mason/chado/publication.mas

   1
   2
   3 <%doc>
   4
   5 =head1 NAME
   6
   7 /chado/publications.mas - a component for printing publication info
   8
   9 =head1 DESCRIPTION
  10
  11 Parameters:
  12
  13 =over 4
  14
  15 =item pub
  16
  17 CXGN::Chado::Publication object
  18
  19 =item db
  20
  21 db name for linking the publication to an xref (usually PubMed)
  22
  23 =item accession
  24
  25 the accession of the dbxref
  26
  27 =item doi
  28
  29 the DOI of the publication, if one exists
  30
  31 =back
  32
  33 =head1 AUTHOR
  34
  35 Naama Menda <nm249@cornell.edu>
  36
  37 =cut
  38
  39 </%doc>
  40 <%args>
  41   $pub
  42   $doi => undef
  43   $db => undef
  44   $accession => undef
  45 </%args>
  46
  47 <& /util/import_javascript.mas, classes => 'CXGN.Phenome.Publication' &>
  48 <div class="publication_embedded">
  49   <span class="title"> <% $doi %> <% $pub->get_title |h%> </span>  <a href="/publication/<% $pub->get_pub_id |h%>/view">
  50     <% $pub->get_series_name |h%> (<% $pub->get_pyear |h%>) </a>
  51   <br />
  52   <a class="toggle_abstract" href="#">Show / hide abstract</a>
  53   <div class="detail">
  54     <div class="abstract">
  55        <% $pub->get_abstract |h%>
  56     </div>
  57      <div class="citation">
  58        <% $pub->get_authors_as_string |h%>.
  59        <% $pub->get_series_name |h%>.
  60        <% $pub->get_pyear |h%>.
  61         <% $pub->get_volume |h%>(<% $pub->get_issue |h%>).
  62        <% $pub->get_pages |h%>.
  63       </div>
  64   </div>
  65 </div>
  66
  67
  68