pkgs/development/python-modules/nipy/default.nix

   1 { lib
   2 , buildPythonPackage
   3 , fetchPypi
   4
   5 # build-system
   6 , cython
   7 , meson-python
   8 , ninja
   9 , setuptools
  10
  11 # dependencies
  12 , numpy
  13 , scipy
  14 , nibabel
  15 , sympy
  16 , transforms3d
  17
  18 # optional-dependencies
  19 , matplotlib
  20
  21 # tests
  22 , pytestCheckHook
  23 }:
  24
  25 buildPythonPackage rec {
  26   version = "0.6.0";
  27   pname = "nipy";
  28   pyproject = true;
  29
  30   src = fetchPypi {
  31     inherit pname version;
  32     hash = "sha256-BTn2nV4VMeT8bxTOJTHjRU8I2bxFZCzIZCZVn/QcUrk=";
  33   };
  34
  35   postPatch = ''
  36     patchShebangs nipy/_build_utils/cythoner.py
  37   '';
  38
  39   build-system = [
  40     cython
  41     meson-python
  42     setuptools
  43     ninja
  44     numpy
  45   ];
  46
  47   dependencies = [
  48     nibabel
  49     numpy
  50     scipy
  51     sympy
  52     transforms3d
  53   ];
  54
  55   optional-dependencies.optional = [
  56     matplotlib
  57   ];
  58
  59   nativeCheckInputs = [
  60     pytestCheckHook
  61   ] ++ optional-dependencies.optional;
  62
  63   doCheck = false; # partial imports … circular dependencies. needs more time to figure out.
  64
  65   pythonImportsCheck = [
  66     "nipy"
  67     "nipy.testing"
  68     "nipy.algorithms"
  69   ];
  70
  71   meta = with lib; {
  72     homepage = "https://nipy.org/nipy";
  73     description = "Software for structural and functional neuroimaging analysis";
  74     downloadPage = "https://github.com/nipy/nipy";
  75     license = licenses.bsd3;
  76   };
  77
  78 }