pkgs/development/python-modules/segyio/default.nix

   1 { lib
   2 , stdenv
   3 , fetchFromGitHub
   4 , cmake
   5 , ninja
   6 , python
   7 , scikit-build
   8 , pytest
   9 , numpy
  10 }:
  11
  12 stdenv.mkDerivation rec {
  13   pname = "segyio";
  14   version = "1.9.12";
  15
  16   postPatch = ''
  17     # Removing unecessary build dependency
  18     substituteInPlace python/setup.py --replace "'pytest-runner'," ""
  19
  20     # Fixing bug making one test fail in the python 3.10 build
  21     substituteInPlace python/segyio/open.py --replace \
  22     "cube_metrics = f.xfd.cube_metrics(iline, xline)" \
  23     "cube_metrics = f.xfd.cube_metrics(int(iline), int(xline))"
  24   '';
  25
  26   src = fetchFromGitHub {
  27     owner = "equinor";
  28     repo = pname;
  29     rev = "refs/tags/v${version}";
  30     hash = "sha256-+N2JvHBxpdbysn4noY/9LZ4npoQ9143iFEzaxoafnms=";
  31   };
  32
  33   nativeBuildInputs = [ cmake ninja python scikit-build ];
  34
  35   doCheck = true;
  36   # I'm not modifying the checkPhase nor adding a pytestCheckHook because the pytest is called
  37   # within the cmake test phase
  38   nativeCheckInputs = [ pytest numpy ];
  39
  40   meta = with lib; {
  41     description = "Fast Python library for SEGY files";
  42     homepage = "https://github.com/equinor/segyio";
  43     license = licenses.lgpl3Only;
  44     maintainers = with maintainers; [ atila ];
  45   };
  46 }