docs/r_markdown_docs/index.Rmd

   1 ---
   2 title: "User Manual of Breedbase"
   3 author: "Breedbase team"
   4 date: "`r Sys.Date()`"
   5 knit: "bookdown::render_book"
   6 graphics: yes
   7 colorlinks: yes
   8 fontsize: 12pt
   9 description: "A manual for all things Breedbase. How to create an account, search the database, manage different data types, and analyze data."
  10 url: 'https://solgenomics.github.io/'
  11 github-repo: solgenomics/sgn
  12 cover-image: assets/images/Breedbase_HighRes.png
  13 site: bookdown::bookdown_site
  14 ---
  15
  16 # Introduction {-}
  17
  18 Welcome to the Breedbase manual!
  19
  20 ::: {show-in="html"}
  21 Use the table of contents in the left sidebar to navigate to the topic of your choice.
  22
  23 At any time you can select specific text in the manual to highlight or annotate it using [Hypothesis](https://web.hypothes.is/). Open the Hypothesis sidebar on the right to view existing annotations.
  24
  25 You may also use the widgets at the top of the screen to:
  26
  27 <i class="fa fa-align-justify tab"></i> - collapse the sidebar<br>
  28 <i class="fa fa-search tab"></i> - search for a specfic topic<br>
  29 <i class="fa fa-font tab"></i> - change the font size, font type, or the site theme<br>
  30 <i class="fa fa-file-pdf-o tab"></i> - download the manual as a pdf
  31
  32
  33 Manual as a pdf can be download here also. [<i class="fa fa-file-pdf-o"></i> Download](BreedbaseManual.pdf)
  34 :::
  35
  36 This manual is intended for database users.
  37 If you are a developer looking for software implementation details, please visit the developer wiki instead: https://github.com/solgenomics/sgn/wiki
  38
  39 <!-- ```{js, echo = FALSE}
  40 title=document.getElementById('header');
  41 title.innerHTML = '<center><img src="assets/images/Breedbase_HighRes.png" style="max-width: 50%;" alt="Breedbase Logo"></center>' + title.innerHTML
  42 ``` -->