js/CXGN/BreederSearch.js

   1 window.onload = function initialize() {
   2
   3     jQuery('#select1').change( // reset start from list if select1 changes
   4              function() {
   5                 if (jQuery('#paste_list_select').val()) {
   6             create_list_start('Start from a list');
   7                  }
   8           });
   9
  10     jQuery('#select1, #select2, #select3, #select4').change(  // retrieve new data once new category is selected
  11         function() {
  12             var this_section = jQuery(this).attr('name');
  13             reset_downstream_sections(this_section);
  14             update_select_categories(this_section);
  15             var category = jQuery(this).val();
  16
  17             if (!category) { // reset by returning empty if no category was defined
  18         var data_element = "c"+this_section+"_data";
  19         jQuery("#"+data_element).html('');
  20         return;
  21             }
  22             var categories = get_selected_categories(this_section);
  23             var data = ''
  24             if (this_section !== "1") data = get_selected_data(this_section);
  25             var error = check_missing_criteria(categories, data, this_section); // make sure criteria selected in each panel
  26             if (error) return;
  27             if (data.length >= categories.length) data.pop(); //remove extra data array if exists
  28
  29             retrieve_and_display_set(categories, data, this_section);
  30             update_download_options(this_section);
  31         });
  32
  33     jQuery('#c1_data, #c2_data, #c3_data, #c4_data').change( // update wizard panels and categories when data selections change
  34         function() {
  35             var this_section = jQuery(this).attr('name');
  36
  37             var data_id = jQuery(this).attr('id');
  38             var data = jQuery('#'+data_id).val() || [];;
  39             var count_id = "c"+this_section+"_data_count";
  40
  41       var categories = get_selected_categories(this_section);
  42             reset_downstream_sections(this_section);
  43             update_select_categories(this_section, categories);
  44             show_list_counts(count_id, jQuery('#'+data_id).text().split("\n").length-1, data.length);
  45             update_download_options(this_section, categories);
  46         });
  47
  48     jQuery('#c1_select_all, #c2_select_all, #c3_select_all, #c4_select_all').click( // select all data in a wizard panel
  49         function() {
  50             var this_section = jQuery(this).attr('name');
  51             var data_id = "c"+this_section+"_data";
  52             selectAllOptions(document.getElementById(data_id));
  53
  54             var data = jQuery("#"+data_id).val() || [];;
  55             var count_id = "c"+this_section+"_data_count";
  56
  57             show_list_counts(count_id, jQuery('#'+data_id).text().split("\n").length-1, data.length);
  58       var categories = get_selected_categories(this_section);
  59             update_select_categories(this_section, categories);
  60             update_download_options(this_section, categories);
  61         });
  62
  63       jQuery('select').dblclick(function() { // open detail page in new window or tab on double-click
  64           var this_section = jQuery(this).attr('name');
  65           var categories = get_selected_categories(this_section);
  66           var category = categories.pop();
  67           switch (category)
  68           {
  69           case "accessions":
  70     case "plants":
  71           case "plots":
  72               window.open("../../stock/"+this.value+"/view");
  73               break;
  74           case "trials":
  75               window.open("../../breeders_toolbox/trial/"+this.value);
  76               break;
  77           case "breeding_programs":
  78               window.open("../../breeders/manage_programs");
  79               break;
  80           case "locations":
  81               window.open("../../breeders/locations");
  82               break;
  83           case "traits":
  84               window.open("../../cvterm/"+this.value+"/view");
  85               break;
  86           default:
  87               if (window.console) console.log("no link for this category");
  88           }
  89       });
  90
  91     jQuery('#open_update_dialog').on('click', function () {
  92         jQuery('#update_wizard_dialog').modal("show");
  93         matviews_update_options();
  94     });
  95
  96     jQuery('#update_wizard_dialog, #upload_datacollector_phenotypes_dialog, #upload_phenotype_spreadsheet_dialog, #upload_fieldbook_phenotypes_dialog').on("click", '.wiz-update', function () {
  97         //if (window.console) console.log("refreshing materialized views . . .");
  98         refresh_matviews();
  99     });
 100
 101     jQuery('#wizard_download_phenotypes_button').click( function () {
 102         jQuery('#download_wizard_phenotypes_dialog').modal("show");
 103     });
 104
 105     jQuery('#download_wizard_phenotypes_submit_button').on('click', function (event) {
 106         event.preventDefault();
 107         var selected_trials = get_selected_results('trials');
 108         var selected_locations = get_selected_results('locations');
 109         var selected_accessions = get_selected_results('accessions');
 110         var selected_traits = get_selected_results('traits');
 111         var selected_plots = get_selected_results('plots');
 112         var selected_plants = get_selected_results('plants');
 113         var selected_years = get_selected_results('years');
 114         var format = jQuery("#download_wizard_phenotypes_format").val();
 115         var timestamp = jQuery("#download_wizard_phenotypes_timestamp_option").val();
 116         var trait_contains = jQuery("#download_wizard_phenotype_trait_contains").val();
 117         var trait_contains_array = trait_contains.split(",");
 118         var data_level = jQuery("#download_wizard_phenotypes_level_option").val();
 119         var phenotype_min_value = jQuery("#download_wizard_phenotype_phenotype_min").val();
 120         var phenotype_max_value = jQuery("#download_wizard_phenotype_phenotype_max").val();
 121         var search_type = jQuery('input[name=search_type]:checked').val();
 122         console.log("plot list="+JSON.stringify(selected_plots));
 123
 124         if (selected_trials.length !== 0 || selected_locations.length !== 0 || selected_accessions.length !== 0 || selected_traits.length !== 0 || selected_plots.length !== 0 || selected_plants.length !== 0 || selected_years.length !== 0) {
 125             window.open("/breeders/trials/phenotype/download?trial_list="+JSON.stringify(selected_trials)+"&format="+format+"&trait_list="+JSON.stringify(selected_traits)+"&accession_list="+JSON.stringify(selected_accessions)+"&plot_list="+JSON.stringify(selected_plots)+"&plant_list="+JSON.stringify(selected_plants)+"&location_list="+JSON.stringify(selected_locations)+"&year_list="+JSON.stringify(selected_years)+"&dataLevel="+data_level+"&phenotype_min_value="+phenotype_min_value+"&phenotype_max_value="+phenotype_max_value+"&timestamp="+timestamp+"&trait_contains="+JSON.stringify(trait_contains_array)+"&search_type="+search_type);
 126         } else {
 127             alert("No filters selected for download.");
 128         }
 129     });
 130
 131     jQuery('#download_button_genotypes').on('click', function (event) {
 132       event.preventDefault();
 133       var accession_ids = get_selected_results('accessions');
 134       var trial_ids = get_selected_results('trials');
 135       var protocol_id = get_selected_genotyping_protocols() ? get_selected_genotyping_protocols() : '';
 136         var ladda = Ladda.create(this);
 137         ladda.start();
 138         var token = new Date().getTime(); //use the current timestamp as the token name and value
 139         manage_dl_with_cookie(token, ladda);
 140         window.location.href = '/breeders/download_gbs_action/?ids='+accession_ids.join(",")+'&protocol_id='+protocol_id+'&token='+token+'&format=accession_ids&trial_ids='+trial_ids.join(",");
 141     });
 142 }
 143
 144 function addToggleIds () {
 145   for (i=2; i <= 4; i++) {
 146     var toggle_buttons = jQuery('#c'+i+'_querytype').next().children();
 147     toggle_buttons.first().attr( 'id', 'c'+i+'_querytype_and' );
 148     toggle_buttons.first().next().attr( 'id', 'c'+i+'_querytype_or' );
 149   }
 150 }
 151
 152 function retrieve_and_display_set(categories, data, this_section) {
 153     //if (window.console) console.log("categories = "+categories);
 154     //if (window.console) console.log("data = "+JSON.stringify(data));
 155     //if (window.console) console.log("querytypes="+get_querytypes(this_section));
 156     jQuery.ajax( {
 157         url: '/ajax/breeder/search',
 158         timeout: 60000,
 159         method: 'POST',
 160         data: {'categories': categories, 'data': data, 'querytypes': get_querytypes(this_section)},
 161             beforeSend: function(){
 162                 disable_ui();
 163             },
 164             complete : function(){
 165                 enable_ui();
 166             },
 167             success: function(response) {
 168                 if (response.error) {
 169                     var error_html = '<div class="well well-sm" id="response_error"><font color="red">'+response.error+'</font></div>';
 170                     var selectall_id = "c"+this_section+"_select_all";
 171                     jQuery('#'+selectall_id).before(error_html);
 172                 }
 173                 else {
 174         if (response.message) {
 175           var message_html = '<div class="well well-sm" id="response_error"><center><font color="orange">'+response.message+'</font></center></div>';
 176                     var selectall_id = "c"+this_section+"_select_all";
 177                     jQuery('#'+selectall_id).before(message_html);
 178         }
 179         var list = response.list || [];
 180                     data_html = format_options_list(list);
 181                     var data_id = "c"+this_section+"_data";
 182                     var count_id = "c"+this_section+"_data_count";
 183                     var listmenu_id = "c"+this_section+"_to_list_menu";
 184                     var select_id = "select"+this_section;
 185
 186                     jQuery('#'+data_id).html(data_html);
 187                     show_list_counts(count_id, list.length);
 188
 189                     if (jQuery('#navbar_lists').length) {
 190           addToListMenu(listmenu_id, data_id, {
 191             selectText: true,
 192             typeSourceDiv: select_id });
 193         }
 194       }
 195     },
 196           error: function(request, status, err) {
 197                 if (status == "timeout") {
 198                     // report timeout
 199                     var error_html = '<div class="well well-sm" id="response_error"><font color="red">Timeout error. Request could not be completed within 60 second time limit.</font></div>';
 200                     var selectall_id = "c"+this_section+"_select_all";
 201                     jQuery('#'+selectall_id).before(error_html);
 202                 } else {
 203                     // report unspecified error occured
 204                     var error_html = '<div class="well well-sm" id="response_error"><font color="red">Error. If this problem persists, please <a href="../../contact/form">contact developers</a></font></div>';
 205                     var selectall_id = "c"+this_section+"_select_all";
 206                     jQuery('#'+selectall_id).before(error_html);
 207                 }
 208             }
 209
 210         });
 211 }
 212
 213 function get_selected_data(this_section) {
 214     var selected_data = [];
 215
 216     for (i=1; i <= this_section; i++) {
 217         var element_id = "c"+i+"_data";
 218         var data = jQuery("#"+element_id).val();
 219         if (data) selected_data.push(data);
 220     }
 221     //if (window.console) console.log("selected data= "+JSON.stringify(selected_data));
 222     return selected_data;
 223 }
 224
 225 function get_selected_categories(this_section) {
 226   var selected_categories = [];
 227   var select1 = jQuery('#select1').val();
 228   if (select1 === '') { // if starting category is undefined
 229     if (jQuery('#paste_list_select').val()) { // check to see if paste from list was used, if so get list type
 230             select1 = jQuery('#paste_list_select').prop('title');
 231       //if (window.console) console.log("select1="+select1);
 232     }
 233   }
 234   selected_categories.push(select1);
 235   for (i=2; i <= this_section; i++) {
 236     var element_id = "select"+i;
 237     var category = jQuery("#"+element_id).val();
 238     selected_categories.push(category);
 239   }
 240   var next_section = this_section +1;
 241   var next_select_id = "select"+next_section;
 242   jQuery("#"+next_select_id).val('please select');
 243   //if (window.console) console.log("selected categories= "+JSON.stringify(selected_categories));
 244   return selected_categories;
 245 }
 246
 247 function get_selected_results (type) {
 248     var max_section = 4;
 249     var selected = [];
 250     var categories = get_selected_categories(max_section);
 251     var data = get_selected_data(max_section);
 252     for (i=0; i < categories.length; i++) {
 253         if (categories[i] === type && data[i]) {
 254             selected = data[i];
 255         }
 256     }
 257     return selected;
 258 }
 259
 260 function get_selected_genotyping_protocols () {
 261     var max_section = 4;
 262     var selected_genotyping_protocol;
 263     var categories = get_selected_categories(max_section);
 264     var data = get_selected_data(max_section);
 265     for (i=0; i < categories.length; i++) {
 266       if (categories[i] === 'genotyping_protocols' && data[i]) {
 267         selected_genotyping_protocol = data[i];
 268       }
 269     }
 270     if (selected_genotyping_protocol){
 271         if (selected_genotyping_protocol.length == 1) {
 272             return selected_genotyping_protocol;
 273         }
 274     }
 275 }
 276
 277 function update_select_categories(this_section, selected_categories) {
 278     //console.log("selected_categories="+selected_categories);
 279     if (selected_categories === undefined) var selected_categories = get_selected_categories(this_section);
 280     var categories = { '': 'please select', accessions : 'accessions', breeding_programs: 'breeding_programs', genotyping_protocols : 'genotyping_protocols', locations : 'locations', plants : 'plants', plots : 'plots', traits : 'traits', trials : 'trials', trial_designs : 'trial_designs', trial_types : 'trial_types', years : 'years'};
 281     var all_categories = copy_hash(categories);
 282
 283     for (i=0; i < this_section; i++) {
 284         delete all_categories[selected_categories[i]];
 285     }
 286     var remaining_categories = format_options(all_categories);
 287     var next_section = ++this_section;
 288     var next_select_id = "select"+next_section;
 289
 290     jQuery('#'+next_select_id).html(remaining_categories);
 291 }
 292
 293 function update_download_options(this_section, categories) {
 294     if (categories === undefined) var categories = get_selected_categories(this_section);
 295     var data = get_selected_data(this_section);
 296     var selected_trials = 0;
 297     var selected_accessions= 0;
 298     var selected_genotyping_protocols = 0;
 299     if (isLoggedIn()) {
 300         jQuery('#wizard_download_phenotypes_button').prop( 'title', 'Click to Download Trial Phenotypes');
 301         jQuery('#wizard_download_phenotypes_button').removeAttr('disabled');
 302     }
 303
 304     for (i=0; i < categories.length; i++) {
 305         //if (categories[i]) {console.log("category ="+categories[i]);}
 306         //if (data !== undefined) {console.log("data ="+data[i]);}
 307       if (categories[i] === 'trials' && data[i]) {
 308         selected_trials = 1;
 309         var trial_html = '<font color="green">'+data[i].length+' trials selected</font></div>';
 310         jQuery('#selected_trials').html(trial_html);
 311       }
 312       if (categories[i] === 'accessions' && data[i]) {
 313         selected_accessions = 1;
 314         var accession_html = '<font color="green">'+data[i].length+' accessions selected</font></div>';
 315         jQuery('#selected_accessions').html(accession_html);
 316       }
 317       if (categories[i] === 'genotyping_protocols' && data[i]) {
 318         selected_genotyping_protocols = 1;
 319         if (data[i].length > 1) {
 320           var genotyping_protocols_html = '<font color="red">'+data[i].length+' genotyping protocols selected</font></div>';
 321         }
 322         else {
 323           var genotyping_protocols_html = '<font color="green">'+data[i].length+' genotyping protocols selected</font></div>';
 324         }
 325         jQuery('#selected_genotyping_protocols').html(genotyping_protocols_html);
 326       }
 327     }
 328     if ( (selected_trials == 1 || selected_accessions == 1) && isLoggedIn()) {
 329       jQuery('#download_button_genotypes').prop( 'title', 'Click to Download Accession Genotypes');
 330             jQuery('#download_button_genotypes').removeAttr('disabled');
 331     }
 332     //console.log("trials-selected="+trials_selected);
 333     //console.log("accessions-selected="+accessions_selected);
 334     if (selected_trials !== 1) {
 335       jQuery('#selected_trials').html('No trials selected');
 336     }
 337     if (selected_accessions !== 1) {
 338       jQuery('#selected_accessions').html('No accessions selected');
 339     }
 340     if (selected_genotyping_protocols !== 1) {
 341       jQuery('#selected_genotyping_protocols').html('No genotyping protocols selected. Default will be used.');
 342     }
 343 }
 344
 345 function reset_downstream_sections(this_section) {  // clear downstream selects, data_panels, data_counts
 346     jQuery('#response_error').remove();
 347     for (i = 4; i > this_section; i--) {
 348         var select_id = "select"+i;
 349         var data_id = "c"+i+"_data";
 350         var count_id = "c"+i+"_data_count";
 351         var querytype_id = "c"+i+"_querytype";
 352   var list_menu_id = "c"+i+"_to_list_menu";
 353   var replacement = '<div id="'+list_menu_id+'"></div>';
 354         jQuery('#'+select_id).html('');
 355         jQuery('#'+data_id).html('');
 356         jQuery('#'+count_id).html('No Selection');
 357         jQuery('#'+querytype_id).bootstrapToggle('off');
 358   jQuery('#'+list_menu_id).replaceWith(replacement);
 359     }
 360 }
 361
 362 function create_list_start(message) {
 363     var lo = new CXGN.List();
 364     var listhtml = lo.listSelect('paste', '', message, 'refresh');
 365     jQuery('#paste_list').html(listhtml);
 366     jQuery('#paste_list_select').change(
 367       function() {
 368         pasteList();
 369     });
 370 }
 371
 372 function pasteList() {
 373   //if (window.console) console.log("pasting list . . .");
 374
 375   jQuery('#list_message').html('');
 376   var list_id = jQuery('#paste_list_select').val();
 377   //var value = jQuery('#list_start_list_select').val();
 378   //if (window.console) console.log("list_start_list_select_val ="+value);
 379   if (list_id === '') {
 380     jQuery('#c1_data').html('');
 381     return;
 382   }
 383   else {  // paste list by retrieving ids and combining them with list values in proper format
 384     //if (window.console) console.log("disabling ui . . .");
 385     disable_ui();
 386     var lo = new CXGN.List();
 387     var data = lo.getListData(list_id);
 388     var elements = data.elements;
 389     var options = [];
 390     //if (window.console) console.log("list_data="+JSON.stringify(data));
 391
 392     if (data === undefined) {
 393       report_list_start_error("Unable to retrieve data from this list.");
 394       return;
 395     }
 396
 397     if (data.type_name === '') {
 398       report_list_start_error("Unable to start from a list of type null.");
 399       return;
 400     }
 401     if (data.type_name === 'years') {
 402       for (var n=0; n<elements.length; n++) {
 403         options.push([elements[n][1], elements[n][1]]);
 404       }
 405     }
 406     else { // retrieve ids if they exist
 407       var ids = lo.transform2Ids(list_id, data);
 408       //if (window.console) console.log("list_ids="+JSON.stringify(ids));
 409       if (ids === undefined) {
 410         report_list_start_error("Unable to retrieve ids from this list. Has this list been validated using the list manager?");
 411         return;
 412       }
 413       for (var n=0; n<elements.length; n++) { // format ids and names of list elements to display
 414         options.push([ids[n], elements[n][1]]);
 415       }
 416     }
 417     c1_html = format_options_list(options);
 418     jQuery('#c1_data').html(c1_html);
 419     jQuery('#c1_data_text').html(retrieve_sublist(options, 1).join("\n"));
 420
 421     // clear and reset all other wizard parts
 422     var this_section = 1;
 423     initialize_first_select();
 424     show_list_counts('c1_data_count', options.length);
 425     reset_downstream_sections(this_section);
 426     update_select_categories(this_section, data.type_name);
 427     update_download_options(this_section, data.type_name);
 428
 429     if (jQuery('#navbar_lists').length) {
 430       addToListMenu('c1_to_list_menu', 'c1_data', {
 431         selectText: true,
 432         listType: data.type_name
 433       });
 434     }
 435     jQuery('#paste_list_select').prop('title', data.type_name);  // so get_selected_categories method doesn't have to retrieve list data everytime
 436     enable_ui();
 437   }
 438 }
 439
 440 function report_list_start_error(error_message) {
 441   enable_ui();
 442   var error_html = '<div class="well well-sm"><font color="red">'+error_message+'</font></div>';
 443   jQuery('#list_message').html(error_html);
 444 }
 445
 446 function format_options(items) {
 447     var html = '';
 448     for (var key in items) {
 449         html = html + '<option value="'+key+'" title="'+items[key]+'">'+items[key]+'</a>\n';
 450     }
 451     return html;
 452 }
 453
 454 function retrieve_sublist(list, sublist_index) {
 455     var new_list = new Array();
 456     for(var i=0; i<list.length; i++) {
 457         new_list.push(list[i][sublist_index]);
 458     }
 459     return new_list;
 460 }
 461
 462 function format_options_list(items) {
 463     var html = '';
 464     if (items) {
 465         for(var i=0; i<items.length; i++) {
 466             html = html + '<option value="'+items[i][0]+'" title="'+items[i][1]+'">'+items[i][1]+'</a>\n';
 467         }
 468         return html;
 469     }
 470     return "no data";
 471 }
 472
 473 function copy_hash(hash) {
 474     var new_hash = new Array();
 475
 476     for (var key in hash) {
 477         new_hash[key] = hash[key];
 478     }
 479      return new_hash;
 480 }
 481
 482 function disable_ui() {
 483     jQuery('#working_modal').modal("show");
 484 }
 485
 486 function enable_ui() {
 487      jQuery('#working_modal').modal("hide");
 488 }
 489
 490 function show_list_counts(count_div, total_count, selected) {
 491     var html = 'Items: '+total_count+'<br />';
 492     if (selected) {
 493         html += 'Selected: '+selected;
 494     }
 495     jQuery('#'+count_div).html(html);
 496 }
 497
 498 function selectAllOptions(obj) {
 499     if (!obj || obj.options.length ==0) { return; }
 500     for (var i=0; i<obj.options.length; i++) {
 501       obj.options[i].selected = true;
 502     }
 503 }
 504
 505 function check_missing_criteria(categories, data, this_section) {
 506     var test = data.length + 1;
 507     if (categories.length > test) {
 508         var error_html = '<div class="well well-sm" id="response_error"><font color="red">Error: Select at least one option from each preceding panel</font></div>';
 509         var selectall_id = "c"+this_section+"_select_all";
 510         jQuery('#'+selectall_id).before(error_html);
 511         return 1;
 512     } else {
 513         return 0;
 514     }
 515 }
 516
 517 function get_querytypes(this_section) {
 518     var querytypes = [];
 519
 520     for (i=2; i <= this_section; i++) {
 521         var element_id = "c"+i+"_querytype";
 522         if (jQuery('#'+element_id).is(":checked")) {
 523             var type = 1;
 524         } else {
 525             var type = 0;
 526         }
 527         //if (window.console) console.log("querytype="+type);
 528         querytypes.push(type);
 529     }
 530     if (querytypes.length > 0) {
 531     return querytypes;
 532     }
 533 }
 534
 535 function initialize_first_select() {
 536   var starting_categories = { '': 'Select a starting category', breeding_programs: 'breeding_programs', genotyping_protocols : 'genotyping_protocols', locations : 'locations', traits : 'traits', trials : 'trials', trial_designs : 'trial_designs', trial_types : 'trial_types', years : 'years'};
 537   var start = format_options(starting_categories);
 538   jQuery('#select1').html(start);
 539 }
 540
 541 function add_data_refresh() {
 542     var roles = getUserRoles();
 543     //console.log("userroles="+roles);
 544     if (jQuery.inArray(roles, ['submitter', 'curator', 'sequencer']) >= 0) {
 545         jQuery('#wizard_refresh').append('<p align="center" style="margin: 0px 0"><i>Don\'t see your data?</i></p><input class="btn btn-link center-block" id="open_update_dialog" type="button" value="Update wizard">');
 546     }
 547 }
 548
 549 function refresh_matviews() {
 550     jQuery.ajax( {
 551         url: '/ajax/breeder/refresh',
 552         timeout: 60000,
 553         method: 'POST',
 554         beforeSend: function() {
 555             jQuery('#update_wizard').button('loading');
 556         },
 557         success: function(response) {
 558                 if (response.error) {
 559                     var error_html = '<div class="well well-sm" id="update_wizard_error"><font color="red">'+response.error+'</font></div>';
 560                     jQuery('#update_wizard_error').replaceWith(error_html);
 561                 } else {
 562                     var success_html = '<div class="well well-sm" id="update_wizard_error"><font color="green">Success! Update initiated.</font></div>';
 563                     jQuery('#update_wizard_error').replaceWith(success_html);
 564                     matviews_update_options();
 565                 }
 566             },
 567         error: function(request, status, err) {
 568                 if (status == "timeout") {
 569                     // report timeout
 570                     var error_html = '<div class="well well-sm" id="update_wizard_error"><font color="red">Timeout error. Request could not be completed within 60 second time limit.</font></div>';
 571                     jQuery('#update_wizard_error').replaceWith(error_html);
 572                 } else {
 573                     // report unspecified error occured
 574                     var error_html = '<div class="well well-sm" id="update_wizard_error"><font color="red">Unspecified error. If this problem persists, please <a href="../../contact/form">contact developers</a></font></div>';
 575                     jQuery('#update_wizard_error').replaceWith(error_html);
 576                 }
 577             }
 578     });
 579 }
 580
 581 function matviews_update_options() {
 582     jQuery.ajax( {
 583         url: '/ajax/breeder/check_status',
 584         timeout: 60000,
 585         method: 'POST',
 586         success: function(response) {
 587                 if (response.refreshing) {
 588                     // if already refreshing, display status in modal and create disabled button
 589                     var update_status = response.refreshing;
 590                     jQuery('#wizard_status').replaceWith(update_status);
 591                     var button_html = '<button type="button" class="btn btn-primary wiz-update" name="update_wizard" data-loading-text="Working..." id="update_wizard" title="A search wizard update is already in progress..." disabled>Update search wizard</button>';
 592                     jQuery('#update_wizard').replaceWith(button_html);
 593                 } else if (response.timestamp) {
 594                     // if exists display timestamp in modal and create button
 595                     var update_status = response.timestamp;
 596                     jQuery('#wizard_status').replaceWith(update_status);
 597                     var button_html = '<button type="button" class="btn btn-primary wiz-update" name="update_wizard" data-loading-text="Working..." id="update_wizard" title="Refresh the search wizard to include newly uploaded data">Update search wizard</button>';
 598                     jQuery('#update_wizard').replaceWith(button_html);
 599                 }
 600             },
 601         error: function(request, status, err) {
 602                 if (status == "timeout") {
 603                     // report timeout
 604                     var error_html = '<div class="well well-sm" id="wizard_status"><font color="red">Timeout error. Request could not be completed within 60 second time limit.</font></div>';
 605                     jQuery('#wizard_status').replaceWith(error_html);
 606                 } else {
 607                     // report unspecified error occured
 608                     var error_html = '<div class="well well-sm" id="wizard_status"><font color="red">Unspecified error. If this problem persists, please <a href="../../contact/form">contact developers</a></font></div>';
 609                     jQuery('#wizard_status').replaceWith(error_html);
 610                 }
 611             }
 612     });
 613 }
 614
 615 function manage_dl_with_cookie (token, ladda) {
 616   var cookie = 'download'+token;
 617   var fileDownloadCheckTimer = window.setInterval(function () { //checks for response cookie to keep working modal enabled until file is ready for download
 618     var cookieValue = jQuery.cookie(cookie);
 619     //console.log("cookieValue="+cookieValue);
 620     //var allCookies = document.cookie;
 621     //console.log("allCookies="+allCookies);
 622     if (cookieValue == token) {
 623       window.clearInterval(fileDownloadCheckTimer);
 624       jQuery.removeCookie(cookie); //clears this cookie value
 625       ladda.stop();
 626     }
 627   }, 500);
 628 }