static/documents/SGNpublications.txt

   1 <!-- COUNT  1 -->
   2 <div class="subheading">
   3 <a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20964836">
   4 solQTL: a tool for QTL analysis, visualization and linking to genomes at SGN database.</a></div>
   5 <div class="boxsubcontent">
   6 Tecle IY, Menda N, Buels RM, van der Knaap E, Mueller LA.
   7 BMC Bioinformatics. 2010 Oct 21;11:525.
   8 </div>
   9
  10
  11 <div class="subheading">
  12 <a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20935049">
  13 The Sol Genomics Network (solgenomics.net): growing tomatoes using Perl.</a></div>
  14 <div class="boxsubcontent">
  15 Bombarely A, Menda N, Tecle IY, Buels RM, Strickler S, Fischer-York T, Pujar A, Leto J, Gosselin J, Mueller LA.
  16 Nucleic Acids Res. 2011 Jan;39(Database issue):D1149-55. Epub 2010 Oct 8.
  17 </div>
  18
  19
  20 <div class="subheading">
  21 <a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19553373">
  22 A dynamic interface for capsaicinoid systems biology.</a></div>
  23 <div class="boxsubcontent">
  24 Mazourek M, Pujar A, Borovsky Y, Paran I, Mueller L, Jahn MM.
  25 Plant Physiol. 2009 Jun 24
  26 </div>
  27
  28
  29 <div class="subheading">
  30 <a href="http://plantgenome.scijournals.org/content/2/1/78">
  31 A Snapshot of the Emerging Tomato Genome Sequence.</a></div>
  32 <div class="boxsubcontent">
  33 Mueller LA. et al.
  34 Plant Genome. 2009;2(1):78-92.
  35 </div>
  36
  37
  38
  39 <div class="subheading">
  40 <a href="http://www.plantphysiol.org/cgi/content/full/147/4/1788">
  41 A community-based annotation framework for linking solanaceae genomes with phenomes.</a></div>
  42 <div class="boxsubcontent">
  43 Menda N, Buels RM, Tecle I, Mueller LA.
  44 Plant Physiol. 2008 Aug;147(4):1788-99.
  45 </div>
  46
  47
  48
  49 <div class="subheading">
  50 <a href="http://www.biomedcentral.com/1471-2229/8/34">Comparative BAC end sequence analysis of tomato and potato reveals overrepresentation of specific gene families in potato.</a></div>
  51 <div class="boxsubcontent">
  52 Datema E, Mueller LA, Buels R, Giovannoni JJ, Visser RG, Stiekema WJ, van Ham RC.
  53 BMC Plant Biol. 2008 Apr 11;8:34.
  54 </div>
  55
  56
  57
  58 <div class="subheading">
  59 <a href="http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/full/24/3/422">The SGN comparative map viewer</a></div>
  60 <div class="boxsubcontent">
  61 Mueller LA, Mills AA, Skwarecki B, Buels RM, Menda N, Tanksley SD.
  62 Bioinformatics. 2008 Feb 1;24(3):422-3.
  63 </div>
  64
  65
  66
  67 <div class="subheading">
  68 <a href="http://www.genetics.org/cgi/content/full/174/3/1407">Combining bioinformatics and phylogenetics to identify large sets of single-copy orthologous genes (COSII) for comparative, evolutionary and systematic studies: a test case in the euasterid plant clade.</a></div>
  69 <div class="boxsubcontent">
  70 Wu F, Mueller LA, Crouzillat D, P&eacute;tiard V, Tanksley SD.
  71 Genetics. 2006 Nov;174(3):1407-20.
  72 </div>
  73
  74
  75 <div class="subheading">
  76 <a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&amp;db=pubmed&amp;dopt=Abstract&amp;list_uids=16273343&amp;query_hl=1">Coffee and tomato share common gene repertoires as revealed by deep sequencing of seed and cherry transcripts.</a></div>
  77 <div class="boxsubcontent">
  78 Lin C, Mueller LA, McCarthy J, Crouzillat D, P&eacute;tiard V, Tanksley SD.
  79 Theor Appl Genet. 2005 Nov 5;:1-17.
  80 </div>
  81
  82
  83
  84 <div class="subheading">
  85 <a href="http://www.plantphysiol.org/cgi/content/full/138/3/1310">The SOL Genomics Network: a comparative resource for Solanaceae biology and beyond.</a></div>
  86 <div class="boxsubcontent">
  87 Mueller LA, Solow TH, Taylor N, Skwarecki B, Buels R, Binns J, Lin C, Wright MH, Ahrens R, Wang Y, Herbst EV, Keyder ER, Menda N, Zamir D, Tanksley SD.
  88 Plant Physiol. 2005 Jul;138(3):1310-7.
  89 </div>