pkgs/by-name/em/emboss/package.nix

   1 { lib, stdenv, fetchurl, readline, perl, libharu, libX11, libpng, libXt, zlib }:
   2
   3 stdenv.mkDerivation rec {
   4   pname = "emboss";
   5   version = "6.6.0";
   6
   7   src = fetchurl {
   8     url = "ftp://emboss.open-bio.org/pub/EMBOSS/EMBOSS-${version}.tar.gz";
   9     sha256 = "7184a763d39ad96bb598bfd531628a34aa53e474db9e7cac4416c2a40ab10c6e";
  10   };
  11
  12   buildInputs = [ readline perl libharu libpng libX11 libXt zlib ];
  13
  14   configureFlags = [ "--with-hpdf=${libharu}" "--with-pngdriver=${zlib}" ];
  15
  16   postConfigure = ''
  17     sed -i 's@$(bindir)/embossupdate@true@' Makefile
  18   '';
  19
  20   meta = {
  21     description = "European Molecular Biology Open Software Suite";
  22     longDescription = ''
  23       EMBOSS is a free Open Source software analysis package
  24       specially developed for the needs of the molecular biology (e.g. EMBnet)
  25       user community, including libraries. The software automatically copes with
  26       data in a variety of formats and even allows transparent retrieval of
  27       sequence data from the web.
  28     '';
  29     license = lib.licenses.gpl2;
  30     homepage = "https://emboss.sourceforge.net/";
  31   };
  32 }