gitinore *.txt files
[wrf-fire-matlab.git] / cycling / l2_detect.m
blob41c7bb04f2d2e79a4fefc7a96d6fa4a86195abc4
1 function outs = l2_detect(red)
4 [fire_name,save_name,prefix] = fire_choice()
5 %Longitude = hdfread('/home/jhaley/JPSSdata/MOD03.A2013222.0545.006.2013222112442.hdf', 'MODIS_Swath_Type_GEO', 'Fields', 'Longitude');
6 %Latitude = hdfread('/home/jhaley/JPSSdata/MOD03.A2013222.0545.006.2013222112442.hdf', 'MODIS_Swath_Type_GEO', 'Fields', 'Latitude');
7 %fire_mask = hdfread('/home/jhaley/JPSSdata/MOD14.A2013222.0545.006.2015263221706.hdf', '/fire mask', 'Index', {[1  1],[1  1],[2030  1354]});
9 dhdf=dir([prefix,'*.hdf']);
10 dh5 = dir([prefix,'*.h5']);
11 dnc = dir([prefix,'*.nc']);
12 d=[{dhdf.name},{dh5.name},{dnc.name}];
13 %d={d.name};
15 if(isempty(d)), error(['No files found for ',prefix]),end
17 % order the files in time
18 nfiles=length(d);
19 t=zeros(1,nfiles);
20 for i=1:nfiles
21     f{i}=[prefix,d{i}];
22     t(i)=rsac2time(d{i});
23 end
25 [t,i]=sort(t);
26 p.file={d{i}};
27 p.time=t;
29 fires = [0 0]
30 gran_count = 1;
31 for k = 1:nfiles
32     if mod(k,2) == 1
33         file = p.file{k};
34         file2 = p.file{k+1};
35         v = readl2data(prefix,file,file2);
36         % select fire detection within the domain
37         lon_bot = v.lon<red.max_lon;
38         lon_top = v.lon>red.min_lon;
39         lat_bot = v.lat<red.max_lat;
40         lat_top = v.lat>red.min_lat;
41         lon_msk = logical(lon_top.*lon_bot);
42         lat_msk = logical(lat_top.*lat_bot);
43         msk = logical(lat_msk.*lon_msk);
44         xj=find(v.lon > red.min_lon & v.lon < red.max_lon);
45         xi=find(v.lat > red.min_lat & v.lat < red.max_lat);
46         idx = (intersect(xi,xj));
47         ax=[red.min_lon red.max_lon red.min_lat red.max_lat];
48         if isempty(xi) | isempty(xj)
49             fprintf('outside of the domain\n');
50         end
51         if sum(msk(:)) > 0
52         v.data = v.data(idx);
53         v.lon = v.lon(msk);
54         v.lat = v.lat(msk);
55         dets = v.data >= 7;
56         g(gran_count) = v;
57         v;
58         if sum(msk(:)) > 0
59             fires = [fires; v.lon(dets) v.lat(dets)];
60             %fires = [fires; v.lons(dets) v.lats(dets)];
61         end
62         gran_count = gran_count + 1;
63         end
64     end
65 end
67 fires = fires(2:end,:);
68 fprintf('%d fires in %d granules \n',length(fires), length(d))
69 figure,scatter(fires(:,1),fires(:,2))
71 outs.fires = fires;
72 outs.g = g;
74 end