mason/help/datasets.mas

   1
   2 <& /page/page_title.mas, title => "Dataset Help" &>
   3
   4 <p><b>Working with Datasets</b></p>
   5
   6 <p>Datasets are collections of identifiers that are stored in
   7 the database. Datasets can be composed of accessions, plots, traits, locations,
   8 and trials. Datasets are attached to the individual user’s account, and can
   9 only be created and seen by the user while logged in. SGN databases use
  10 Datasets in analysis tools on the website such as Wizard, GWAS, GS,
  11 Heritability, and Stability tools.</p>
  12
  13 <p><b>Creating Datasets</b></p>
  14
  15 <p>Datasets are generated in the Wizard. Up to 4 identifiers
  16 can be selected. First select the categories and entries in each column. In
  17 this example we have selected Trials, Accessions, and Genotyping Protocols.
  18 Then enter a name in the “Create New Dataset” section. In this example we have
  19 used “Tinker QTL 2021”. After creating the dataset, you can make it public for
  20 others to use by first selecting the dataset using the “Load Dataset”
  21 list then selecting the “Make Public” button.</p>
  22 <img src="/static/documents/help/screenshots/DatasetHelpImage001.png" width="1000px">
  23 <img src="/static/documents/help/screenshots/DatasetHelpImage002.png" width="600px">
  24
  25 <p><b>Retrieving Datasets</b></p>
  26
  27 <p>To retrieve a dataset in the Wizard, select the dataset in
  28 the “Load Dataset” input then select the “Load” button. This will populate the
  29 columns in the Wizard and then allow you to download and analyze the dataset.</p><br>
  30 <img src="/static/documents/help/screenshots/DatasetHelpImage003.png" width="600px">
  31
  32 <p><b>Searching Datasets</b></p>
  33
  34 <p>To search for a dataset, select the “Datasets” link in the
  35 toolbar at the top right of the website. Selecting the Dataset name will
  36 give you a Dataset Detail page</p><br>
  37 <img src="/static/documents/help/screenshots/DatasetHelpImage004.png" width="800px">
  38 <img src="/static/documents/help/screenshots/DatasetHelpImage005.png" width="800px">
  39
  40 <br><br>
  41 <p>Datasets can also be used in publications for linking available
  42 data. Copy the URL from the detail page found in the Search Datasets
  43 page.</p>
  44