Add gmx convert-trj
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treec8d837b37f4bef2c225c8a0660d598895e8f7a37
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 2370 CMakeLists.txt
-rw-r--r-- 3481 clfftinitializer.cpp
-rw-r--r-- 4143 clfftinitializer.h
-rw-r--r-- 6945 cuda_arch_utils.cuh
-rw-r--r-- 3821 cuda_kernel_utils.cuh
-rw-r--r-- 7331 cudautils.cu
-rw-r--r-- 14571 cudautils.cuh
-rw-r--r-- 4999 device_utils.clh
-rw-r--r-- 9516 devicebuffer.cuh
-rw-r--r-- 4243 devicebuffer.h
-rw-r--r-- 10779 devicebuffer_ocl.h
-rw-r--r-- 2527 gmxopencl.h
-rw-r--r-- 5427 gpu_macros.h
-rw-r--r-- 2264 gpu_testutils.cpp
-rw-r--r-- 2625 gpu_testutils.h
-rw-r--r-- 4503 gpu_utils.cpp
-rw-r--r-- 18121 gpu_utils.cu
-rw-r--r-- 10843 gpu_utils.h
-rw-r--r-- 20923 gpu_utils_ocl.cpp
-rw-r--r-- 5859 gpu_vec.cuh
-rw-r--r-- 4820 gpueventsynchronizer.cuh
-rw-r--r-- 6168 gpueventsynchronizer_ocl.h
-rw-r--r-- 4571 gpuregiontimer.cuh
-rw-r--r-- 7444 gpuregiontimer.h
-rw-r--r-- 6355 gpuregiontimer_ocl.h
-rw-r--r-- 2843 gputraits.cuh
-rw-r--r-- 2937 gputraits_ocl.h
-rw-r--r-- 4004 hostallocator.cpp
-rw-r--r-- 9913 hostallocator.h
-rw-r--r-- 7048 ocl_caching.cpp
-rw-r--r-- 4001 ocl_caching.h
-rw-r--r-- 20442 ocl_compiler.cpp
-rw-r--r-- 4981 ocl_compiler.h
-rw-r--r-- 5179 oclraii.h
-rw-r--r-- 10690 oclutils.cpp
-rw-r--r-- 12678 oclutils.h
-rw-r--r-- 5933 pinning.cu
-rw-r--r-- 2543 pinning.h
-rw-r--r-- 3619 pmalloc_cuda.cu
-rw-r--r-- 2383 pmalloc_cuda.h
drwxr-xr-x - tests
-rw-r--r-- 2794 vectype_ops.clh
-rw-r--r-- 5317 vectype_ops.cuh