pkgs/by-name/ma/macse/package.nix

   1 { lib, stdenv, fetchurl, jre, makeWrapper }:
   2
   3 stdenv.mkDerivation rec {
   4   pname = "macse";
   5   version = "2.03";
   6
   7   src = fetchurl {
   8     url = "https://bioweb.supagro.inra.fr/${pname}/releases/${pname}_v${version}.jar";
   9     sha256 = "0jnjyz4f255glg37rawzdv4m6nfs7wfwc5dny7afvx4dz2sv4ssh";
  10   };
  11
  12   nativeBuildInputs = [ makeWrapper ];
  13
  14   dontUnpack = true;
  15   dontBuild = true;
  16
  17   installPhase = ''
  18     runHook preInstall
  19     mkdir -p $out/share/java
  20     cp -s $src $out/share/java/macse.jar
  21     makeWrapper ${jre}/bin/java $out/bin/macse --add-flags "-jar $out/share/java/macse.jar"
  22     runHook postInstall
  23   '';
  24
  25   meta = with lib; {
  26     description = "Multiple alignment of coding sequences";
  27     mainProgram = "macse";
  28     homepage = "https://bioweb.supagro.inra.fr/macse/";
  29     sourceProvenance = with sourceTypes; [ binaryBytecode ];
  30     license = licenses.gpl2;
  31     maintainers = [ maintainers.bzizou ];
  32     platforms = platforms.all;
  33   };
  34 }