new file: ts_smoke_xr.py
[wrf-fire-matlab.git] / femwind / rb_schwarz_solve.m
blob6d96bd2da99711570c09e5eb1362c67e35197e16
1 function [x,it]=rb_schwarz_solve(K,F,X)
2 % x=rb_line_gs_solve(K,F,X)
3 disp('solver red-black horizonal schwarz')
4 n = size(X{1})
5 nn = size(F,1)
6 if nn~=prod(n)
7     error('rb_line_gs_solve: inconsistent sizes')
8 end
10 % parameters
11 maxit=1000
12 tol = 1e-5*big(F)/big(K)
13 sub_size=[6,6]
14 sub_step=[4,4]
15 overlap=sub_size-sub_step
16 % index sets
18 % divide into intervals in dimensions 1 and 2
19 sub_nodes=cell(1,2);
20 for i=1:2
21     msub=ceil(n(i)/sub_step(i));
22     % sub_nodes{i}=cell(msub,1); 
23     for j=1:msub
24         from = (j-1)*sub_step(i)+1;
25         to = min(from+sub_size(i)-1,n(i));
26         sub_nodes{i}{j}=[from:to];
27         disp(['direction ',num2str(i),' group ',num2str(j),' indices ',num2str(sub_nodes{i}{j})])
28         if to >= n(i)
29             nsub(i)=j;
30             break
31         end
32      end
33 end
35 check_cover(n(1),sub_nodes{1}(:))
36 check_cover(n(2),sub_nodes{2}(:))
39 % global node indices for the subdomains
40 IX = cell(nsub);
41 for i1=1:nsub(1)
42     for i2=1:nsub(2)
43         idx1 = sub_nodes{1}{i1}; % horizontal rectangle
44         idx2 = sub_nodes{2}{i2};
45         idx3 = 1:n(3); % vertical all
46         disp(['subdomain ',num2str([i1,i2]),' nodes ',num2str(idx1),' by ',num2str(idx2)])
47         [ix1,ix2,ix3]=ndgrid(idx1,idx2,idx3);
48         ix=sub2ind(n,ix1(:),ix2(:),ix3(:));
49         IX{i1,i2}=ix;
50     end
51 end
53 % check indices
54 check_cover(nn,IX(:))
56 disp('decomposing subdomain matrices')
57 R=cell(nsub);  % cholesky factor
58 P=cell(nsub);  % permutation
59 for i1=1:nsub(1)
60     for i2=1:nsub(2)
61         idx1 = sub_nodes{1}{i1}; % horizontal rectangle
62         idx2 = sub_nodes{2}{i2};
63         idx3 = 1:n(3); % vertical all
64         ix = IX{i1,i2};
65         [R{i1,i2},ierr,P{i1,i2}]=chol(K(ix,ix),'vector');
66         if ierr
67             error(['Subdomain matrix is not positive definite, error ',num2str(ierr)])
68         end
69         p = P{i1,i2}; r = R{i1,i2}; k = K(ix,ix); err(1) = big(k(p,p)-r'*r);
70         b = rand(length(p),1); x = r\(r'\b(p)); x(p)=x; err(2) = big(k*x-b);
71         fprintf('subdomain %g %g size %g %g %g nodes %g nonzeros %g Cholesky %g error %g %g\n',...
72             i1,i2,length(idx1),length(idx2),length(idx3),length(ix),...
73             nnz(K(ix,ix)),nnz(R{i1,i2}),err)
74     end
75 end
76         
77 x = zeros(nn,1);
78 % xx = zeros(nn,1);
79 for it=1:maxit
80     for rb1=1:2
81         for rb2=1:2
82             for i1=rb1:2:nsub(1)
83                 for i2=rb2:2:nsub(2)
84                     % solving horizontal location i1 i2 and vertical line
85                     ix = IX{i1,i2};
86                     % x(ix) = x(ix) + K(ix,ix)\(F(ix) - K(:,ix)'*x);
87                     p = P{i1,i2}; % Ksub(p,p)= R'*R
88                     res = F(ix) - K(:,ix)'*x;
89                     sol = R{i1,i2}\(R{i1,i2}'\res(p));
90                     sol(p) = sol;
91                     % err = big(res - K(ix,ix)*sol)
92                     x(ix) = x(ix) + sol;
93                     % err = big(xx(ix)-x(ix))
94                 end
95             end
96         end
97     end
98     res= norm(K*x-F);
99     fprintf('iteration %g residual %g tolerance %g\n',it,res,tol)
100     if res<tol,
101         break
102     end
107 function check_cover(m,x)
108 % check if cell array x contains indices that cover 1 to m
109 c=zeros(m,1);
110 for i=1:length(x)
111    c(x{i})=c(x{i})+1;
113 if any(c==0),
114     error('subdomains do not cover all nodes')