mason/qtl/qtl_form/general_intro.mas

   1 <%doc>
   2
   3 =head1 NAME
   4 qtl/qtl_form/intro.mas - a mason component for displaying an introductory
   5 note for the qtl data submission
   6
   7 =AUTHOR
   8 Isaak Y Tecle (iyt2@cornell.edu)
   9
  10 =cut
  11
  12 </%doc>
  13
  14 <%args>
  15
  16 $guide
  17
  18 </%args>
  19
  20 % if (!$guide) {$guide = 'guidelines';}
  21
  22 <p>The uploading of QTL data needs to be done in one session.
  23   Therefore, prepare your data files in the required format before
  24   starting the process. Please read the submission <% lc($guide) %> first. If you
  25   would like to have the formatting of your dataset checked
  26   beforehand, send your data to: <a href=mailto:iyt2\@cornell.edu>iyt2@cornell.edu</a>.
  27 </p>
  28
  29 <p>Required data:</p>
  30
  31 <ul>
  32   <li>Some basic information about the population,</li>
  33   <li>Traits data file (tab delimited),</li>
  34   <li>Phenotype data file (tab delimited),</li>
  35   <li>Genotype data file (tab delimited) and</li>
  36   <li>Statistical parameters.</li>
  37   <li><i>Markers with their sequences need to be already in SGN.
  38       Read <a href="/cview/help/map_submission">here</a> on how
  39       to submit markers to SGN.
  40   </i>
  41 </ul>
  42