mason/genomes/Petunia_axillaris.mas

   1 <br />
   2 <& /page/page_title.mas, title=>"<i>Petunia axillaris</i> draft genome sequence v1.6.2" &>
   3
   4 <p>
   5   A draft sequence of the <i>Petunia axillaris</i> genome, one of the ancestors of Petunia hybrida, is publicly available (Bombarely et al, 2016).
   6   The P. axillaris N genome sequence, was performed using a hybrid de novo assembly with a combination of short read (Illumina; coverage 137X) and long read technologies (PacBio; coverage 22X)<br>
   7 </p>
   8
   9
  10 <p>
  11   The <i>Petunia axillaris</i> genome data are accessible on SGN through BLAST, JBrowse and the SGN VIGS Tool, and they can be downloaded from the SGN ftp site.
  12 </p>
  13
  14 <br>
  15
  16 <center>
  17     <a class="btn btn-primary" href="/tools/blast/?db_id=272" target="_blank" style="color:white">BLAST</a>&nbsp;&nbsp;
  18     <a class="btn btn-primary" href="ftp://ftp.solgenomics.net/genomes/Petunia_axillaris/" target="_blank" style="color:white">FTP Site</a>&nbsp;&nbsp;
  19     <a class="btn btn-primary" href="http://solgenomics.net/jbrowse_solgenomics/?data=data%2Fjson%2FPeaxi162&loc=Peaxi162Scf00001" target="_blank" style="color:white">JBrowse</a>&nbsp;&nbsp;
  20     <a class="btn btn-primary" href="http://vigs.solgenomics.net" target="_blank" style="color:white">VIGS Tool</a>
  21 </center>
  22
  23 <br>
  24 <br>
  25 <h4>References</h4>
  26 <ul style="list-style-type:disc">
  27   <li>
  28     Bombarely, A., Moser, M, ... Sims, T.L. and Kuhlemeier, C. (2016)<br>
  29     Insight into the evolution of the Solanaceae from the parental genomes of Petunia hybrida<br>
  30    <a href="https://www.nature.com/articles/nplants201674">Nature Plants 2, Article number: 16074 (2016)</a><br>
  31   </li>
  32 </ul>
  33 <br>
  34 <br>
  35