debug
[wrf-fire-matlab.git] / femwind / nd_assembly.m
blobb15be594089333f4316c07464f611fc8ef4aed3e
1 function K=nd_assembly(A,X,lambda,params);
2 % in: 
3 %  A  penalty coefficients matrix, size 3x3, s.p.d.
4 %  X  cell array with 3d arrays x y z coordinates of mesh vertices
5 % out:
6 %  K  stiffness matrix, stored as size (n1,n2,n3,3,3,3)
8 fprintf('sparse_assembly:')
10 d = size(X,2);    % dimensions
11 n = size(X{1});   % mesh size in nodes
12 nn = prod(n);     % total nodes
14 % initialize matrices
15 F = zeros(nn,1);
16 K = zeros(n(1),n(2),n(3),3,3,3);
18 % preallocate matrices
19 tstart=tic;    % start timer
20 Xloc = zeros(3,8);
21 kglo=zeros(1,8);
22 m = n-1;       % grid size in elements
23 disp('accumulating global stiffness matrix entries')
24 for i3=1:m(3)
25     for i2=1:m(2)
26         for i1=1:m(1)  % loop over elements
27             % now in element (i1,i2,i3)
28             % build the matrix of node coordinates to pass to hexa
29             for j3=0:1 % loop over corners of the element
30                 for j2=0:1
31                     for j1=0:1   
32                         jloc=1+j1+2*(j2+2*j3);  % local index of the node in element (i1, i2. i3)
33                         for i=1:3
34                             Xloc(i,jloc)=X{i}(i1+j1,i2+j2,i3+j3); % node coordinate i
35                         end
36                     end
37                 end
38             end
39             [Kloc,~,~]=hexa(A,Xloc,zeros(3,1)); % compute the local matrix
40             % loop over local matrix entries j,k
41             for j3=0:1 % 
42                 for j2=0:1
43                     for j1=0:1   
44                         jloc=1+j1+2*(j2+2*j3); % local index j
45                         for k3=0:1 % loop over corners of the element
46                             for k2=0:1
47                                 for k1=0:1   
48                                     kloc=1+k1+2*(k2+2*k3);
49                                     % add entry of the local matrix; need
50                                     % to offset by 2 because all arrays 
51                                     % dimensions in matlab start at 1
52                                     K(i1+j1,i2+j2,i3+j3,2+k1-j1,2+k2-j2,2+k3-j3)=...
53                                         K(i1+j1,i2+j2,i3+j3,2+k1-j1,2+k2-j2,2+k3-j3)+...
54                                         Kloc(jloc,kloc);
55                                 end
56                             end
57                         end
58                     end
59                 end
60             end                   
61         end        
62     end
63 end
65 end