mason/markers/genome.mas

   1 <%args>
   2 $marker
   3 </%args>
   4 <%init>
   5
   6 # look up gbrowse cross-refs for this marker, if any
   7 my @xrefs = map {
   8
   9     $_->xrefs({
  10         -types   => ['match'],
  11         -name    => 'SGN-M'.$marker->marker_id,
  12         -aliases => 1,
  13     })
  14
  15 } $c->enabled_feature('gbrowse2');
  16
  17 </%init>
  18
  19 <&| /page/info_section.mas, title => "Genomic locations" &>
  20 % if( @xrefs ) {
  21   <& /sitefeatures/gbrowse2/xref_set/rich.mas, xrefs => \@xrefs &>
  22 % }
  23 </&>
  24