mason/tools/bulk/tabs/clone_tab.mas

   1
   2 <%args>
   3 $ug_build_select => ''
   4 $debug => ''
   5 </%args>
   6
   7
   8 <form name="bulkform" action="/tools/bulk/download" method="post" enctype="multipart/form-data">
   9
  10   <br />
  11   <table summary="" cellpadding="10" width="100%"><tr><td valign="top" bgcolor="#EEEEEE" width="320">
  12
  13         <% $ug_build_select %>
  14         <br />
  15
  16         Enter a list of identifiers or upload a file containing identifers, one per line:<br />
  17         <table summary="" width="100%"><tr><td>
  18               <textarea id="ids" name="ids" rows="5" cols="20"></textarea>
  19             </td>
  20             <td>
  21               <i>Example:</i> #example box
  22               <div style="border: 1px solid gray; width: 10em; height: 5em">
  23 <pre><div id="clone_example_ids">cLEB-1-A2
  24 cLEB-1-A3
  25 cLEB-1-A4</div></pre><a href="javascript:copy_example_data()">[copy]</a>
  26 </div>
  27
  28 <script>
  29 function copy_example_data() {
  30 document.getElementById("ids").innerHTML=document.getElementById("clone_example_ids").innerHTML;
  31 }
  32 </script>
  33
  34         </td></tr></table>
  35
  36         <br />
  37         <br />
  38         And/or upload list file: <br /><input type="file" name="file" />
  39         <br />
  40         <br />
  41
  42     </td><td valign="top" bgcolor="#EEEEEE" width="320">
  43         <b>Please select the information you would like for each identifier:</b><br />
  44         <input type="checkbox" name="clone_name" checked="checked" /> clone name<br />
  45         <input type="checkbox" name="SGN_C" checked="checked" /> clone id (SGN-C)<br />
  46         <input type="checkbox" name="SGN_T" checked="checked" /> sequence read id (SGN-T)<br />
  47         <input type="checkbox" name="SGN_E" checked="checked" /> est id (SGN-E)<br />
  48         <input type="checkbox" name="build_nr" checked="checked" /> unigene build nr<br />
  49         <input type="checkbox" name="SGN_U" checked="checked" /> unigene id (SGN-U)<br />
  50         <input type="checkbox" name="chipname" checked="checked" /> chipname<br />
  51         <input type="checkbox" name="SGN_S" checked="checked" /> microarray spot id (SGN-S)<br />
  52         <input type="checkbox" name="TUS" checked="checked" /> TUS number (used to order clones)<br />
  53         <input type="checkbox" name="manual_annotation" /> manual annotation<br />
  54         <input type="checkbox" name="automatic_annotation" /> automatic (BLAST) annotation<br />
  55         <input type="checkbox" name="sequence" onclick="check_fasta_option()" /> sequence<br />
  56         &nbsp;&nbsp;&nbsp;<input type="radio" name="seq_type" value="est_seq" checked="checked" /> EST sequence<br />
  57         &nbsp;&nbsp;&nbsp;<input type="radio" name="seq_type" value="unigene_seq" /> Unigene sequence<br />
  58
  59 </td></tr></table>
  60
  61 %    if ( $debug eq "1" ) {
  62 %        print
  63 %qq|<input type="checkbox" checked="checked" name="debug" /> print debug statements<br /><br />\n|;
  64 %    }
  65
  66         <input type="hidden" name="idType" value="clone" />
  67         <input type="reset" />&nbsp;&nbsp;
  68         <input type="submit" value="Submit" /><br />
  69    </form>
  70
  71