t/selenium2/solgs/genetic_gain.t

   1
   2 use strict;
   3
   4 use lib 't/lib';
   5
   6 use Test::More;
   7 use SGN::Test::WWW::WebDriver;
   8 use SGN::Test::Fixture;
   9 use SGN::Test::solGSData;
  10 use Config::Any;
  11
  12 my $d = SGN::Test::WWW::WebDriver->new();
  13 my $f = SGN::Test::Fixture->new();
  14
  15 my $solgs_data = SGN::Test::solGSData->new({'fixture' => $f, 'accessions_list_subset' => 60, 'plots_list_subset' => 60});
  16 my $cache_dir = $solgs_data->site_cluster_shared_dir();
  17
  18 `rm -r $cache_dir`;
  19 sleep(5);
  20
  21 $d->while_logged_in_as("submitter", sub {
  22     sleep(2);
  23     $d->get('/solgs', 'solgs home page');
  24     sleep(4);
  25     $d->find_element_ok('population_search_entry', 'id', 'population search form')->send_keys('Kasese solgs trial');
  26     sleep(5);
  27     $d->find_element_ok('search_training_pop', 'id', 'search for training pop')->click();
  28     sleep(5);
  29     $d->find_element_ok('Kasese', 'partial_link_text', 'create training pop')->click();
  30     sleep(3);
  31     $d->find_element_ok('queue_job', 'id', 'submit job tr pop')->click();
  32     sleep(2);
  33     $d->find_element_ok('analysis_name', 'id', 'job queueing')->send_keys('Test Kasese Tr pop');
  34     sleep(2);
  35         $d->find_element_ok('user_email', 'id', 'user email')->send_keys('email@email.com');
  36     sleep(2);
  37     $d->find_element_ok('submit_job', 'id', 'submit')->click();
  38     sleep(150);
  39     $d->find_element_ok('Go back', 'partial_link_text', 'go back')->click();
  40     sleep(5);
  41     $d->find_element_ok('population_search_entry', 'id', 'population search form')->send_keys('Kasese solgs trial');
  42     sleep(5);
  43     $d->find_element_ok('search_training_pop', 'id', 'search for training pop')->click();
  44     sleep(5);
  45     $d->find_element_ok('Kasese', 'partial_link_text', 'create training pop')->click();
  46     sleep(10);
  47
  48
  49    # #  #trial type training population: single trait modeling
  50
  51     $d->find_element_ok('dry matter', 'partial_link_text',  'build model')->click();
  52     sleep(3);
  53     $d->find_element_ok('queue_job', 'id', 'no job queueing')->click();
  54     sleep(2);
  55     $d->find_element_ok('analysis_name', 'id', 'fill in modeling job name')->send_keys('Test DMCP model Kasese');
  56     sleep(2);
  57         $d->find_element_ok('user_email', 'id', 'fill user email')->send_keys('email@email.com');
  58     sleep(2);
  59     $d->find_element_ok('submit_job', 'id', 'submit')->click();
  60     sleep(150);
  61     $d->find_element_ok('Go back', 'partial_link_text', 'go back')->click();
  62     sleep(7);
  63
  64     $d->find_element_ok('dry matter', 'partial_link_text',  'build model')->click();
  65     sleep(15);
  66
  67     my $sel_pred = $d->find_element('Predict', 'partial_link_text', 'scroll to selection pred');
  68     my $elem = $d->driver->execute_script( "arguments[0].scrollIntoView(true);window.scrollBy(0,-70);", $sel_pred);
  69     sleep(2);
  70     $d->find_element_ok('population_search_entry', 'id', 'population search form')->send_keys('trial2 NaCRRI');
  71     sleep(2);
  72     $d->find_element_ok('search_selection_pop', 'id', 'search for selection pop')->click();
  73     sleep(10);
  74     $d->find_element_ok('//table[@id="selection_pops_table"]//*[contains(text(), "Predict")]', 'xpath', 'click training pop')->click();
  75     sleep(5);
  76     $d->find_element_ok('queue_job', 'id', 'job queueing')->click();
  77     sleep(2);
  78     $d->find_element_ok('analysis_name', 'id', 'fill in selection prediction job name')->send_keys('Test DMCP selection pred nacrri');
  79     sleep(2);
  80         $d->find_element_ok('user_email', 'id', 'fill user email')->send_keys('email@email.com');
  81     sleep(2);
  82     $d->find_element_ok('submit_job', 'id', 'submit')->click();
  83     sleep(180);
  84     $d->find_element_ok('Go back', 'partial_link_text', 'go back')->click();
  85     sleep(3);
  86
  87     my $sel_pred = $d->find_element('Predict', 'partial_link_text', 'scroll to selection pred');
  88     my $elem = $d->driver->execute_script( "arguments[0].scrollIntoView(true);window.scrollBy(0,-70);", $sel_pred);
  89     sleep(8);
  90     $d->find_element_ok('DMCP', 'partial_link_text', 'go back')->click();
  91     sleep(5);
  92
  93     my $sel_pred = $d->find_element('Expected genetic gain', 'partial_link_text', 'scroll to GEBvs');
  94     my $elem = $d->driver->execute_script( "arguments[0].scrollIntoView(true);window.scrollBy(0,-100);", $sel_pred);
  95     sleep(2);
  96     $d->find_element_ok('check_genetic_gain', 'id',  'run plot genetic gain')->click();
  97     sleep(20);
  98     $d->find_element_ok('boxplot', 'partial_link_text',  'checkout boxplot download link');
  99     sleep(2);
 100
 101     $d->find_element_ok('Kasese solgs trial', 'partial_link_text', 'back to model page')->click();
 102     sleep(5);
 103         $d->find_element_ok('Kasese solgs trial', 'partial_link_text', 'back to training pop page')->click();
 104         sleep(5);
 105
 106     $d->find_element_ok('//table[@id="population_traits_list"]/tbody/tr[1]/td/input', 'xpath', 'select 1st trait')->click();
 107     $d->find_element_ok('//table[@id="population_traits_list"]/tbody/tr[2]/td/input', 'xpath', 'select 2nd trait')->click();
 108     $d->find_element_ok('runGS', 'id',  'build multi models')->click();
 109     sleep(3);
 110     $d->find_element_ok('queue_job', 'id', 'job queueing')->click();
 111     sleep(2);
 112     $d->find_element_ok('analysis_name', 'id', 'job queueing')->send_keys('Test DMCP-FRW modeling  Kasese');
 113     sleep(2);
 114         $d->find_element_ok('user_email', 'id', 'user email')->send_keys('email@email.com');
 115     sleep(2);
 116     $d->find_element_ok('submit_job', 'id', 'submit')->click();
 117     sleep(150);
 118     $d->find_element_ok('Go back', 'partial_link_text', 'go back')->click();
 119     sleep(5);
 120
 121 #####################
 122         # $d->get('/solgs/population/139/gp/1');
 123         # sleep(5);
 124 #####################
 125
 126     $d->find_element_ok('//table[@id="population_traits_list"]/tbody/tr[1]/td/input', 'xpath', 'select 1st trait')->click();
 127     sleep(1);
 128     $d->find_element_ok('//table[@id="population_traits_list"]/tbody/tr[2]/td/input', 'xpath', 'select 2nd trait')->click();
 129     sleep(1);
 130     $d->find_element_ok('runGS', 'id',  'build multi models')->click();
 131     sleep(20);
 132
 133     $d->find_element_ok('population_search_entry', 'id', 'population search form')->send_keys('trial2 NaCRRI');
 134     sleep(2);
 135     $d->find_element_ok('search_selection_pop', 'id', 'search for selection pop')->click();
 136     sleep(5);
 137     $d->find_element_ok('//table[@id="selection_pops_table"]//*[contains(text(), "Predict")]', 'xpath', 'click training pop')->click();
 138     sleep(5);
 139     $d->find_element_ok('queue_job', 'id', 'job queueing')->click();
 140     sleep(2);
 141     $d->find_element_ok('analysis_name', 'id', 'fill in job name')->send_keys('Test DMCP-FRW selection pred naccri');
 142     sleep(2);
 143         $d->find_element_ok('user_email', 'id', 'fill in user email')->send_keys('email@email.com');
 144     sleep(2);
 145     $d->find_element_ok('submit_job', 'id', 'submit')->click();
 146     sleep(250);
 147
 148     $d->find_element_ok('Go back', 'partial_link_text', 'go back')->click();
 149     sleep(5);
 150
 151     my $sel_pred = $d->find_element('Expected genetic gain', 'partial_link_text', 'scroll to GEBvs');
 152     my $elem = $d->driver->execute_script( "arguments[0].scrollIntoView(true);window.scrollBy(0,-100);", $sel_pred);
 153     sleep(2);
 154     $d->find_element_ok('gg_pops_select', 'id', 'select list sl pop')->click();
 155     sleep(3);
 156     $d->find_element_ok('//select[@id="gg_pops_select"]/option[text()="trial2 NaCRRI"]', 'xpath', 'select selection pop')->click();
 157     sleep(3);
 158     $d->find_element_ok('check_genetic_gain', 'id',  'run plot genetic gain')->click();
 159     sleep(40);
 160     $d->find_element_ok('boxplot', 'partial_link_text',  'check multi traits  boxplot download link');
 161     sleep(3);
 162
 163 });
 164
 165
 166
 167 done_testing();