tools/i-pi/ipi/utils/README

   1  -- Utility functions directory --
   2
   3  * This is the directory containing functions that are used in the other
   4    modules in the code.
   5
   6  * Files:
   7    - depend.py: Deals with the dependency detection, value caching and
   8       automatic updating of variables.
   9    - inputvalue.py: Contains the base classes used in reading the xml
  10       input file, and creating the restart file.
  11    - mathtools.py: Contains the algorithms used in various parts of the code.
  12    - messages.py: Contains the classes to generate info and warning messages
  13       to standard output during the simulation.
  14    - nmtransform.py: Contains the algorithms that deal with the normal mode
  15       and ring polymer contraction transformations.
  16    - prng.py: Deals with random number generation.
  17    - softexit: Contains the classes to deal with calls for a soft exit.
  18    - units.py: Holds atomic masses, fundamental constants, and unit conversions.
  19
  20  * Directories:
  21    - io: Holds the modules that deal with reading and outputting files.