mason/search/phenotypes/qtl.mas

   1 <%doc>
   2 QTL search form.
   3 </%doc>
   4
   5 <%perl>
   6
   7 my $qtl_tool = CXGN::Phenome::Qtl::Tools->new();
   8 my $links    = $qtl_tool->browse_traits();
   9 my @qtl_pops = $qtl_tool->has_qtl_data();
  10
  11 my  $pop_links;
  12
  13 foreach my $qtl_pop (@qtl_pops)
  14   {
  15     my $is_public  = $qtl_pop->get_privacy_status();
  16     my $owner_id   = $qtl_pop->get_sp_person_id();
  17     my $user_type  = $c->user->get_object->get_user_type() if $c->user;
  18     my $user_id    = $c->user->get_object->get_sp_person_id if $c->user;
  19
  20     if ( $is_public || $user_type eq 'curator' || $user_id == $owner_id )
  21       {
  22         my $pop_id   = $qtl_pop->get_population_id();
  23         my $pop_name = $qtl_pop->get_name();
  24         $pop_links  .= qq |<a href="/qtl/population/$pop_id">$pop_name</a> <br /> |;
  25       }
  26   }
  27
  28 </%perl>
  29
  30 <div class="container-fluid">
  31
  32 <&| /page/info_section.mas, title => 'Search QTLs', collapsible=>1, collapsed=>0, subtitle=>'[<a href="/qtl/form">Submit QTL Data</a>]   [<a href="/qtl/submission/guide">Submission Guide</a>]   [<a href="/qtl/search/help">Search Help</a>]' &>
  33
  34 <form  action= "/qtl/search/results" method="post">
  35   <table align=center cellpadding=20px>
  36     <tr>
  37       <td>
  38         <h4>Browse Traits With QTLs: <% $links %></h4>
  39       </td>
  40     </tr>
  41   </table>
  42   <br/>
  43   <div class="well">
  44   <table align=center>
  45     <tr>
  46       <td><h5>Search QTLs With Trait Name:</h5></td>
  47     </tr>
  48     <tr>
  49       <td><input class="form-control" type="text" name="trait" >
  50       <br/><input class="btn btn-primary" type="submit" value="Search"></td>
  51     </tr>
  52   </table>
  53   </div>
  54   <table align=center cellpadding=20px>
  55     <tr>
  56       <td>
  57         <h4>Browse QTL Populations:</h4><br/><% $pop_links %>
  58       </td>
  59     </tr>
  60   </table>
  61 </form>
  62
  63 </&>
  64
  65 </div>