fix run_model call so that it works with non-default options as well.
[sgn.git] / mason / genomes / Solanum_tuberosum.mas
blobef89808868aee93274bbb6f4d0010f2dd9cbe5fb
1 <%args>
2   $organism
3 </%args>
4 <& /page/page_title.mas, title => '<i>'.$organism->species.'</i> Genome Data' &>
6 <div class="page_introduction">
8    The potato genome has been sequenced by the <a
9    href="http://potatogenome.net">Potato Genome Sequence
10    Consortium</a> (PGSC), an international group of scientists from 14
11    countries. The sequence was published in <a
12    href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21743474">Nature</a> in
13    July 2011. Many potato lines are tetraploid; however, the sequenced
14    accession was a homozygous diploid line (double haploid) <i>Solanum
15    tuberosum phureja</i>. Below is a mirror of the files provided on
16    <a href="http://potatogenome.net">http://potatogenome.net</a>.
18 </div>
20 <&| /page/info_section.mas,
21       title       => 'Sequence datasets',
22       collapsible => 1,
23  &>
24   <& /genomes/default/genome_builds.mas, %ARGS &>
25 </&>
28 <&| /page/info_section.mas,
29       title       => 'Browsable annotations',
30       collapsible => 1,
31       hide_if_empty => 1,
32  &>
34   <& /gbrowse/list_sources.mas, organism => $organism &>
36 </&>
38 <&| /page/info_section.mas,
39       title       => 'Annotation datasets',
40       collapsible => 1,
41       hide_if_empty => 1,
42  &>
44   <& /genomes/default/annotation_sets.mas, %ARGS &>
46 </&>