pkgs/development/python-modules/pylion/default.nix

   1 { lib
   2 , buildPythonPackage
   3 , fetchFromBitbucket
   4 , h5py
   5 , termcolor
   6 , pexpect
   7 , jinja2
   8 , sphinxHook
   9 , sphinx-rtd-theme
  10 }:
  11
  12 buildPythonPackage {
  13   pname = "pylion";
  14   version = "0.5.3";
  15   format = "setuptools";
  16
  17   src = fetchFromBitbucket {
  18     owner = "dtrypogeorgos";
  19     repo = "pylion";
  20     # Version is set in setup.cfg, but not in a git tag / bitbucket release
  21     rev = "3e6b96b542b97107c622d66b0be0551c3bd9f948";
  22     hash = "sha256-c0UOv2Vlv9wJ6YW+QdHinhpdaclUh3As5TDvyoRhpSI=";
  23   };
  24
  25   # Docs are not available online, besides the article:
  26   # http://dx.doi.org/10.1016/j.cpc.2020.107187
  27   nativeBuildInputs = [
  28     sphinxHook
  29     sphinx-rtd-theme
  30   ];
  31
  32   propagatedBuildInputs = [
  33     h5py
  34     termcolor
  35     pexpect
  36     jinja2
  37   ];
  38
  39   pythonImportsCheck = [ "pylion" ];
  40
  41   # Tests fail from some reason - some files seem to be missing from the repo.
  42   doCheck = false;
  43
  44   postInstall = ''
  45     mkdir -p $out/share/doc/$name
  46     cp -r examples $out/share/doc/$name/examples
  47   '';
  48
  49   meta = with lib; {
  50     description = "A LAMMPS wrapper for molecular dynamics simulations of trapped ions";
  51     homepage = "https://bitbucket.org/dtrypogeorgos/pylion";
  52     license = licenses.mit;
  53     maintainers = with maintainers; [ doronbehar ];
  54   };
  55 }