mason/tools/bulk/tabs/bac_end_tab.mas

   1
   2 <%args>
   3 $debug => ''
   4 </%args>
   5
   6 <%perl>
   7
   8 =head2 bac_end_search
   9
  10   Desc: sub bac_end_search
  11   Args: n/a
  12   Ret : BAC end tab format
  13
  14   Defines the format of the BAC end=head2 bac_end_search tab using html & perl.
  15   Specifies information fields available for searching BAC ends. Prints the debug
  16   checkbox when debug parameter is set to one.
  17
  18 =cut
  19
  20 </%perl>
  21
  22 <form name="bulkform" action="/tools/bulk/download" method="post" enctype="multipart/form-data">
  23
  24 <br />
  25 <table summary="" cellpadding="10" width="100%"><tr><td valign="top" bgcolor="#EEEEEE" width="370">
  26
  27
  28 <br />
  29 Enter a list of identifiers or upload a file containing identifers separated by whitespace (returns, spaces or tabs):<br />
  30 <table summary="" width="100%"><tr><td>
  31 <textarea name="ids" rows="5" cols="25"></textarea>
  32 </td>
  33 <td>
  34 <i>Example:</i>
  35 <pre style="border: 1px solid gray; width: 15em; height: 5em">
  36 LE_HBa0011C24_SP6_121022
  37 SL_MboI0033A13_SP6_294865
  38 SL_EcoRI0022A07_T7_229350
  39
  40 </pre>
  41 </td></tr></table>
  42 <br />
  43 <br />
  44 And/or upload list file: <br /><input type="file" name="file" />
  45 <br />
  46 <br />
  47
  48 </td><td valign="top" bgcolor="#EEEEEE" width="280">
  49
  50 <b>Download BAC end information:</b><br />
  51 <div style="margin-left: 1em; white-space: nowrap">
  52   <input type="checkbox" name="bac_id" checked= "checked" /> bac end identifier <br />
  53   <input type="checkbox" name="clone_type" checked="checked" /> clone type <br />
  54   <input type="checkbox" name="org_name" checked="checked" /> organism name <br />
  55   <input type="checkbox" name="accession_name" checked="checked" /> accession name <br />
  56   <input type="checkbox" name="library_name" checked="checked" /> library name <br />
  57   <input type="checkbox" name="estimated_length" checked="checked" /> estimated length <br />
  58   <input type="checkbox" name="genbank_accession" checked="checked" /> genbank accession<br />
  59   <!--  <input type="checkbox" name="overgo_matches" checked="checked" DISABLED /> overgo matches <br /> -->  <br />
  60   <b>Choose format and type:</b><br />
  61   <input type="checkbox" name="bac_end_sequence" checked="checked" /> bac end sequence <br />
  62   <input type="checkbox" name="qual_value_seq" checked="checked" /> quality value <br />
  63   <div style="margin-left: 1em">
  64     <input type="radio" name="bac_seq_type" value="raw_seq" />raw sequence and/or quality<br />
  65     <input type="radio" name="bac_seq_type" value="trim_seq" checked="checked" />trimmed seq. and/or quality<br />
  66   </div>
  67 </div>
  68
  69
  70 </td></tr></table>
  71
  72 %    if ( $debug eq "1" ) {
  73 %        print qq|<input type="checkbox" checked="checked" name="debug" /> print debug statements<br /><br />|;
  74 %    }
  75
  76         <input type="hidden" name="idType" value="bac_end" />
  77         <input type="reset" />&nbsp;&nbsp;
  78         <input type="submit" value="Submit"><br />
  79    </form>
  80
  81