README

   1 This is a tool for automatic creation of phylogenetic tree
   2 based on a set of genome files. It is made from a couple of
   3 modular scripts that can be put together as needed. However,
   4 to just let it do its thing, use the 'run.sh' script:
   5
   6         ./run.sh cmp_gzip/cmp.sh tree-hoxa1-gzip.png ex_hoxa1/*.dna
   7
   8 It is possible to use different "comparators" - the actual
   9 methods for comparing two DNA files, deciding whether they
  10 are likely to be related. You can try out any cmp_*/cmp.sh.
  11
  12 Some of the examples also contain description of the real tree.
  13 You can generate a picture using e.g.:
  14
  15         dot -Tpng <ex_hoxa1/realtree.dot >tree-hoxa1.png