    2.8575297   -1.9050198 4.5474735e-13   -14532.583     4.052378
  85       60    138.38062    -6.340206   -6.3580848   -2.7714511    10.085334   -13.671968     2.851958   -1.9013053 4.5474735e-13   -15656.298    4.1601628
  86       70     134.9572   -6.3401907   -6.3576272   -2.7740776    10.063527   -13.647077    2.8492769   -1.8995179 -1.3642421e-12   -14160.655    4.1215986
  87       80    161.55082   -6.3401305   -6.3610029   -2.7741365    10.086553   -13.673419    2.8520585   -1.9013723            0   -9666.5793    4.1226863
  88       90     207.3301   -6.3400321   -6.3668192   -2.7713864    10.144722   -13.740155    2.8591985   -1.9061323            0   -2530.8682    4.1248222
  89      100    233.80619   -6.3399378   -6.3701456   -2.7659477    10.207141   -13.811339    2.8668082   -1.9112055 -4.5474735e-13    6120.8881    4.1438288
  90 Loop time of 24.4873 on 4 procs for 100 steps with 2160 atoms
  91
  92 Performance: 0.141 ns/day, 170.051 hours/ns, 4.084 timesteps/s
  93 99.8% CPU use with 4 MPI tasks x no OpenMP threads
  94
  95 MPI task timing breakdown:
  96 Section |  min time  |  avg time  |  max time  |%varavg| %total
  97 ---------------------------------------------------------------
  98 Pair    | 10.566     | 10.569     | 10.572     |   0.1 | 43.16
  99 Kspace  | 1.2451     | 1.2531     | 1.2593     |   0.5 |  5.12
 100 Neigh   | 0          | 0          | 0          |   0.0 |  0.00
 101 Comm    | 0.032611   | 0.037556   | 0.042452   |   1.8 |  0.15
 102 Output  | 0.00079513 | 0.00084209 | 0.00089383 |   0.1 |  0.00
 103 Modify  | 12.626     | 12.626     | 12.626     |   0.0 | 51.56
 104 Other   |            | 0.001517   |            |       |  0.01
 105
 106 Nlocal:    540 ave 540 max 540 min
 107 Histogram: 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0
 108 Nghost:    8994 ave 8994 max 8994 min
 109 Histogram: 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0
 110 Neighs:    294732 ave 294732 max 294732 min
 111 Histogram: 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0
 112 FullNghs:  589464 ave 589464 max 589464 min
 113 Histogram: 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0
 114
 115 Total # of neighbors = 2357856
 116 Ave neighs/atom = 1091.6
 117 Neighbor list builds = 0
 118 Dangerous builds = 0
 119 Total wall time: 0:00:24