detect_ignition/compute_log_likelihoods.m

   1 function [ out_struct ] = compute_log_likelihoods( in_struct )\r
   2 % [ out_struct ] = compute_log_likelihoods( in_struct )\r
   3 % function takes in a struct with fire data and returns a struct with log\r
   4 % likelihoods corresponding to fire data\r
   5 \r
   6 % inputs arguments\r
   7 % in_struct Matlab structure with the following fields\r
   8 %     in_struct.pts : nx2 array containing coordinates of ignitions\r
   9 %     in_struct.dirs : n^2x1 cell array with directories containing w.mat and\r
  10 %          fuels.m files\r
  11 \r
  12 % output arguments\r
  13 % out_struct Matlb structure with the same fields as input as well as \r
  14 %     out_struct.logs : nx1 array with log likelihoods corresponding to the\r
  15 %     ignition points\r
  16  \r
  17 out_struct = in_struct;\r
  18 %needs to run in fs\r
  19 cwd = pwd\r
  20 [m n] = size(in_struct.names');\r
  21 logs = zeros(m,1);\r
  22 % loop over number of ignitions\r
  23 \r
  24 for i = 1:m\r
  25     % cd folders to get w,fuels files\r
  26     cd g_run_data;\r
  27     cd(in_struct.dirs{i});\r
  28     copyfile('w.mat','C:\cygwin64\home\paulc\fs\w.mat')\r
  29     copyfile('fuels.m','C:\cygwin64\home\paulc\fs\fuels.m')\r
  30     \r
  31     cd(cwd)\r
  32     clear w;\r
  33     load w.mat\r
  34     logs(i) = detection_log_likelihood('TIFs/',w);\r
  35 end\r
  36 out_struct.logs = logs;\r
  37 %save out_struct_new_objective.mat out_struct;\r
  38 end\r
  39 \r